Ll_transcript_292792

Id TrinityTRINITY_DN49176_c0_g1_i12
Name TranscriptLl_transcript_292792
SequenceTTGATTCTGGTTTAGGGGCAATTCCTTTAAATTTTATCTTATTTTAATTGCTTAGATACCATTGTCTAACAATAATACATTGATATGAAGTGTTCCTATA AGCACTAGAGTTCATATTTGTATATTTCCTAATATAGCAAAGTAGTTAGTTGACAGTTTTTACAGCCAGCTATAAATAACATAACCTTAAGTGTTTTAGT TACCAATTTCATTTTCTTCAAAAACAGAATAATCCTCTTCTAATCCTCTTCTAAAGATCTTCTTCAGTAAGATAATTCAGGATCCTTTCTTCCATAGGAA CCCCTGTTTCTTATGCATTCAATTCTTCGAGTTCAAGATTCCTAGAATTCTTTCTTCTTCCTTATCATACAGCCATTTATCATGCCTAGTATCGCAGGCG CCTTCGTGCCCTTGCTTCCACAACTACAACTGCACGAATTCAGAAGGGTCTTATTGGATACTGTTGATAAGGTGTATTTGGCAGTAAATAATTTTGACTG TATATAATATTTTGTTTCCTATCTTGTTTGGTCTATTTTAAGTAGTTTGTTATTGTAATTTATTCTCTCCTTAACTTAGAATTTCCTTCCTTGATTCTTG TCAATCACATATTGTATTTTTCTCTATAAAAAGAAGGAATCCCTGTACAGTTTAAGATCATAAATAATATTCCAAATATTTGAATTTGACATCAGAGCAA AGATCACTGCGCCTCTGATTTGCGGTAATGGCTGACAGTTCCTCAACCACCAAAGACTCGCAGCCTCCAAGACATGAGCAAAGAGTTTTTTTCGGTGAAT CCCATTCTGTCCAAATCACCACCTTTCGACTCAATGGGTCGAACTATTTCCGGTGGTACCAATCTGTCCAGATGTATATGCGTGGCAGAGGAAAACTTGG ATACCTCACTGGTGAGCGACCCAAACCAGACACCGATGACCCACATTATGCTGTTTGGGATGCTGAAAACTCCATGGTGATGACGTGGCTGATAAACTCC ATGGAGGAGGACATTAGCAGCAATTACATGGGTTATTCCACAGCCAAAGAGCTATGGGATAGTGTCATGGAAATGTATTATGATCTTAAAAATAAATCTC AGATTTATGAACTCACCTTGCTAGCCAGAGAAATTCGGCAGGGAGGTCATAACGTGACGAAGTATTTCCACTCTTTGAAACGGGTATGGCAGGACCTTGA TCTCTTCAACGCTTATAAGTGGAATTCAGCAGAGGATGCCAAACACCATCACCAGACAGCGGAAGAAGGTAGAATATTTCAATTTCTTGCAGGTCTAAAT GAGGAGCTAGATGATGTTCGTGGCAGGGTCATTGGGAGGACAACCTTACCTTCATTAGGTGAGGTCTTCGCTGAAGTTAGAAGAGAGGAAACCCGTAGAA GTGTGATGATGGGAAAGATCAAATCTGATCCACTTCCTCCTGAGACCAATGCTCTTGTTGTAGAACCTGCTGCCTTTAAGAGTTCAACCAACCAGAAGAA CTTATCAAATCTTTGGTGTGACTACTGCATTAAACCACGTCATACCCGAGAGAATTACTAGAGAATTCATGGCAAACCAGCACATCTAAAGGGCAACAAA TCTGGTCCTAAAGTTCACAAGCCCTTCCCTATAACTCATGAGGCAGAAAAGACCTCATTGAGAAAGGAACAAGTTGAGGAACTTATAAGGTTGTTAAACT CTAATTTTTATCTGGTACTCCTAGTGGTTATGTGGCACAAACAGGTAATTTAAGTACCCCTAGCTCCCTCAACTGTACCTCAAATATGTGTGTACCATGG