Ll_transcript_291318

Id TrinityTRINITY_DN49171_c1_g2_i10
Name TranscriptLl_transcript_291318
SequenceCCGATATTATTATTATATTGTACCGGTATTGGGACCGGTTCACCAGTTTACTGGTTGAACCGACCGACACGAATCGGTTTTTACAACATTAGTTTGTTTC CAAATTTGGATAAGACATATATTCAAACTCAATCTTTTCTGGTATGTGATGTATATTAGTCCAATGGTGACTCACAGGAGACCTTTAACAAGGTGAGGAG GAGAGTGGAGAAGAGAATGAGAAAGGATTGGAGCGCATTTTCGGGGTTTAAATTTGGACACTCACAGTTCACCCTCTCACAAATAACCAACTGAGTTGAC TCAAGAGGCACTAGGTCTACATTTCAAGTTGTTAACAAAGCTTGCCATTTCCTTTGCATGTTTACAAAAGAAACACCATTAAAAGCCCATGTGCAGAGCA CCAAAGGGAAGCCAAAAAAGTTGACCTATCCCAAACAAAATCAATAGATGAAAAACAGTCATTGAGATTCCAATTGTTCCTTTCCAACCAAATACACCAA AGGATAGAAAAAAGAGCACTGCCACAGAATTTTGACATCTTTGTGTGTGGCAAAACCTCTTTACTTAATTAGGAGGAAATTGCGCAAGTGCAAAGGGTAT ATCCATGGCTCATCAATCCCATGCAATCTATTCCAAAGCACGTCTGCCGCAGAGCAATGTAAAAAGAGATGAGTCTCGCTTTCAGCATCTAAATGACACA TTAGGAGACAAAGCGATTAGAGGTTTGTGCTTTTGCTTTTGGAGCATGTCTTTGGTGTTAATTCAGTGAAGAATAGTGGAGTAGACAAAAGCTTTAACCC TTGACGGAGCTTTGGACTTCCAAATGGGGTTTTCCAAAGTAAAACTGATTGGGCTGTGAGGAAGTGTCAAGAACTGAAAAAAGGATCTGCATGTGAACAT TCTCAAGGGGTCAAAGTTCCAAATTCTAGCTAATCACTTGTGTGGAGTTTCTTTAGTGTTTAGTAAACTATGTAAAACAATTTCAGAGATCCGTGTTCTG TTGTGGGCAAGACAATTAGGAAAGATTTAAAGATTAATGCTTTGCTAATGGATAGGATTTATAATAGATGATTATGGTGTCATTCGAACCATGTAGCCGA TCCCACCTAGTGGGACTAAGGCTTAGTTGATGTTGTTGTTGTGTTATGTTGTGGGGATTTTCCCCTTGCTATTCCAAATGCAGGGGTTAGTTAAAGAAGT ACATAACAGTTGTGAAATTAAACCAATATAGCTCCCATATCCCTTTTAATGACGACCACGATAATATATTTAAAGAAACCATTTGCTTGGCATGAAATTG AGACCATAGAGGCATGCTTAAGCTGAAACGATAAAACTTTCTGGTTTCATTTAGTGTTCAGCTGCTACCTAATACATTGATCCCTGCTAGCAAATTACAT TTTCCCTAGGTTATTGGTTTCTTCTACTGATATCTGGTTGAAAATGACCATTAATGTCTAGATATTGTTAAAAGCATTGGTGTTATTTCTTCTGTTTTGC TGAATCCTATTATTCTTTTATGCAAAATATTTTCTAGATAGTTTATTGCAAGGCTGCTAAGCTAGCCAATAATAATAGAAGAAAAGGTAACTGCTAGTAT CTCAGCTTCTAAAAGAATGTACAAATGTCTAGGAGTAGAGATTTATTTGGATTTTGAACTAGTAAGGGATCATTTGTGTTAATCACAAAGGTGATGCAAT GGCAACTTACCTTCCTTATAAAGGCTGAGTAGTGAAATCTGCTTCAAAGGAGACTGAATATGATTCTGGAATAAACATGTTTAAAAGAAAAGCCAAAAGG ACTCTAGTGATCAAGTTCTATTATCTACCGCCAGTGCTTGTTCCATATAGACATAATTACATTTCCTTTGGTAAACCCATGGATTTTTGGAGGATGTCCA ATGTGACCAAATAGCCCAAATAGTTGCAAGCATCTTTGTACTTTTCTACGGAAAAAAATATTTTTTGTTCTGTGGATATCTTGTACCTGTTATATCTTCT CTTCATGGGTTTTTAGTTAAATCACAATATATGTCCAATTTGACGGGTTGGCATGCATTGTTGCTTCATTCTGTTACTTGATTTTAATTTTTATGTCACT TTTTGGAGGATGCTTTATCTTCTTCCTTTGTACTTCTCTCTTCACATCTAATAATATTACTTTTATCATAAAAATAACAATATAGTATACAATCTATGCT TCATTGTTAAATTGTGTTAATTAGTTCTATGGTGTGCTTGAAATCCTTAATGATTTGACATTTGATTTTGATGACCATTTATCTGTTAGGTTTGGTTGGC GTGACCAGTCACGGGACAGCATTGGGACAGTATTATGTGTTGACGATGATGGTATCCTCCGTGTTGGGTTTCCTGGAGCATCCAGAGGATGGAAAGCTGA CCCAGCTGAGATGGAACGGGTTGAGGAATTCAATGTTGGAGACTGGGTTCGTATCCGTCCTACTCTAACATCTGCAAAGCATGGTTTAGGTTCTGTGACA CCAGGAAGCATTGGAATTGTATATTGTATCAGACCAGACAGTAGTCTGTTAATAGAACTGAGCTATCTTCCAAACCCATGGCTTTGTGAACCAGAGGAGG TTGAGCATGTTGCTCCTTTTAGGATTGGGGATCGGGTATGTGTGAAGCGGTCTGTTGCAGAACCTAGATATGCTTGGGGTGGTGAGACACATCATAGTGT TGGAAGAATAAGCGAGATTGAGAATGATGGTCTCTTAATAATAGATATACCAAACCGACCCATTCCATGGCAGGCTGATCCATCTGATATGGAGAAGGTG GAGGATTTCAAGGTTGGTGATTGGGTCAGAGTGAAAGCTTCAGTGTCGTCTCCAAAATATGGATGGGAGGATATTACAAGGAACAGTATTGGGATAATTC ATAGTTTGGAGGAGGATGGTGATGTGGGTGTTGCCTTTTGCTTCAGAAGTAAGCCTTTTTCTTGCTCACTAACTGATGTGGAGAAAGCTCCTCCCTTTGA GCTGGGACAAGAAATTCATGTGATGGCATCTGTTACTCAGCCACGACTTGGGTGGTCAAATGAATCACCAGCTACTGTTGGAAAAATAGTGAGAATCGAC ATGGATGGTGCTCTCAATGTGAGGGTCACTGGTAGGCACAGCTTCTGGAAAGTTTCTCCTGGTGATGCAGAACGACTTCCAGGATTTGAAGTTGGTGATT GGGTTCGCTCAAAATCAAGCCTGGGAACCAGACCAAGTTATGACTGGAGTGGTGTTGGGAGAGAAAGTTTAGCTGTTGTGCATAGTGTACAGGATTCTGG ATACCTGGAGTTAGCTGGCTGTTTCCGTAAAGTGAAGTGGATCACCCACTACACTGATGTTGAAAAGGTTCCTAGCTTTAAAGTCGGGCAATATGTTAGG TTCCGAACTGGTTTGGTTGAACCAAGGTGGGGTTGGAGAGGAGCTCAGCCTGAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_167123; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_291318

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_291318
BlastpE3 ubiquitin-protein ligase KEG from Arabidopsis with 81.32% of identity
BlastxE3 ubiquitin-protein ligase KEG from Arabidopsis with 78.64% of identity
EggnogAnkyrin Repeat(COG0666)
KeggLink to kegg annotations (AT5G13530)
CantataDBLink to cantataDB annotations (CNT0002034)
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019437104.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;