Ll_transcript_467742

• Id Trinity: TRINITY_DN49228_c2_g3_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_467742
• Sequence: AATTGTTATCTTTGAGGTAAGCAGCAAGTGGTATGATTGGCATTTAAAAGAAAACAGTATTCAATATTGTTTCATTTGTTTGTAGACATGTGTGTTTCCT TGTACCCACATATAATAGGTGCTGCTGTGCTAGGGCTATAATTAAACTATCAATTTTAGAAAAGACAGTAGTAAGTAATTTTTTTGGAGTGGGGCAATAA CAGATTGAGGATGTTTGAACTCATGATGAGAATATGTTGGTTTTTTTATTGGTACAAACATCTAAGAGATCAGAAAGACAGAAAATATTTGATTATTATC ACCATTCTGGTGATTCATTTGAGTCCTTAAGCAGTCATCAGCAATGATAAGATTCTTGTTTTTTATTCCCCCCTATGATTTATGCATAAGCTCTGGCTTA GTAGCTGAACTTTTAATATATTTCTTATTGCTGAAAATTGAATATATAGAGACATAGTTCCATTTGGACTTAATTCATTGGCAAAAGTAAATGCTGTTCT AATACCAATTTATGTCGAAGAAGGTAGAGAAATAGGGAACTGAGAAGGTTAAACTGCACATGTTTAACTAATTCAGTAATAACCAACTTAATTGAGGGAT TTTGGAAAAAATATGTGATGGAAAGGAGGATCCAAATGCTCCTCATGTGGGTAAAGCGTCTAGGGCTCTCCATGGATCAAGCAGAGGTCACTTTTCTGTT TTCAGGCTTGTGCCTTGGGCCAGGAGTTTCCCTAAGCTGGGAGCTTTTGCTCTTCTTTTTCTGTAATTTATTTTCTCTGGTTTAATCAATACCCCTCTTT GCTAGATTGGAACTAGTTCCTATCAATGTGCCCATATATGCCTTAGCCTATGTTGCTATATTATTGTAGAGTACTTATTGAAAATGTTTCCTCCTATATC ACTCAAGTACTTAACTATCACTGGAAGGAGAGGCGTGCCAATAGTAGAGAAGGCTTTATACATGTATATGTCTGCAATGCAATATGCATGTTATGTTTGT TGAACAAAGTAACAGTTTTAATGGACTTCTTATCATATGTTGTCTAAGTAATGTGCATGGAATTGCAGGCACTTCTTTTCTTTTTAGCCATTATTGTTAG GGCCGCTAATAGGCCAGCAGATTATGATAGCGATGATGAGTACATTAATCCAAGGCAGCAAGCCCGACAGCCATTGCTCCACAAACCAGAAGGTCCAGCA ACAGGGGTACCAGTTTCTGGGACAATTGACCAGCGTCCAAGTAGAAATGATGCATGGAGTACACGGATGAGGGAAAAGGTGTGATATTTTTCCTTTTAGT CCACTTTATTAATATTCTGGTTATTGGCACTTTTGTGTGAGTGTCTGGGTCGAGCCTCTTTAGTCTTATGGTCACAAACATTTGCCCGCCACACTGTACA CATCATACACATGCACTCGTTTATATATATGACCCTGCCTTTTGGCTTCCTGAGTTTGGGATCTTGGCTTTGCCTTATGAGTCCTTACAACATTGCCATT GAAAGCCCGTTTGTGATCTTTGCACAAGATGCTTATATTTTTACTACTTTGCCACCAAATATTTTTATTTAGTAATTTCTTCCTGACATGAACTTGTTGA GCATTTTAACAAGTATCCTGATTATATTATTATTGCATTTTCAAAAAAATAGCAGTTTGTAGAATTTCATGAGAGACTTTAAAAAGTATTACCACCTGGA TCCTGCTGTGGTTTCATGTCTTAATGATTGGCTAAACCCGAATTATATTTAATGATTTTCAAGTGTCACACAAACCACACTTTTTACATAATACATTTTT TTATCAACTGTCATTTACGAATCCGTAGTGCAGGTGTATTTTTCAGTATACTCTTGTTTTCGACCATATCCTTGCGTTAGGAATGATTGGAAATAACACA TTATTATTGTTTGTTAGATGATTATAGCATTGTAATATCTGACACTAATATCACTCTATTCAGTACGGGCTTGATACTTCAGAATTTACATACAACCCAT CCGAGCCACAGAGGTTCCAGCAAGTAAACTCTCAGCCAACCGAGGAAAGGAGCCGATGCATCATCATGTGATCAGTACATGTATGCCATCCAAAGCCATG ACAATTTGACTTTCAAGGATTATTTTGGAGGTCAATGGCGTTGAAGCTACTAGTTTGCCAGTAAAATTATTTTGCTGTGTTTGGATCAATCCATGACATG GGAACTTCATCTTCATTTTGGTGTGTAATATTGTGCGTGATAGGCATAAGGATTTATTGTGGCATTGCTTTTATTCGTAGTTTAGGAGAGTAGTGGAATT GTTATGATGCCAATGTGTTGTTGAAAAACTTTAATGGCCGTTTTACTTTAAAATGATTAACACTATTATCATAAAACCAAGATCATATTATTACATCGTC AAAGTGGAGATATGCTTTGATCTGTTTATAGAGAATATGTTTAACAAACTTTTACTTGTTCTTAGTCTTTTATCCAAATACATGTCCAGGTGTGGAATAT GAATGTTTTTGGGTCTTCTAATTATAGTCTACTTTTGGTGTTAGTTACCCACTTACCCGGACTAAAAGAAATGATTTGTTTATATTGTATTTTCGTCGTT GTCTATTAATGCAACTGTGAGTCTTACTTGAATTAGATTACTTTAAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_167529;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_467742

FPKM

• PAB: 0.3
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.4
• PS2: 0.4
• PS3: 0.3
• PW1: 0.4
• PW2: 0.2
• PW3: 0.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_467742

• Blastp: -
• Blastx: Tobamovirus multiplication protein 2A from Arabidopsis with 67.74% of identity
• Eggnog: Tetraspanin family(ENOG4111KWC)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G32400)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019444995.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;