ATCATTGATTCAGGTGCTTCGGATCATATGATCTGTCTTTCTTCTTTATTTAAAACTTATTCTCCTAGTTCTGGAAATGAAAAAATTAGAATTGCAGATA GTAGTTTTCTGTAATTGAAGGGAAAGGGAAAATTACCTTATCTAAAACCATTGAATTAAAAAATGTTTTACATGTACCCAAACTTTCCTATAATCTTCTC CCAGTTAGCAAAATCTGCTACGATTCCAATTGTAGTGTAAAATTCTTTGACACTCGTTGTGTTTTTCAGGACCAGATTTTGGGGAAGATGATTGGCAGTG CTAAGATGATGGATGAACTTTATTACTTTGAGGATACTTTCGAAAATAAAGAAGCTCAGGGCCTTAGTGGTATGAGTTCCACCCCTGTTAAAGACCGAAT AATGCTCTGGCATAACAGACTAGGGCACCCAAATTTTCAATATCTCATGCATTTGTTTCCGGATTTATTCAAAAATATTGATTGTTCTTCTCTTAAATGT GAAAGTTGTGTTCTTGCTAAAAATCAGAGAGCTCCTTATTACTCTCAACCTTATCATGCATCTAGACCTTTTTATTTAATCCATAGTGATGTTTGGGGTC CTTCAAAAATAACAACTCAATTTGGAAAAAGGTGGTTTGTAACTTTTATTGATGACCACACCCGGTTATGTTGGATCTACCTTATGCATGATAAATCTGA AGTTCCAAATATTTTTAAAAGTTTTTCACAAATGGTAGAAACTCAATTTGACACAAAAATCTCCATTTTGAGGAGTGGCAATGGACTTGAATATTTTAAT AAGAATCTCAATGAGTTTCTCAAAAATAAAGGCATTCAACATCAATCGACATGTCCAAATACTCCTCAACAAAATGGCATTGCTAAAAGAAAAAATAAAC ATCTCCTAGAAGTAGCTCGTGCCATTATGTTTGAGAGTAATCTTCCAAAGTATTTTGGGGGGATGCTGTCCTAACAGCAGCCTATCTCATCAACAAAATG CCCACTAGTGTGTTAAATTATCGCACACCTTTGGACACTTTCAAAACCATTTTGCCAACATGTCGATTACATACTGATATGCCTTTAAAAGTGTTTGGTT GTACTGTTGTTATCACTACACCCTCCGCATCTCGGTCTAAACTAGACCCAAGGGCAGAAAAATGCATTTTTGTTGGATATTCTCCAAGCCAAAAAGGATA TAGAGTCTTTAATCCGATTATGATGAAGCTTTGTGTTAGCATGGATGTTACCTTCTTAGAACATCAACCTTTTTTTCAAATAAATTCTCTTCAGGGGGAG AATGATATTGTGAGTGAAGACAATTTCTTAATTTTTTTACATTTGCATGAACCATTGCCCATTCCTATTTTACATACCGAGAATACAGATTTAATTGATA AAACAAGTGTGGAAGAACATGTGGAAACTAGTCCTAAAATTTCTAAAGAAAATCTTATGTCAGACTTAGATGGATCCCGAGCAGGGAAAGAAATACCACA ATCAAAAGAGGAGTTTCGTGTTTATACTCGGAAATATCCTAAAAGGATCAAAGACCAATCCATCATCTCTGCACCAAACCAACCAGCAATCCCGGAAGAA GGCCAAGAAGGAATACCACGAGAAATTCAAGGTAACACTGAAATTCCCACTTCTAATATTGAACTGCCCATAGCTATTAGGAAAGGAACTAGAACCTGCA CCCAAAAATTAAAAAAACCTAGCACAAGTCATCCCATTTCCCAATATATTTCCTACCAAAATCTGTCTCAAAGTCACAAGGCCTTTACCTCAAAAATAAC AAACATGTTTGTGCCTAGAAACATTAAGGAGGCATTAGATGATCCTAATTGGAGTTTAGCAGTCTTAGAAGAGTTTCAGCACTAAAAAAGAATGGAACTT GGGAGATTGTTGACCTGCCTCGTGAAAAAAAACAGGTGGGGTGTAAGTGGGTATTTACCATTAAGTGCAAGGCTGATGGAAGTATAGAAAGGTACTAGGC TAGATTGGTAGCAAAGAGATTTACTCAAATTTACGGAGTAGACTATCACGAAACGTTTGCTCCAGTCGCTAAACTTAATTCTGTTCGGATTCTTCTATCT CTTGCTACGAATTTTAATTGGCCTTTACATCAATTGGATGTAAAAAATGCTTTCTTCAATGGGAAACTAGAGGAATAAGTGTTTGAGTCTTCCCCCCGGA TTTGAAGAAGAACTTGGAAGAAATAAGGTGTGTAAACTAAAGAAATCATTATATGGGCTGAAGCAATCTCCAAGGACAAAGTTTGAGAGGTTTGGAACAG TGGTAAAAAGACTTGGATATATCCAAAGCCAAGCTGATCACACATTGTTTTATAAACATTCAGCAAATAATAAGATTGCTATCTTGATTGTATATGTTGA TGATATTATTTTGACAGGAGATGATAGCTTGGAACTCAAAAGTTTGAGGGAAAAACTTGCTAAAGTTTTTGAAATCAAGGAACTTGGTCCATTGAAATAC TTTCTTGGAATTGAATTTTCAAGATCAAAAGAAGGTATCTTTATGAACCAACGAAAATATATTCTAGATCTTTTAAAAGAAACAGGATTACCTGGATGCA AAGCTGCAGAAACACCTATGGAACCTAACTTAAAGCTGCAACAAGCTGAAACAGAAAATCTGGTGGACAAAGGAACGTATCAGCGACTAGTGGGAAGGCT AATATACCTACCTCACACTCTTCCAGACATAGCATTTGCTGTAAGCATGGTAAGCCAGTTTATGCATGCACCAGGTCATGAACACTTAGAGGCAGTTTTT AGGATCCTAAGATACTTGAAGGGATCACCTGGAAAGGGACTACTTTATAAAAACCATGACACTTTTAGGTAGAAGCCTACACTGATGCAGATTGGGTTGG GAGTGTGACAGACCGAAGATCAACATCAGGCTATTGCACTTTTGTTGGAGGAAACTTGGTTAGTTGGAGAAGCAAAAAACAGAACGTGGTAGCAAGGAGT AGTGCAGAAGCTGGATTTAGAGCAGTTGCTCATGGAATTTGTGAGGCAATATGGGTGGAAAAACTGTTAAAGGAATTAAAGGTTTACAATTCTCCTCCAA TAAAGCTATATTGTGATAACAAGTCTGCAATATCTATTGCACGCAACCCAGTCCTACATGACAGGACCAAGCATATAGAAGTTGATAAACACTTCATCAA GGAGAAGATAGAAAGGGGGCAGATATGTATTACATATGTTCCCACTGCAGAACAATTAGCAGACGTCCTAACTAAAGGATTACCCAAGAAATCCTTTGAC AACATAACTAGCAAGCTGTCTATGGAGGATATCTTCAAGCCAACTTGAGAGGGAATGTTGACAAGGTGTATTTGGCAGTAAATAATTCTGACTATATATA ATATTTTGTTTCCTATCTTGTTTGGTCTATTTTAAGTAGTTTGGTATTGTAATTTATTCTCTTCTTAACGTATGATTTCCTTCCTTGATTCTAGTATCAC ATATTGTATTTTCCTCTATAAAAAGAAGGAATCCCTGTACAGTTTAAGATCATAAATAATATTCCAAATATTTCAATTCATACGTATACATTGTTGTTGA TCCTATCCAAGGTATTCAATTTACTACTTTACACCTTTGTGCGTGTTATGAAATTTTATACTCTATGGTTGTGTTTTGAGTCATTTGGTAGATGAAGCAA TTTTGATTACTTGAAAATTGGGTTTCAGTTGGAGGATGTGATGTTTATGTTAGAACACTTCTGAATGAACTTGTGAGAGTGGTATTTCTTTTTCTTGGCT GGTATTTCTTCCAATACCAGCAATGCCTTTTAAATAGGCCCGAGATACCATTATTTTTTGAATTGTTATCATGTGAAGGCAGCTTCAGAAAGGGACTTTC GACCAAGTAGGATGGCTGTTATTGGGAAACAGGTTGAGACATTTATCAGGGAGTTCTTTGATCAAAATCCACTTAGTCATGTTGGTCTGGTGACTATAAA AGATGGAATTGCTCATTCCTTAACAGAGCTTGGTGGCAGTCCTGAATCCCACATCAAAGCTTTGATGGGTAAACTGGAATGCTCTGGTGATGCCTCCCTA CAAGATGCACTAGAGCTTGTTCTTGGTTCTCTAAATCAAATTCCATCGTATGGTCATCGAGAAGTTCTGATCTTATATTCAGCTCTCAGTACATGTGATC CTGGTGATCTCATGGAAACCATCCAGAAATGCAAAAAGAGTAAAATAAGGTGCTCTGTCATTGGTCTTGCTGCTGAAATGTTTATTTGCAAACACCTCTG CCAAGAAACTGGAGGAACTTATTATGTTGCACTAGATGAGACCCACTTTAAAGAGTTAATTCTTGAGCATGCACCACCACCTCCAGCAATATCTGAGTAT GCTACTGCTAATTTAATTAAGATGGGCTTTCCACAAAGAGCAGCTGAGGGTTCTGTCGCAATTTGTACATGCCACGAAGAGGCTAAAACTGGAGGGGGGT ACACTTGTCCAAGATGTAAAGTTCGTGTCTGTGAGCTTCCCACTCAATGTCGCATCTGTGGATTGACCCTTATTTCTTCACCCCATTTAGCAAGGTCATA TCATCATCTTTTTCCTATAGTGCCATTTGATGAGGTCTCTCCATCATCTCAAAATGATCCACATAACAGTTTACTGAACACTTGTTTTGGTTGTCAACAA AGTCTTCATACTCAGGGTAAGTTCTTGTAGATAGGTAGTCGAGGTTGAGTTCTTTATACACTTGCAATTTTGACATTGTATAATTTTATCATCTTGGCCA ACATTTTCTGTCAAATATAGATTCATACCACACAGCTTTAAGGGCAAAATATTAGCAGATAGCAAATAGATCTGTAATTTCTTAAGTTGTTCCTTCATTT TTATTCTCCAGATACTATATAGAAAGTTCATAAATTGGTAATGGATGTAATTTCAGGTGGTTTCTCCTGTATTCAACTTTATTTATTTAGTAATTCTCAT GTTTAAAAGGATCTAGCCATAGTAAAAGAGATTAGCAATAGTTGTATTAGGAGATAAAGTTGGATTTCAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_167143; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_292792

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_292792
BlastpGeneral transcription factor IIH subunit 2 from Arabidopsis with 76.75% of identity
BlastxGeneral transcription factor IIH subunit 2 from Arabidopsis with 74.83% of identity
EggnogTranscription factor(COG5151)
KeggLink to kegg annotations (AT1G05055)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019437076.1)
PfamSsl1-like (PF04056.13)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;