Ll_transcript_468394

• Id Trinity: TRINITY_DN49265_c0_g3_i10
• Name Transcript: Ll_transcript_468394
• Sequence: CGAAAAACATTAGACATAGGGAAGAAGAAGGTTCTAAAGACTGAAAAAACCGAGATAATGGATTCGGATCAGGGGAAACTTTTCATTGGTGGGATTTCAT GGGACACTAACGAGGACAAGCTTAAGGACTATTTCGGAAACTACGGTGTTGTCTCTCATGCTTCTGTTATGAGGGATAAGAACACAGGAAAACCTCGAGG TTTTGCCTTTGTTGTTTTTTCAGATCCATCTGTTGTTGATAGAGTTCTAGAAGATACCCACGTTATTGATGGAAGAACGGTATTGGGTCTTCTAATTTCT CTTCAAATTCTATCATTTTACCCTTTTTTGTTCCATTACCGCATATTCTATCTGTTTTATGCTTTTTGACCCTTTTTATTTTGATGAACTTATTCATGAT TTTGTCGAATGCAATTATAGCTTTTTGGCGGGGTTTTAGTGGTTTAAAATAAATTGTAGCTTTTTATTTTAATGGAATTTTGGATGTGTTCTTTTAACTA GTTTTTTGTATGGCTCCTTGTTAGGTTTAGTATCTTTTAGGTATTCATGGACTTTGTTTTACTGAATGAAATTCTAGCTTTATTTGTGAGGTTTTAGTGG TTTGAATGAAGTTATAGTTTTTTCATGAAATTATTGTTGGGTTTTGTTTTCTTGAACTATACAATAGCTTTTTTTCTGTGGTTTCTTATTAGGTTTAGTA CACGTGTAATGTGTATTTGTCGGGTTTCTTGTTATGTTTAGATGTTTGTAGATATGCAAAACTAAAATTCAACCTTTCAATCCTCTACTGAGATAATATC AGCTTAGAGAGAGCAACAGTGAAAATGATACACAGGAAGAGTGTGACTAGAGTAAAGGAGAGGAATAGTGGGAGAGAGAGAGAGGTTAGGGGAAGCTTTA TGTTGGTGGTATTTGACTGAGGAGATGCTAAAAAAGTATTACAGAAACTAGGATGATGTCCTGAGCACGTCCATCATGAGCGAGGAGAACACCATAACCC CAGTTATAAACCTATAGCTTTGTAGTGTTTGCTGATCCTTAATTCTCATTAAGGTTATCGAAGATTAGCGCATAATAGATTGAATAATGGCAGTGTATGT TGATTTATTTTCAAATTTTGTATTTTTTCTTGTTTAGTTCCATTTCAACAAACCTCTTTTATCATGTGTGGGGTTCTCATGATGGGTTTGTTTATTTTGG GGCTAGATGTTTGAAATTTCAGAAGTTCTCTTCTATTTCTTGCTGTTGCTGATTCCATTTTTTGGTATGAATAACTTGTTCCTTTTGTTGAATGAATAAC TTGCTGCTTGGATACCTTTTATTAAAAATATTTTTTATCCCAGATTGACCAGGCTATTTAGACCTTTGGCTTGGTAATAAGCATTGCAATTTGTAAAGTG TGCGCATAATATTAATAATACACGCTTTATAAAACATGGCCTAATAGAGTAAGTGTCTAAAAAAAGGAGTTATACATTAATATCCATTGATATATATTTT TTAAAGAAGAGTTTAAAAATGGTTAAAAAGTTCTCACCTTAAAAATCAGACTGAAAGACCCAGCCTAAAAGATTAGCTTTGATAACATGGATAATTGTGG AATGTTTAAGTAATCCTTTTTATGATTTTTCTTTCATTGATGGTATGTATAAATGTATAATTAGCAACCTGTGTTATAATTTATTATGTAGGTTGATGCC AAGAGAGCCTTCTCAAGAGAGGATCAACAGATTTCTGTTAATTCTAGAACTGGTAATTCCAACTCTGGTAGGAGTTCTGGAAATGGTGGAAATACCAGGA CCAAAAAAATATTTGTTGGAGGGTTACCTCCCACCCTGACTGAAGAAAAATTTCGTGAATACTTTGAGGCTTATGGCCAAGTAACAGATGTAGTAGTCAT GTATGATCAGAATACTGGACGACCTCGAGGATTTGGGTTTATTTCTTTTGATAATGAAGACACAGTTGATAGAGTTTTGCACAAGACATTTCATGAATTA AATGGTAAAAATGTGGAGGTAAAGCGTGCACTTCCCAAGGATGCTAATCCGGGTGCAAGTAACCACACGGGTGGTGCTGGAGTTGGCGGGTATCAGGGGT ATGGGGCTTCTGGTGGCAACCAAAATGCATATGATGGTCGGGTGGATTCAAGTAGGTATTTGCAGCCTCAAAATGCTGCAAGTGGATTCCCATCTTATGG TTCTTCTGGGTATAGTGCTCCTGGGTATGGCTATGGTGTGGCTAACAATGGTATTGGTTATGGTGCATATGGAGGATATAGTGGTGCCACTGCTGGGTAT GGTGGACCTGCTGGTGCATCATATGGGAACCCAAGTGTTCCTAATGCTGCTTATCCTGGTGGTCCTCCAGGTGGCCCGAGGAGTTCATGGTCTGGTCAGG TTCCCTCTGGTTATGGGTCCGCAGGCTATGGGAGCACTGGTCCTTGGGGTACCTCAAATGGTGGTGCTGGAACTGGTAGTGGTGGCCCTGGTTCAGCAGC TGCAGGTCAATCCCCGAGCGCAGTTGCTGGATATGGGAATCAAGGTTATGGATATGGTGGGTATAGTGGAAGTGATAGTTCTTATGGGAATCCAGGTGCT TATGGAGCTGTTGGAGGGCGTTCCGGGAGTGCCCCAAATAATGAACTACAAGGCAGTGGTGGCAGCTATATGGGAAGTGGTTATAGCGATCCAAATGGAA ATTCAGGGTATGGAAATGCAGCTTGGAGGTCAGAATCAACACAAGCATCAGGAAATTATGGGACTCAGGGAAATGGTGCTGCCCATGCTGGGCAAGGTGG TTATGGTGGTGGCTATGGCGGTTCACAGTCCAGACAATCCCAACAGCAATAGTTTTGGCAGTTATATCTCGTACTGGATCTTCAACTTCAACTTGTGGAT CCCCAATTTTTATATCTTAAATCATGAGTTCACCCAAATTTTCTTCCTAGCAGCAATGCAGTGGCTGAAGTTTGATGATTACACAACGGGACTGGTTACA TTGCTCAAATTGTTGTAGTTTGCAGTACTTGATTCCTTTAGTTTATAATAAGTATTTTGAAAAGATAGTAGATTCTACTTTCTATTTAGTATTCTGTTTT GCTTATAGCTTTAAATTTGTGTGCTTATGATTTAGCTGTTTGGAATTGTTAATTGTCATATTGAAGCTTTTAGTGGCATAATTCACCTTTATGTTGGTTT TGATGCTGTTAATTTTTGTGTTATCTTGGTGTTCTCATCTTGTTTCCCTTTGTGTGTTATCCTGCATCTGACTACAGTTAGTCGGTACGAAATATTTGTG TAGAGATACTCATGCATTAATTGTTATAACAAGTAGAAATAAGGATGGTATTCTGGCTATATGTACCGATAGCAGTAGCATTAGCAGTAGCAGTGGCAGT GGACACTTGGGTTGATCACTTCGTATTGGGTAGCGTTAATGGTAGTGGTAGTTGAAACTTTGAGGATGTTTTATTGATTTCCCCCTGCATTGGCACTTGT GTTGTACAGGAGGACAGGTTCACGAGTTCTGAAGTGGAGCCAAGTGTCCACTCATGGCGAACTTTAGCTTCATGATGGCTTAATCAGGGGCTATTTAGCA CGGAATGTACGTAGTTCAGTCATATTGTGTTTTTCTACACTTGTGCATCATCAAATATGGAGATATCTGGCTTTACATGTGATAAACTTTCCTATCCTTC AACCCGGTTTGTGGTACGTTGACTTGAGTAGTTAGTTGTTAATTGTTAAAATTTTAACATGTTTAGGTGGGTGTGCTTACTGTTACGGAGAGATTTTTTC TCTACAAAACAGTTTTGACTGTGGTGGGTAATTTTTTTAAGCTAGATTTCTTCATTATGTCAGTAATATTATTTTTTGGTCCCTGAAAATGCAAGAAGCT TTAGTTTTGGTTCAAGTTTTTTTTGAAAAAAAGAAGTCATCGCCGATAGTGAGCCTCAATGAAGTGGTGGTCACATGACAGTTCTCGAGCACCGACACAT TGTTTCAGTGATTTTCATTTGCACCACACAAGCAATTAACACAGGCTCACTAGCAATGATGACAATGAAGGACTAAAACCAAAAGGTTCTATATTTTCAA AGGATCAAAAACATTAAAGCCCTTTTCTATATTCAATCCTCCTTAATATCATTTATGGTTATCTTCAGTTTTAGTCTTTTAGCTTTTGTTTCACTTGGTA CATTAGTGTTACTTTCTGGCATCTTAATATACAGGAATCAGATGAAGTAGATTATGTTCAATTCAGTAGGTTTTTGGAGAGTATACTCTATAGTGGTGTG ATTGTCTTCTTCTGACCCTTGTTTACTTTTTAGTTGAAAATGAAAAAGGGAAAAAAACCAACATGCTCCTGCACCTCAGTGTTCAACATCTTTGTTAATT TTGTAGTAAGCTTGTCTTTTTTGATAAAGTAGAACTTGTGTTTGAGATGAAAAATTGATGAAGTCATGAAAGAAGAAATGGAAGTTTATAGAGAGTGTAA TATCTATGCATTGTTCATGTAAATATTTATATACATTCAATATATCATTCGTCATTTATCATTTATAAACATTAATGATAAATGATACACCGATTGTGAG TAAAACTTTAACATGTGCATGAAAAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_167855;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_468394

FPKM

• PAB: 0.2
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.1
• PS2: 0.1
• PS3: 0.2
• PW1: 0.1
• PW2: 0.1
• PW3: 0.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_468394

• Blastp: Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 from Arabidopsis with 55.6% of identity
• Blastx: Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 from Arabidopsis with 65.84% of identity
• Eggnog: Rna-binding protein(ENOG410YA8Z)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G14300)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019449967.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;