Ll_transcript_466141

Id TrinityTRINITY_DN49203_c4_g1_i10
Name TranscriptLl_transcript_466141
SequenceTTGTCCACATTTGAATATGTCTCCTTCACAGCATCCCATATCTCCTTTGCAGTGTCATAGAACATGAAATTCTCACCAATTTCATTGGTCATGGTGTTGA GCAGCCATGACATTACTTGGCTGTTCTCAAGTTGCCATTTTTGAAGGTTAGTGTTTCCTTCTTCAGGACATATTGTGTCTCCGGTGATGTAGCCTTCTCT TCCTTTTCCTTGAAGGAAGATCTCGACTGATCTTACCCATTGGGTATAATTTTGACCATTTAATTTATGGCCAGTGATGAGATGAGTGAGCCCATCGTGT GAGCTGGTCGGAAATGATCCAGTCTCCACCTTTGGCTGCTCGTCGGAAGGTTCCCCCATTGCTGGATGCTCTAGGATTTTCTTAGGAATGGATCAGATCG AGCTCTGATACCATGCGGAATTCTGATTTTATTTCTATTGTCTTTTTACAATTATACAAAGCATAATTTATACACATTAGGGGATTAAAACTGAGCACTA ATCTAGCCTAAGAATGAGGGAAGTTTTCCCCCTTATAATTGCTAATTATAATAAATAGGGAAAGCTAGAAATCTGCTAATACTAATGTAAATTTAAAGAC ATAATGTTGTCATAAAACTATACAAATCAAGATCATTTGATTCTCCTTAATTTGTGCCAATCTTCAACACTCCCCCTCAATCTGGGTGGTAGATATCTAT CATACCCAGATTGGACCTGATTCTCTCGTATGTGTTCCTTGGAAGAGCCTTTGTCAAAATGTCTGCCGTTTGTCTGCTTGATGAAACATGGTCAACACTT ATGATAAATTTTCTCTTTAATGAAGTGTCTGTCAATTTCCACATGTTTTGTTCTATCATGGTGAACTGGGTTCTTTGCAATGATTATGGCAGCCTTGTTG TCACAAAGTATTCTCATAGTGTAGTTAGTGGGAATTTTGATTTCATCCAACATTCGTTTGAGCTAGATCCTTCACCAATTCCTTGTGCCATAGCTCTAAA TTCAGCTTCTGCACTACTTCTAGCAACCACAGATTGTTTCTCACTTCTCCAAGTTACCAAGTTTCCTCATACAAATGTGCAATAGCCTGTAGTGGATTTC CTGTTAGATAAACTCCCTGCCCAATCTGAGTCAGTATAGACTTCAATTCCTTGGTTCGAGTTCTTCTGGAAGTGGATCCCGCGACCAGGTGTACCCTTTA AGTATTGTAGGATTCTATTTAAAGTCTTCATGTGAGTTTCAGTTGGATTAGACATGTAGCGACTAGCCAGACTTACAGCAAAACCAATGTCGGGTCTAGT GTGGGTTAGATAGATTAATTTTCCAACTAAGCTTTGGTATCTGTCCTTCTCAGCTGGTATATTTTCTTCCTCACTCCATTTCATAGGTTCTATGGGAGTA TTGGCAACTTTGCATCCAAGCATCCTTGTTTCTTTCAGTAAATCCAGAGTGTACTTCCTTTGAGAAACATAAATACCATCCCTTGTTCGAGCAACTTCCA TCCCTAAAGAGTACTTGAGTTGGCCCAAATCTTTGACTTCAAATTCTTTGGTTAAAATACTCTTGAGGTGCTTGATTTGATTATGATCATCTCCTGTAAT AATAATATCATCAACATAAACAATAAATAAGGCTATTTTTCCATTCGTAGAGTGCTTAACAAACATAGTGTGGTAGGTTTGGCATTGGACAAAGCCATCT TCCTTGACAACTCTTGTTAGTCTACCAAACCATGCCCTTGGTTTCCCATGTGCCTTTTCAATTTCATTGTCCTTGATTCTGATGGGTTGCTTCAATTTCA TTGTCCTTTTAATTTTCTTTCCTGACCATTGCTTCAGTTTCTATTACAACATCCGGTCCAGATTCTACTGTCCTTTCAACTGGGTTAAGAGCATATTCGG TAGGTTCAAACATCCAAGGTTAGTATTCTAAAATTTCAGTTGGATATGTGTGTGATTGCTCCCCCTGAATACTAACTTTGCAGTAGTAGGGCTGGTTCTC AAAAAAGGTTACATCCATGGTGTGGTAGAATTTCTTGGTGACAAGTGAGTAACATCTGTACCCTTTTTGGTGAGGTGAGTAGCGAAGGAAAATGCACTTA ATAGATTTTGGTTCAAGTTTGCTACGATGTGGATTGAGGTTGTGGACGAATGATGAACATCCAAAATATTGTAAGGGAATGGAGGTGAGTATTTTACTGG TTGGGAAGAAGGTTTGTAGTGTGGAGAGGGGGGTCTTAAGGTTGAGGATTCGAGAAGGCATTCTATTTATGAGGTATGTTGTTGAAAGGACAACTTCCCC CCAAAAATGTTTTGGGAAATTTGTGGCTAACATAATTGATCTAGTTACTTCCAAAATATGTTTGTTCTTCCTTTCGGAAACTCCGTTTTGTTGTGGGGTG TCCCCACAAGAGCTTTGGTGAACAATGCCAACTTTCCGTAGGTAGGAACTTAGTACAGAATTATAGTATTCACGACCATGATCAGTTCTGAGTACTTGGA TCTTGCTTTGAAATTGGGTTTACACCATATTATGAAAGGCCTCAAAGATGCCCCCTACTTCTGATTTTTCCTTCATTAGAAACACCCATGTAACTCGTGT GTGATCATCAATAAACATGACAAACCATCTTGAACTAGTAACATTTTTAATGCGTGATGGTCCCCATACATCACTATGAATTAGGGAAAATGGTTGGGTT GGCTTATAGGGTTGGGGTGGGTATTTGCTACGTGTATGTTTGGATAATTGACAAATTTCACACTGAAAATGCTTCTGATTTTTATTAAATAATGAGGGAA ATAATTTTTCCAGGTACATGAAATTTGGGTGGCCTAATTGATAGTGCCACAACATTATGGAATTATTAATGCTTGGAACAATAGCTGCTGCATATGACTG GTTCTCGAGTCTTTCTAATTCCTCAATTTGAAGTAGGTAGAGTCCAACACACTCTTTAGCACTGCCGATCGTCTTCCCCGACTCTAAAATCTGAAATTCA CACAAGTTAGGTGAGAATTTAGTAACACATTTTAAATCTCTTGTGATCTTGCTAATGGACAGCAAATTGCAATCAAGTTTTGGCACATATAGAACAAAAT CAAGTGTAATATTAGGTGAGAGAGTAATTGATCCTGTATCCATGACCTTAGAGTGTGTGCCATCTGCTATTCGAACACTGAAGTTAGATGGGCAAGGAGA ATAACTATTAAACAAGTTAAAATTTCCAGTCATGTGATCCGAAGCCCCCGAGTCAACAACCCATGACTTTGTTTTTTCCTTGCTAGTATTTAGAGCATGT GAGAAATTACCTCTTTGAGCCACTACTGCAGTACCACCCTTTTCTGCATAAGTTTGTTTGAGGAGTTTTTGTAGAGCCTCCATTTGTTCCCTGCTAAATG GAGATGAGTCAGAATTTACCTCAACTTCTTGGTGGTTGAATACTATGTTGCCTCTGCTGTCCCTGCTTTTGAATTGCTTCACTTCTATGGGTTTTCCATG TATAACCCAACATGTTTCTCTTGTGTGGCCTGACTTCTTGCAATGATCACACCAAGGGCGATTTTTCTTTTGAAATGGCCGAATCTGGTTTCCTCTTGCT GCCATTGCTGAGCTCTCGATGGAGGGTGATGAGATGTTATTTCCTAACATGAGTTTCCTTTTGCTCTCTTCTCTCCTCACTTATGAGAAGACTTCCCAAA TTTTGGGAAGAGGTTTGGTTCCAAGGATCCTTCCACGGACCTCATCAAGGTCCTTGTTTAGTCCCAAAAGGAACTTATAGATTTTGTCCTTCTCCGCCA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_167373; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_466141

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_466141

BlastpRetrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 from Nicotiana with 27.84% of identity
BlastxRetrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 from Nicotiana with 32.64% of identity
Eggnog-
Kegg-
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_020218570.1)
PfamGAG-pre-integrase domain (PF13976.5)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;