Id Trinity | TRINITY_DN49231_c2_g1_i7 |
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Name Transcript | Ll_transcript_468035 |
Sequence | CTAGTTTTGATCCATATGATTCATGGCCAATATAACTATTAAACCATATCGATATTGGAATCGACTTACCATAATACTCCTATCTCCATTACAGGTATCT TCTTTTTGCAGATAGCCAAGGCTCTATTTTCGGGTGGTGACAACTCTGTTTTGGCGTGTTTCCTTTGTTTCTCGCCACTCTCTCTCAAACTCATTCACCA TCAATGACTCTCTCAATCTCATCCTCTCTCACTCTCCATTCTCACTCATTCTTCAACCATCAACATCAACAACAACGCTCTTTCACCACCTCAAACGCCG TCGTATGCTCCGCTAAATCCGCCTCTCCTCCGAAGCTCAGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTCGAATTGAATCGCTGAGTCAGGTTTCCGGCGTGTT GGGTTGTCAGTGGGGCGATGAAGGAAAAGGTAAACTCGTTGATATCTTAGCACAGCATTTTGAAATCGTTGCTCGCTGTCAGGTATAACATACTCTTCTT TCTCAAGTTTATTCCTTTTCACCTTTTTATCCATTTTCTGTTTGCTACTAATCATGGGTAGTTTTGCCAACTCAATGAAATTATTTAAAAAATCACGGGT TAGTGTTTATTTTATCAGCAATTTTTTAGAACGTAAATTTGTTAGTACGTTAGTATTTTCGATGTGGTGAGACTCAAACACACAATCTCCTACACTCTGG TGCTTAAGACCACCATCTTCATCATCAAACCACCTTGTGACTCACAATCATAGGTTAGGGTTGAAACTTGAAAAAGAAACTCTATCTTATACCATTACCA ATAAGGATCCTAAGATAGACCAATTAAGGGTTCGATTCCTATTATCGATACTTGTTGGGAGGTACAATCACCTATCCTGAAAATGAATAGTTTCTAAACA TTAGTCACAAGTGAGGAGCTCATTTCCTACGAAATAAGGTCTCGGGTTTGAGTCTTGTGAATAATGAAAAAAAAATAGGTATTGAGAGAGCTTTGCTCCT TAAATGGTCTCCCTCACTCAACATTGACTATTCATGTTCAATTTGATTTTGCAGAGCGTTTAGAACTACAAGATCCATTTTTACTGGAGAATAACTATAA CTCACATTTGAGGTTGCTTAACGGGATCTCACCGCCCTCGAGGACTAATGAGTTTGATTCTAAGGAACTAATGTGTCCGGTTCTATATTCTTGCGGCAGG ATTCGGGGGGTTTAGTTTCAATTTGTTCACTTGGAGTTCACCTGTGACCTATTGTAGAGAAGATCGTATAATCTCGCCTTAGATGGTTAGAGCATATGTA TGGTACAAGCCCTAGTAAGAAATGGATTATATAGATGGAAGAGAGTGCAATAGTTAGAGGTAGAGGGAAATCAAGAAAAGTTGTAGTTGAAACCATTAAG ACGGATTTTAGATTTAAATAGTTTGTCTATAGATGTGATTTCCGGTAGGATATTATGATGTCATTTGATTGTCAGGGTTTTAAGTTGTGGCCCGATGTGG CCAATGCAGTCTGTAATCATGGTCTGTTGTAGTTCTGCTGGCGGGCACATCATGTAATGTGGTTTGCATTTAAACATTGATCCATGTCTACTTCATGCTC ACATACTTCTTTAATTCTTGTTATGTTGGTTTATTTAAGGTGGTTGTTGATTTTACTATGGTCTGTTTAAGACCCCACTTTCTAGCTAAATAGATATGTA TTAGTCAAAGCTTTTATTTAAGATTTTGGAATTATTCGGATTCTCTGTACATTTATTAGTGGGCTAATGATTCTGGAATTATTTTGATTCTCTCTGTGCA TTGATTTGTGGGCTAATTAACATTATAATGCATGAGTTGTGATCTTTAGATAATTGCTTTCTATTGGTGTTTGTGAATGAATTTGGTCACTCCCCTCGTC TTTTTGTCTGTATTATTTGCGCTGAAAATTTGTGATCATGTGTATCAGGGTGGAGCTAATGCTGGCCATACCATTTATAATTCGGAAGGGAAAAAGTTTG CCCTTCATCTTGTTCCATCTGGTATCCTTAATGAGGATACGCTGTGTGTTATTGGAAATGGAGTTGTGGTGCATCTGCCTGGGCTCTTTCAAGAAATCGA TGGCCTTGAGTCAAATGGGGTTTCTTGCAAGGGAAGGATATTGATATCTGACCGCGCTCACCTGTTGTTTGATTTCCACCAAACAGTGGATGGGCTGAGA GAATCTGAGCTTGCTAAATCTTTCATTGGCACAACTAAGAGAGGCATTGGACCGTGCTACTCCAGCAAGGTTAACCGTAATGGCATTAGAGTTGGCGACT TGAGGCACATGGATACTTTTCCTCAAAAGCTTGATCTTTTGTTATCGGACGCAGCATCGAGGTTCAAAGATTTCAAATATGGTCCGGAGGTGCTCAAAGA AGAAGTTGAAAATTACAAGAGATATGCTGAGAGGTTGGAACCCTACATTGACGATACTGTGCATGTCATCAATGATGCTATAGCACAAAAGAAGAAGATT TTGGTTGAAGGAGGTCAAGCTACCATGCTTGACATTGATTTTGGCACTTATCCCTTTGTTACTTCATCTAGCCCTTCTGCTGGTGGGATATGCACTGGTC TTGGTATTGCTCCCAGAGCTATTGGTGATTTAATAGGAGTGGTGAAAGCATACACTACACGAGTTGGTTCTGGTCCTTTCCCTACAGAACTTTTGGGTCC AGCAGGTGATCAACTTAGATCTGCTGGCCATGAGTTTGGCACAACCACTGGCCGTCCTCGGCGCTGTGGTTGGCTTGATCTAGTTGCATTAAGATTCTCC TGCCAGATCAATGGTTTTTCATCACTGAATCTCACCAAGCTGGATGTTTTATCGGAACTTGATGAAATACAGTTGGGTGTTGCTTATAAGCATGCTGATG GCACCACAATCAATTCATTCCCTTCAGATCTCGATGTTCTTGAGCAGTTGAAAGTTGAATATGAAGTACATCCGGGATGGAAGTCCGACATTTCTAAAGT TAGAAACTATTCCGACCTCCCTAAAGCTGCGCAGCAATATGTGGAAAGGATAGAAGAGCTTGTTGGTACCCCTATCCACTACATTGGTGTTGGGCCCGGA CGTGATGCTCTCATATATAAATAAGTTACATATGACTCTCCCAGTAACATGAAGATTTTCACATAGAAGTATTTTTTTGCCACCAACTTTCAGAAATATG GGATGAAAGTGAATCTGTAGTGACTATTGAGGATTACCTACTTGATGTATTATGTTGTTAAGTTGTAAACCATCAAGGCATTTTTGGTTTCTGCATAAAT TTGATACTTCAGTTTTTCACTTTAATCAAGGCATTTTTGGGTTTCTGCATGTTAATAATCTGTCCACTGCTATTCATTTAGCAGAAACAATGTTGTACTT TTAGTAATAACTACAGAGGCTTTAGCTCTGGATTATCTCCAAAATTATTGTCATGGTTTTCTTGTTACATGTAATTTTTGTTCTCATGTTTTCACTTATC ATTTAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_167568; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_468035
Blastp | Adenylosuccinate synthetase 2, chloroplastic from Ricinus with 87.5% of identity |
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Blastx | Adenylosuccinate synthetase 2, chloroplastic from Ricinus with 87.5% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (8278953) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019425935.1) |
Pfam | Adenylosuccinate synthetase (PF00709.20) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |