Id Trinity | TRINITY_DN49202_c0_g1_i2 |
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Name Transcript | Ll_transcript_467569 |
Sequence | CTAAGTTGTAAAATTCAAAAGGCACACCCACCCACATTGGTCAAAAAACTAACACTTCCTTCTCTTTCACGTCTCTTTCATTGATGGCTGGTTGAGCAGA AACAAAGAAAAAAGGATCACATTTGAATTCTCGTCAAAATACTGTTCGTTTATTTGGAATTTGTGTGGCACCACTTATTTCTTCAACCTATTCCATCAAC ATCTACTCTCTCTATCTCTCTTCCTAGGTATCTGTTTTTTCGATCTTTGTCTATGTTTCTCTTACCTTAGTTGCTCTTCCTTCTTTCTCTTTTATGGCCA CCTCTTTCTGCTTTAAAATTGGGTTTGTTCATACCAAAGGTGAGGAAGGTGACACTTGGAAAGAGATGGCTCAGAAGGAAAGAGTTATGCCAAATTGTGT ATATGCTTGTAATCCATATCATGAATGCACAGAATTTTGCTTGCAGAAGAGCAAGGATACCAAGCCCACTAAAACTAAAAAGGGTGCAGGTTAGGGGTCA ATATTCCTGCTTTCTCTGTGTATGTACATGTATATAACTCTGTTGTGTGAATCATAACATCATTTCTGCATTAATAGTTGCCAACCCTGAAAAAACAATT TCTCCTTAAGGATTTTAGTTAGAAATATGTATCCCTTTTAAGTTTTAACTGATGTAAAAAGGCTTGGCACCCTTTTTGATATGTTTTAAACCAAATTTAA GAATCACTTATTTAGTGCTATCAATTGTAACTGCTGTAAGTAGCTGTTCTTTTGTGCCTGTTTTCATTTTTACTTTTATTCTTATTTTTTATTTTGAAAT GCTCAAACTGTTCTGGTTTTTTCATACACTTTGAGCTCTGCTTGAAATTGCTGATAATTTATTTGCATTTCGTAATTGATATTATATAAAAATACTCTAA TGGTTCAAATTCAGCCAATATATCTGGAGTGTGTAGTTAACAATCTTTGAACACATGTACAATCTGTCTTTTTTTGTCTTTTTGTTCAAAGATTATCGGA GAAGTGTTACAGATGATGATCTTGGCAAAAAGGTGAATGGAGAAAAACACACACACACAGGTTGCCCTAAAGCATCTAATCCTTACCATGTCTGTAATGA ACATTGCAACAAAAGAATGTCAGGAGCTGATTCAGGTTTACCCCTTTTTAGTCTTCTATTTAAGGATATCAATGTTCTAAAGTTCAGTATTATTGCTGCT CATTGTTATATAAACATTTAACCAGTTATACTTGTGTCTTCTTGTAGTAAGTTTCTTCAATGGCTAAGACTCTTACAGTAGCAACATTTATCTTAGTTTA TTTGATCGAATATATTTTTACCAAAAAAATCTTCCACACTATAAAAAAAGGCCAAGTGGATTTTAATAAATTAGAATTATCTCAAAGTGGATCTAAGCAA TATTTCTGGTTTTATTTTTAGTGTAGTACAATATGTTGCCACTTCTTCCATTTTCTATATGCCATGTAGACTAACCTCTTTGATCATATGAAACTAGCAT GGGTATATGCCATGTTTAATGTTTGAAAATAATCTGGTATCGTTTGATTAATCGTCTTTAATAAAACATTTTATCTGTCTATCTCATAGGTCCATACTAT CTGTGTAATTGGTTTGCTAAGTTCACAGGTATATGTTAAATGGTCCATGAGTGAAGAGATGACCGTGCCTTAAAGCATAAACTGTGTTTGGTTAATAAAG TTGGTAGCATGACTTGTCTGCTTCTTTGTTTGATTAGTTTAAAAAATATTACTTTGTTGCGATAAGCAGATCATTGATATACTGAGAGAACTTTCACACA CTATCAATATGTTTCTGACTACAATTCAAATTGCAGGTACATTGCCGCTTGGCAGGAGAAAGAAACCAGGTCCTAAGCCAGAACTCCCTATTCTTGACAG TGTTCCAGCCTCAAAAATTGGGGCCATTTATCTATCTGATGCTTCATCACCATTATCAAAGTATTCTGAAGTGAAAAAAGTGGAGCCAAAGCAAAGTGAG ATAATACCAGTTTCTGGAGAAATACATATTCAAGATATCAAGCTTGTTAATCGCAAAGTCCTACCAAACAAGGATGATGCTGAGTATGTTGCTGCCAACC CAATAGGAATAAAGCATGAAGGGGACAAAAATTCTTCAACTAAAGTTGTTCCAATCCCCAATGTTTATGGCACAGGAGGTTTCATTACATCAGCTGTTGG GTCCATGGACTTCAATTCATCCGACATCTCCAATGATAATGACGAAAGTGATGGAGAGGAGACCGGGTCGATGGTTTCCGAGTCTCGTGTTCCTGTTGGA AGTTATCATGTGAAAGAAAGCTTTGTTCCCATCTTGATGTCCATCTTTAACAAGCATGGAGATATAGGAGCAAGCTGCCACTTGGAATCCGTTGTCATGC GTTCTTATTACATAGAATGTGTGTGCTTTGTGGTCCAAGAGTTGCAATCAACCTCAATACTGCACCTAACAAAGTCCAATGTCAAAGAATTGTTGGCAAT TCTTAAAGATGTAGAATCTGCTCAACTTAATGTAGCCTGGTTGCGTAGCATACTCGACGGAATTGCTGAGAACATTGATTTCATCAATCAACACCGGGCC GCAGAGGTGGCAAAGGCTAACCATGATCAAGAAATTGAACAACTGAGGAAAGTGCTGGATTCAGAACTGGGAAGTTTGGTTCAGAAAGAACAAGAGGTAA CTGATACTAAAACAAGAATTGAAGAAATTAAGGAACGTTTGGACCAGCTTGCGCTGAAGTCTTCTGATCTGGACAAGAATCTGTTGTATATCAAGTCCAA GGTTGATAAATCGGATAGCAAATCCATACTGAATGAACTATTTTAATGCAAGTGCTTAGCCAATTTGTCTCTGAAGTGCACATTTAATACTGTGGCAATG CTTAACAAGTAGAGTATGCTGCTGAATAAAATGAAACATGAGCTATTGTTTCAAGATAGGCAGTTTTATAAATGCATGTTACACCCTACATACATGTACC CTCACCATTGTACTTGAGGTATTCATATTTAATTATTTTATTTATCAGCAATATTGAGTTTATGGTATTGCTGACTTTCGTTCATCACAGAGAATTTAAT ATCTCTGTATACAAAGTTACAAACACTTTGTTTTCTCAGCTAGTGTTTAATGATAAATATTATGTTTGATAGAAACTTTTTTCCTTAATTTATAGACACT GGTTAACATCATAAGAGCTATTTATTTCTAATGATAGAACAACATTGAATAGAG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_167363; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_467569
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019428192.1) |
Pfam | Arabidopsis phospholipase-like protein (PEARLI 4) (PF05278.11) |
Rfam | - |
GO | - |