Ll_transcript_468380

• Id Trinity: TRINITY_DN49265_c0_g3_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_468380
• Sequence: CGAAAAACATTAGACATAGGGAAGAAGAAGGTTCTAAAGACTGAAAAAACCGAGATAATGGATTCGGATCAGGGGAAACTTTTCATTGGTGGGATTTCAT GGGACACTAACGAGGACAAGCTTAAGGACTATTTCGGAAACTACGGTGTTGTCTCTCATGCTTCTGTTATGAGGGATAAGAACACAGGAAAACCTCGAGG TTTTGCCTTTGTTGTTTTTTCAGATCCATCTGTTGTTGATAGAGTTCTAGAAGATACCCACGTTATTGATGGAAGAACGGTTGATGCCAAGAGAGCCTTC TCAAGAGAGGATCAACAGATTTCTGTTAATTCTAGAACTGGTAATTCCAACTCTGGTAGGAGTTCTGGAAATGGTGGAAATACCAGGACCAAAAAAATAT TTGTTGGAGGGTTACCTCCCACCCTGACTGAAGAAAAATTTCGTGAATACTTTGAGGCTTATGGCCAAGTAACAGATGTAGTAGTCATGTATGATCAGAA TACTGGACGACCTCGAGGATTTGGGTTTATTTCTTTTGATAATGAAGACACAGTTGATAGAGTTTTGCACAAGACATTTCATGAATTAAATGGTAAAAAT GTGGAGGTAAAGCGTGCACTTCCCAAGGATGCTAATCCGGGTGCAAGTAACCACACGGGTGGTGCTGGAGTTGGCGGGTATCAGGGGTATGGGGCTTCTG GTGGCAACCAAAATGCATATGATGGTCGGGTGGATTCAAGTAGGTATTTGCAGCCTCAAAATGCTGCAAGTGGATTCCCATCTTATGGTTCTTCTGGGTA TAGTGCTCCTGGGTATGGCTATGGTGTGGCTAACAATGGTATTGGTTATGGTGCATATGGAGGATATAGTGGTGCCACTGCTGGGTATGGTGGACCTGCT GGTGCATCATATGGGAACCCAAGTGTTCCTAATGCTGCTTATCCTGGTGGTCCTCCAGGTGGCCCGAGGAGTTCATGGTCTGGTCAGGTTCCCTCTGGTT ATGGGTCCGCAGGCTATGGGAGCACTGGTCCTTGGGGTACCTCAAATGGTGGTGCTGGAACTGGTAGTGGTGGCCCTGGTTCAGCAGCTGCAGGTCAATC CCCGAGCGCAGTTGCTGGATATGGGAATCAAGGTTATGGATATGGTGGGTATAGTGGAAGTGATAGTTCTTATGGGAATCCAGGTGCTTATGGAGCTGTT GGAGGGCGTTCCGGGAGTGCCCCAAATAATGAACTACAAGGCAGTGGTGGCAGCTATATGGGAAGTGGTTATAGCGATCCAAATGGAAATTCAGGGTATG GAAATGCAGCTTGGAGGTCAGAATCAACACAAGCATCAGGAAATTATGGGACTCAGGGAAATGGTGCTGCCCATGCTGGGCAAGGTGGTTATGGTGGTGG CTATGGCGGTTCACAGTCCAGACAATCCCAACAGCAATAGTTTTGGCAGTTATATCTCGTACTGGATCTTCAACTTCAACTTGTGGATCCCCAATTTTTA TATCTTAAATCATGAGTTCACCCAAATTTTCTTCCTAGCAGCAATGCAGTGGCTGAAGTTTGATGATTACACAACGGGACTGGTTACATTGCTCAAATTG TTGTAGTTTGCAGTACTTGATTCCTTTAGTTTATAATAAGTATTTTGAAAAGATAGTAGATTCTACTTTCTATTTAGTATTCTGTTTTGCTTATAGCTTT AAATTTGTGTGCTTATGATTTAGCTGTTTGGAATTGTTAATTGTCATATTGAAGCTTTTAGTGGCATAATTCACCTTTATGTTGGTTTTGATGCTGTTAA TTTTTGTGTTATCTTGGTGTTCTCATCTTGTTTCCCTTTGTGTGTTATCCTGCATCTGACTACAGTTAGTCGGTACGAAATATTTGTGTAGAGATACTCA TGCATTAATTGTTATAACAAGTAGAAATAAGGATGGTATTCTGGCTATATGTACCGATAGCAGTAGCATTAGCAGTAGCAGTGGCAGTGGACACTTGGGT TGATCACTTCGTATTGGGTAGCGTTAATGGTAGTGGTAGTTGAAACTTTGAGGATGTTTTATTGATTTCCCCCTGCATTGGCACTTGTGTTGTACAGGAG GACAGGTTCACGAGTTCTGAAGTGGAGCCAAGTGTCCACTCATGGCGAACTTTAGCTTCATGATGGCTTAATCAGGGGCTATTTAGCACGGAATGTACGT AGTTCAGTCATATTGTGTTTTTCTACACTTGTGCATCATCAAATATGGAGATATCTGGCTTTACATGTGATAAACTTTCCTATCCTTCAACCCGGTTTGT GGTACGTTGACTTGAGTAGTTAGTTGTTAATTGTTAAAATTTTAACATGTTTAGGTGGGTGTGCTTACTGTTACGGAGAGATTTTTTCTCTACAAAACAG TTTTGACTGTGGTGGGTAATTTTTTTAAGCTAGATTTCTTCATTATGTCAGTAATATTATTTTTTGGTCCCTGAAAATGCAAGAAGCTTTAGTTTTGGTT CAAGTTTTTTTTGAAAAAAAGAAGTCATCGCCGATAGTGAGCCTCAATGAAGTGGTGGTCACATGACAGTTCTCGAGCACCGACACATTGTTTCAGTGAT TTTCATTTGCACCACACAAGCAATTAACACAGGCTCACTAGCAATGATGACAATGAAGGACTAAAACCAAAAGGTTCTATATTTTCAAAGGATCAAAAAC ATTAAAGCCCTTTTCTATATTCAATCCTCCTTAATATCATTTATGGTTATCTTCAGTTTTAGTCTTTTAGCTTTTGTTTCACTTGGTACATTAGTGTTAC TTTCTGGCATCTTAATATACAGGAATCAGATGAAGTAGATTATGTTCAATTCAGTAGGTTTTTGGAGAGTATACTCTATAGTGGTGTGATTGTCTTCTTC TGACCCTTGTTTACTTTTTAGTTGAAAATGAAAAAGGGAAAAAAACCAACATGCTCCTGCACCTCAGTGTTCAACATCTTTGTTAATTTTGTAGTAAGCT TGTCTTTTTTGATAAAGTAGAACTTGTGTTTGAGATGAAAAATTGATGAAGTCATGAAAGAAGAAATGGAAGTTTATAGAGAGTGTAATATCTATGCATT GTTCATGTAAATATTTATATACATTCAATATATCATTCGTCATTTATCATTTATAAACATTAATGATAAATGATACACCGATTGTGAGTAAAACTTTAAC ATGTGCATGAAAAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_167855;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_468380

FPKM

• PAB: 3.5
• PNAB: 3.3
• PS1: 3.6
• PS2: 3.2
• PS3: 4.7
• PW1: 2.5
• PW2: 2.5
• PW3: 2.4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_468380

• Blastp: Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 from Arabidopsis with 60.42% of identity
• Blastx: Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 from Arabidopsis with 67.66% of identity
• Eggnog: Rna-binding protein(ENOG410YA8Z)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G14300)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019449967.1)
• Pfam: RNA recognition motif (PF16367.4)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;