| Id Trinity | TRINITY_DN49202_c0_g1_i7 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_467577 |
| Sequence | CCGAGAATTTATCGGCTCTTCAGGTATTTTTTTTTTCAATTTCTATTTTTGAATTTGAATTTGCAAGTATATCTTAATTTTTTCTTCGTTTTTTTTGGAT CTGGCTCTTGATCTATGAAATTTTACTAAACTACCTTGTAGATTTGATACTATTTTAGCTGATTCTACGATTTTATAGCAGATCTGGTTTTGATTTCGAG TTCTGTTTTGCTCAAGGGTTTAGTTTTGACTTAAAATGAAATATTATCCCCTTGTGGCCGACACTCGCAACAAGTGTGTTAGCAGGAATCAAACCCTCAA CCTTGAGCATCCAGTAAACCTTACACCATTTGACCAACAACTTGTTGATAATATCTCATGTTTAAATTTAGGAATCTTCGTTCTTTCTGAGAATGAATTT CATTTTAATAAAATAAAATTCCGGGAATAATTATTGATCATCCTATTATCTAGCTTATAAATCGTCCAAAATTAAATATTTTCCCTACTTATTTGAATCT ATAAATAATAATCGTATGTACTGAATTGAATATATATTCACTTCTCAAAGATATTGAATATATGTTATTTAGTTGGAAAAGGGTTTGTAGAATAAATTCA CAAAGATATTAAAAATACCTTTTTGAAAGATGGTATTTTTATCTTGGATTTGCGTCCTTCTGAAAAAGTCTGTTTTCTTTTTCTATAAGTCTCTTTCCCA ACGCATTTTTGTTAGACTTTTAGAACTCTTTTCATCCATTTTTTAATAGCTCATGGGTGCTCCTGCCACTACTCTGTTGCTGCCGGCTAAAAGTTAATTA TCTTTTATTGCTCTTGGCCAAGCATGTTTTCTCTGTCAAATAAATAATAATCCTTCATCCTTGTCGCATTAGTATATAGGATTTAATATTTATGCATTCT TAAAATACATCATATGTCATGTATCATTATCATTATAATTGACTCCTTCAAAAAAATAAAAGTAAAAACATTGTATAATATTAATCTCTAGTATATAACT ATTTCTCTTTCTATTTATTGGTTTTGAATTTTTGTATGGAGTTTACTAGTGATTAAATTAAACCAGCATCATTATCTTTAGGTTAATTATATTCATAAAA TTTGGTGTTTAATATAACACTCACATTCCCTAAAGGAAATTAGAGTAGTGTATATGTACAAGTTGTTGTCAAATGATGAGTAATTTGTGTAGTTTCATTA AATATGTATCATTGTAATTTACTCTTATTAACACATAATTAGTATATATATATATATATATTTTAAATACAATTTATTATGATAATTAGAAAATAAAAAC CTATGATGTTCCTTTAATGTTTGTAGAAAACTTTTCCTTTATGTTTGATTCTAGAATGATAGATGTATTTGTTCTTTACATTTCCAGTTTGCACCTTATT TTTGTTACCTGACTTTTTTTCTGCTTCTGCTTTGTAAATTTTAGTCCCCTTATGAATGTCAATGTTTTGGATTTATAATGCAGTCTGGATGCTGTAAGCC TTCAACCGACTGTGGTTTCACCTATCAGAGTCCAACTAGCTGGACCAAAACAGGAAATGCAACTTATACAAACCCAGATTGTGATTCTTGGAACAACGAT CCCAACCTTCTGTGCTACAATTGCCAATCTTGCAAGGCTGGTTTACTGCAAAACATTAAGAGTGATTGGAAGAAGGTGGCTATTGTCAACATCATATTCC TTGTCTTCCTCATTATTGTCTACTCCATTGGTTGCTGTGCATTCAGGAATAACAGGACGAACAACTATTATAAGGGATATTAGTGTGTAATTAGATTCAG TATTATTACCATGTTGATGAGTAGTGTCATTTGATTTATATGTTTCAGATGCTGGATTTTATACTGCTTTCACTACTGTCTGTTATCTTCATTGTAAATT TGCACAATTTTATGATGCACTTTGCTAACATATGTAGCTGTATCTCTATTGTCTTGATCACATCTTCTACTCCTACTCCCAGTTTCTCCACTTGTGTTGT TGTTGATGATTCTGATGAACTTTGTTGGCTAACAAACTACTTTGGACACATTGCATTTCATTCTGTAAACTTGTTTTTTGTGTTAATAATTCAAATTATG TATACACCAGCACAAAATATCATTCTTTCTCATTTGTGTTTGCGATCAAATTATTGATTTCTGATCTCATTTGTATTTGTGGTTCAAAATATTATTATGT TCCTCTTCCATTAGAGTTGGGACTGCAGGATCACACATGGATTTGATTGGCCAGCTAAGTTTTTTCATCTCTCCTTTTGAGATAGTTCATCTGGATTCTC CCCTCTTATTAACAAAAATAAAAGTTGTTGAAGATTATTATATTGCATAAAAGCGTATAACCTTTCCATAATTTTTTTAGCATTATCTTGCACATAATTC TTGAATGCTTCAAATGGTCTTGCATTTATAATTGTTGTGCCCAGATTGCAGCTTTATTTACATAAGACCAGCTATGTATTTGTCCGCACAATTTCAATCC ATCCATTGAACGGTTAGTTCTGAAACTTCTACAATAGTAAGTGGCCATTATTCAACCCAAAAACATTCCAAACGGCCAATTCTGGACGTTCTATAATTAG CAGCTTTGTATATCTATACATAAACCATGAGAAATTCAATTCTGCTTCTCTGCAACTTCCTTCCTCTCCTGGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGCTGTCCTTC TCAACAGCCAAAACCAAAATAAACCAAAACCCACCCCATTAGACCATTTGACATCATCATAAGATGGTTCGGTGCAGCAACAGCTTGATTGGTATACTGA ATTTCTTGACCTTCCTTCTTTCCATTCCCATCCTGCTTACCGGTATATGGCTCAGCAAGCAAGCCCACACCGAATGTGATCGATGGCTCGAAATACCCAT CATTGCATTCGGCGTCTTTCTGTTAGTTATTTCCCTTGCTGGCCTGATTGGAGCATGTTGCCATGTCAGGTGGCTCCTATGGTTATACCTGGTGGTCATG TTCATGCTCATCTTGATCCTCTCTGCATTCAGCATCTTCATTTTTGTTGTGACCATCAAAGGCGATGGGGAGGAGCTTTCAGGTAAAGGGTACAAGGAGT ATAGGCTTGGCAATTACTCCATCACGTTGCAGAATAGAGTCAATAACCCAGCTGCATGGAACAGGATGAAGAGTTGTTTGCAGTCTAGTCAAATCTGCTC CCAATTCCATAAACAATATGTCAATGACAATGTTGACCAGTTCTACAACGAAAAGTTATCAGCCCTTCAGTCTGGATGTTGTAAGCCATCAAATGACTGT GGTTTCACCTATCAGAGCCCAACCAGATGGACTAAAACAGGAAATCTTTCTCATACCAACCCTGATTGTGATTCTTGGAGTAATGATCCAAACATTATGT GCTTCAATTGTCAATCTTGCAAGGCTGCCTTACTCCAAAACACTAAGACTGATTGGAGGAAAGTGTCTCTTGTCAATGCCATAATCCTCATCTTGCTCAG TATTGTTTACTCCATTGGTTGCTGTGCATT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_167363; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_467577
| Blastp | Tetraspanin-8 from Arabidopsis with 59.61% of identity |
|---|---|
| Blastx | Tetraspanin-8 from Arabidopsis with 59.61% of identity |
| Eggnog | senescence-associated protein(ENOG410XRN9) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT2G23810) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019453824.1) |
| Pfam | Tetraspanin family (PF00335.19) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |