| Id Trinity | TRINITY_DN49188_c5_g1_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_291146 |
| Sequence | AGCATTAGGATTAGTTGGAGAACTTTGATGACTACTTTTGTTGAAAGAGAGAGTGTCTTTTTGATGAAGCCACCATTTGACACCAAACCAATACTATTCT CTCTGTATCTGTCATCACAAGCCATCCCCTAATCAAACCTCTCCACACCTATAACATAATAATCTCTTTCTTTTTCTTCCTTTTTCATTTTCCAATATTC ACCAAACAATAAAGACAACACAACCCATCCAACCATCTTTCACCACAATCACTTCACACCCTTTTCTTTTTACCATAAAAAGTATAAAACTTTACCTTCA AATTCATCACCCATTTCCATTAATTTCTTCAACTACTACTACACCATGCACATGATGCAAGGTTCTTCTTCTTCTTCCATGTACTCAACTCTTTCTAAAG ATGATAACTTTGTCTTCTCCTCTGAGGATTCTTCATGCCCAGATGACTCTAACCTTCATTTGGGTCTTGGATTAACCCTTTCTCCTTCTCCAATTCCTCC ACATGCTAAAATTTTCACTGCTAAGGATTTCCCTTCTCCCTCAGCTTCTTCTTCTTCTTCATCATCTTCTTCTTTAAATATAAAGAGTAATGTTACTTCT GGGAATAAGAGACCTGCTGATTCTGTTGTCTCCACCAACGGTTCCAGGTAAATCATTTTTTCTTCATCATTTCACTTTTGTTTCTTTTAATTGTTGGCTA GCATGTTATGTATGATATAAAAGAATTGACTTGTTTTCTTATGCTAATTAATGTTTAATTGTATTTATGCTTTCCAATTTAGTATTTATTTATGCCTGCT CCATGTGTGATCTTGATTTACTTTATGATGTTATAATAGTTGACATGACTTTTGAGGAGAAAATTTGTTGTAAATTAATTGCCTTGAATTTAACTAAACT AATGGTGTTAGAACATCAAGTAATTGATATTTGATCCAGTGATATATACAATCTAAAACTTAGAACTCAGCTTAGGTGTTAAAAAATGGAAGTTCTAAGT ACGTATTAACTATGGCATTTTTCATCTGGCCAGTAGGTCATGTAAATTTGAATCCCTTTATTTGCTTAACATAAGTAAAGCAAGAAATCAACTTATGCTG TTGAAATTATCCACTTGGAATATGAAGTATGCAGACCTATTATTTTGCATCAGTAATTTTCTTGCTTCTAGCCGACCCTACCTACTGGGACTAAGGCTTG ATTGATTGTTGGTAGTAATTTTATAGTTTTTAAATTTAGTAATTTTAATTTATTCCATAAGAAAGGGTTTACTATTAATTTTGTTAGAATTTGATTCTCT TCGAGAAGTGATAAACAGTTAAACACTTCAAACAAAATCAAAACAGAAAGAAAAACAAATAGAAAGTAGAAGAAGAATGCAACTTTCTTTTATTGAATTG AAGGAACTAAAAATCATGTTTACAATGAATAACAAAGGGTTATTTTTACAAAATACAAAGTAACTAACTTTATAACTTATGTACATGTGCCACAATTCAA CTAGCTAAGTTTTACATAGATTGCTTGTAACACACACAAACTGTTCTGCGTCGCATATGCTCACTGCCATGGCCTGCTGTCTTGGCCTCTGGCCTGAGTA TTATGACTCCTGGCACGGGTCCTGGCCCACTGCGTCCTGGTATCTGGATCGGCCATGTGACCTACTTGGCACAGTCACTTAGTACGTCATCTCGGTCACT AGCTTGCTATCTAGCATGGTGAGTTGGTCTGCTGGCTTAATCCTTGGCTCGGCCAGCTGGTGCATTGCCTGGCATGACGGTTCGGTCATTTGGCTAGATT GCTTAGCAGTTAGCACAACATCTTGGCAAGGTGTGGCACATGGTTTGGCACGGACTGGCCTGCTATTGGCTTGGGATTTCTGATCTTCATTCCTGGGTAA TAAATTTCTCAACAAGAATTTTGCTATGTGCTATGCACTTTGTCTCATTTTCTGATGTTTACTGTTCTATCTTCTCTCAATGATGCCCTCAGTGTATTAC CCTCTCTAGAAGAAACAGAACTAACCAAATATTTATCAATTCTATTCACATTTCTTTACTGAATGGTTTGTCATTTGTGTTGTAACTGAATTTTTCAGAC AGGTGGTTGGATGGCCTCCCCTTAGAACATATAGAATGAATAGCCTTAATAACAATTCAAAATTACCAGATGCTGAAGTAATCAAATCTATGGTTGACAA AAGTAAGAGCAATATTGCTGTGGAAAGTAGCTGTGATAAAAGCATTATTGCCAAAGAAAAAGAAAACCTCAGGAGTTCCTTGTTTGTGAAGGTAAATAAG GATGGTACGCCAATTGGAAGGAAGGTTGACTTGAGTGCTCATAGTTCCTACGAAACCTTAGCTCGAACCTTGGAGGATATGTTTAACGAACCAACTACGG TCACCACTGGCAAAGGTAAGTTTTCCTTGCTCTTTATACTCATAAGGAAGAAAATGCTACTCATGTATGCGTGATTGTCTGTTGTCAAAAAAAGTACATA TGAAGATTAATAATTTAAAATTTACAAGTTACCAGCATATCCAGATTACTTTATCTATTTGGCTGTAGTATGGATTAAACTTTTCTTTTTCGCTTCATTT TCTTTCTCATAATTTCAAGAATAGATTAGTTCCTATATATCAAAGACTAGCTGGTAATGTCTTTTCAATGAGTCTGATTCCTTTTTCTCTCCTTAATATT GATATCATCGTCAATAGGATCAAATGGAGAGGGTCATGGCATTACCGCTGGAACGGATGGGCAATCAAAATTGTTGGATGGATCTTCCAATTTTGTGCTC ACTTACGAAGACGGGGAAGGGGACTGGATGCTTGTTGGAGATGTTCCTTGGTGGTAAGTATTTGATTCATAATGATCAACTTGTTTAATGTCGAACTTAT CTTCCTTTGCAACGATATCATTGATGTTGCACTAAATTTTTCATTTGAGGATTGAATTTTCTTTACCTGTTGATTTTCAAAGAGTACATGGATTGTTTAA TTTGGTCAGACAAATATGAGATTGTAGTATTTGTGTTACATTTGACACTCCATTTGTTTCAGAAATTACACTGACTTCCCTTGAGGATTAAATAGTCATT ACACTTACTCCTTTGAAGTTTATGTTGTCATTGCATTTATTCCCTGTACAACATAAATTTGAAGGGAGGCCATTATAATTTCTAAAATAAGAGAAATACC GAATATCATTACGTCAAACTTAAAAGGAAAATCAATGTAATTTCCCTGTTATCGAATGATGTAATTGTATATCTCACAGCTGCCATCGTCATTTTGGCCT TTGATGACCCAGAATTCAATCTGAGTTAACTGATACCAGAGTGTAGCTGCAAGAGAAAAAGCATAATTATATAATAATTTGTCACTGATTCCAAAGTTTA TATTAATACCCCAATGACAAAAACTTAGGTACAATTCTTGGATGTTTGTGGTGTTATTTTCCAAAAAAAACAATTATTGTTACATATGTTATGTTTTCAT CGATCATGTTATACTTTTAACGGAGAACAATACCACTGACACCTAAGGAATTGTGCTTTAAGTTTCTCCATTTTGGTCTCCGGGAGCTTCGCTGAAACTT TTAAGGACCGTGCCTTTTTCCCTGAATAAGAAAAATATTAATAATAACTTTACCAGAACAAGAAATCCTATGGTTTGAGAATTGCAATTGGTACATGTAT TTTCATTGTAGCTAGTAGATATTAGCTGCATTAACATTGGACCTATTTTTTTATATGGTTTGATATTTATATACTTTTCTCCTTGAAATTGCAATCAGGA TGTTCCTTAGCTCTGTAAGAAGGCTAAGAATCATGAAAACATGTGAGACTAATGGACTTGGTAAGCAAACAAGTTATTATTCATAGACATATTTTTTTTT TTTTTTTTTTTACACGTGACATTCCCCTTGCTCATCTTTTCAAAGCTTCCGTCGGACTTGGTTCCTCTACCG BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_167230; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_291146
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Auxin-responsive protein IAA11 from Arabidopsis with 45.92% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019426443.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |