Id Trinity | TRINITY_DN49202_c0_g1_i6 |
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Name Transcript | Ll_transcript_467576 |
Sequence | CTAAGTTGTAAAATTCAAAAGGCACACCCACCCACATTGGTCAAAAAACTAACACTTCCTTCTCTTTCACGTCTCTTTCATTGATGGCTGGTTGAGCAGA AACAAAGAAAAAAGGATCACATTTGAATTCTCGTCAAAATACTGTTCGTTTATTTGGAATTTGTGTGGCACCACTTATTTCTTCAACCTATTCCATCAAC ATCTACTCTCTCTATCTCTCTTCCTAGTTAAAATTGGGTTTGTTCATACCAAAGGTGAGGAAGGTGACACTTGGAAAGAGATGGCTCAGAAGGAAAGAGT TATGCCAAATTGTGTATATGCTTGTAATCCATATCATGAATGCACAGAATTTTGCTTGCAGAAGAGCAAGGATACCAAGCCCACTAAAACTAAAAAGGGT GCAGGTTAGGGGTCAATATTCCTGCTTTCTCTGTGTATGTACATGTATATAACTCTGTTGTGTGAATCATAACATCATTTCTGCATTAATAGTTGCCAAC CCTGAAAAAACAATTTCTCCTTAAGGATTTTAGTTAGAAATATGTATCCCTTTTAAGTTTTAACTGATGTAAAAAGGCTTGGCACCCTTTTTGATATGTT TTAAACCAAATTTAAGAATCACTTATTTAGTGCTATCAATTGTAACTGCTGTAAGTAGCTGTTCTTTTGTGCCTGTTTTCATTTTTACTTTTATTCTTAT TTTTTATTTTGAAATGCTCAAACTGTTCTGGTTTTTTCATACACTTTGAGCTCTGCTTGAAATTGCTGATAATTTATTTGCATTTCGTAATTGATATTAT ATAAAAATACTCTAATGGTTCAAATTCAGCCAATATATCTGGAGTGTGTAGTTAACAATCTTTGAACACATGTACAATCTGTCTTTTTTTGTCTTTTTGT 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Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_167363; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_467576
Blastp | Tetraspanin-8 from Arabidopsis with 59.7% of identity |
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Blastx | Tetraspanin-8 from Arabidopsis with 59.7% of identity |
Eggnog | senescence-associated protein(ENOG410XRN9) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G23810) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019453824.1) |
Pfam | Tetraspanin family (PF00335.19) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |