| Id Trinity | TRINITY_DN49217_c3_g1_i4 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_466778 |
| Sequence | CGCGAAGCTTCTATGCGCCTAGGAGATTAACTAAGCACTGTTTTCGGACTTGGAAAATTTTCACCATAAAAAATAGAAGGAAATGGTACGTACAAATTTA TTTGTTAATTATTACTGGATTCAGTTGCTTCTGCTTTGTCCAATTGATACGTATAATAATAAGAGCTTATGATAAAAAGGAATAACACCAAAAGCTACTT CTGATAAGCTAGTTAGCAAACATAAGTGATTTTTTAATTTGTTGCAAAACTCACATGTGGTATGTCATACAAGTTTTTCTACAAACATTAAACAGTTGTA AATTGTAATGTTTACTTCAGTAGTATCTGAGATTTCAGCAAATTGCTATCCACCTGCTTGTGCAACACAATCAATCCTTCTATTATCAATTCTATTCATT TTGTGCTCGTCGGGTCGTGCAAAAGTGCAGTTCATCCTGACTTGGGTGAATAGGCATTAATACCAACTTGAAATATAAGTTTTATCTTGTTTTTAACATT GCAAGCCCTTTAAGAGCCATTATGGAACTTGAGTAAACAATCTTCAAGGAATTCACTACTAAATATTTAAAACTAATAGGACTGTATAATCTTACTATAA TTGACAAGCTAACATTTGTTGTCTCACAAAGTGTGTCCCAATATTGTGCTATTCTTTCTGATTAGTTAAATATCTCTCATTGTTAGTGTTGTATATTTAA ATCACTTGATCAAGCAGAATAAAAAAAGGTTTCATAAGATAACCCTTGCATATTTAAACCTTGTCGTATGCTTTTGCGGGACAACAAATGTTGTCCCATA ATTGACCTCTAATTACTTAAGATAACCCAATAAGAAAAGAATATTACCCCTTTGGCAGTTGCACAAATTTACAATTAAAAATGACCCCCTTCATTTTCTA TAGTGTGATTAACATCCTTTATCCTGCATCTCTTTGATTGATTTTTTTGGTACAATGGAAACCAAAAAGCACAAAAGAAAATTAAAACACGGGATAGAGG TCTTGAGCAAGATAGTAACGACAGTCAGTCGGAGCCACTTTCCAGGTCCTGAATGCAATCCAAATCTTGCATGTAGTTAGCCACCTGATTTGCCTCACGA ACAACAAACTTGACCTCAACTAGCCAGTTGCGAGATAACCAAGAACGAATAACAAACTTGACCTCTTTTATTGATTGAATGAAGTAAACAAATATAGGAA TTTATTTTAAATATGCAGTTCTATGTGAAGCATAGTTGAATATCTTTTTTCTACAGTCTTTTCAGAACAAAGGATTTTCGATGGTAAAGGGTTCTGGGCA CATTAATGACAAAGAGACAGCATTTCATAATCCTTCCGAGATTGAACCAAAACGACCTCATGAATGGTTTGTTGATGCTGCTGAAGTGGATTTTTTTCCA AGCAAGAAACAAGCAGTGGAAGATGCAAATGGAAAGTCAAGTTCAGGATTTGCAAGTGCAAAAATTTCTCACTGGGAGAACAATCCCAATTTACATTCAG TCCCAAATATCTGGCAGTTATTTGGGTCTGAAAATAAGCCTGCCAATTTTGCTGAAAGTAATACATCTTATGTTCCGGATGATGATTCTAATGTGAGACC GAAGATGGTCGACAATCAATATGGAGATGGTCCATCCTTTGGCTTGTCTATATCTCATCCTGATGAAGATTCTGAAACATGTCTAAATTTTAGTGGAATA AAAAGGGTCAACGTAAATCAGGTTAAGGATTCTGATGGTGTACAAACATCAAAGGAACATCATTCTAATAGGCGAAGCAATGGTGGTCTGCATCTGGCCT TTAATGGTGAAGATGAGACAGGGTCTGTGTCAATAGGACAAGCCTTTGAGAAGGACGGTGATGTCACTTTAATGGGACTCACCTACAACAGAGGGGAAGC CCACATTAGATCATTTGGTGCCCCCTATGGCAAAGGAGGCGACGCAGTCATATCAATTGATGATTCCTATGATAAAGATGGCACAACTATAATTTCTTTT GATGGTTTCCCAGATGAACAGGATGTTAACTCTGTGGGAAGGCCTGACATTGACTTTGTTCAATTTTATAATCAATCTTCAGTTCATGTGTCAGCGGCTC ATGAGAAAGAGATAGATGCTTCAAATTTTGATGCAGTTGTAGGTACTCCTCAGGCAGTAAAAGTAAAGTCTGAAACCGTATCCAAGAATAAGCAAGAGTT CAAAGCAGCTAGGAAAGAAGCTCCAAATAGCTTCCCGTCTAATGTCAGGAGCTTGATATCCACTGGTATACTTGATGGTGTTCCTGTAAAGTATGTCTCA GTGGCTCGGGAGGAGCTTCGTGGTATTATAAAAGGCTCTGGCTATCTTTGTGGGTGTCAACCTTGTAACTATTCCAAGGTCCTGAATGCTTATGAGTTTG AGAGACATGCTGGTTGCAAAACAAAACACCCAAACAATCACATTTATTTTGATAATGGGAAGACAATTTATCAGGTAGTGCAAGAATTGAGGAGTACTCC TCAAAGTTTGTTGTTTGATACAATTCAAACAGCTTTTGGTGCACCGATTAATCAGAAAGCGTTTCGCAATTGGAAAGGTAAAGAAATTTGTCGTCTCTCT ACCTTCTACACAAACACATTCAGGCCTGTGAAGGCAAGGTTTTACTGTTTGGATTATTATTTGCCACTTATCCAAATTTTTTACCCCGGCCAATTTCTTC AGAATCATTTCAAGCAGCAACACGTGAGCTTCAACGCATTTATGGAAAGGAAGAACTTAACTTATAGGTCGCAAGCCCTTGTGAAAATGTAACCTAGGTT CTAGTGTGCATAGTAAGGTATATCAGTTTTAAGTCTTTTATTTTATTTTTTCTAGCTATAAAACCTTCAGTTAATTGTGTACCCATGTTGCCTTACCTAA ACATATTGGAGACTTTATGTTAGCCTTTGTATAAATCAATGGAATTAGGTACTTTGGTAGAGATATGATTATCTAGAACATGATAAAGAAAGATAATGTT CTTTTGTAATAGTAAGCAGAAGACTTCCTAGAGTTCATAATTTTGGGGCATTGGACTGGGCTAGTGAAGTCACCTGTAACATTTGAATTTATCTGAAAAC ATAGTAGTTAAATTCACGTGAGTATTGTAACTATTCCTGTTAGGTTGGCAATAGAATTTATAGAACAAGATCAATTAATTTGTGTGTGATTGAAGGAGGA CTAATCATTTCCGTTTGATTGTGCTTTTTTATGTTTTATGTGAAATGTTAAGGGTGAATGAATTGAGAGAGG BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_167453; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_466778
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019454037.1) |
| Pfam | TPL-binding domain in jasmonate signalling (PF16135.4) |
| Rfam | - |
| GO | - |