Ll_transcript_484873

• Id Trinity: TRINITY_DN49329_c2_g1_i14
• Name Transcript: Ll_transcript_484873
• Sequence: CAAATATTTCCTTCTTTTCTTGGTAAGGACACCTTAGCTAGCGTTATTATTTTTGTCAAGCTATTGTTCACGAGTTGCTATTATTTCTGACTTTGAATAA TTGTTTTTCATGTTTCTGACTCTCTGTAGAGCTGTACTAATAATCTTGTGATGTTCCCTATTTTATATTGGTTGACAGGTTTGATTGTTTTTAAGCTAGA AAGTAGGAATGCTTAATAGATTACTTAATTATATATACCGTGGTTTAAAATTTTCTTTTTTATTGTGTACATAAATGTAGCCAATTAGCCATGCTAACGA AATTTGAGATTCATGTCAACCTTTTTTCTTAGAGTTAGATAAGTGCTCTTATTCTGGATATTCTTGATGATATGAATGTGCGATGTTGTTAGGCTGATGG CAGTGGGTTGAAAGTGGAGCTTATTTATGGCAATGTAGACTGGGTAACCTTAAAGAGATTTGTTGCTAATTTAAATGTTTCATCGCTAAGACCAAGCTAA ACCGTTAGAATAACCGAGCAACCAGAAGTTGCAGTTATGTAATATCCCTGTTGTAGCATGTATGTAGTTTATGCAGCTGATCAACAACTTTCTTTGGGAG CTAGTGTAATCCTAACTGTGTTATTGGTTTGCCTCTTCTGAGGAGTTACCTTCGGTGATATAATGGATGACATTACTTTCCATTTTTCGTCATCGGTTAA AGGGGTGAAGGAAAAATGGTTTTCGGAGACATTTTTTTTATGTGCTTATTTTTGCAAGTGAACTGTGTTCAGGCTATCTAATCATTAATTTTCAATTTGG GTAATTGTACCTTTGGAAGATGTTTTAGTTGTGATTTCTTTCTTTTTCTTAACATATTTGATTTGTATGAAGTGTATGAAATATGATTGACATACATTAA GTCGTTTTATTTCACTATATAGTTGTGAATTTGTTTGTTATATTTACGGCTGTCAATTGGCCCCATACTAAATACTTATCATTTTTAATATTTATTTTTG TTTAAATCTTAGTGCAGTTCTACACTTTTCTTGAGACGACTCTTGTAACTGCATCCTTACTGCCACTTTTCTTAGCATTCTTTAGTGACGGAGAAATTCC TGGGTCACCTGGCTCTCTTGCTACAACTTTTCTTGCTTTTGTTTTGGATTTGGCCTTTGCACTGAGCGTCTTGGGATTCCTCATTATGCACATATCGTTG GTGGCTTCTAATACAACAACTATTGAGGCATATGAGAAGAAAACTACTCCAAAATGGCCTTATGATCTTGGTCGTAGAAAAAATTTCGAACAGGTATTTG GGATGGACAAGAGATATTGGTTCATCCCTGCTTATTCCGAAGACGATATTCGAAGGATGCCGGTTCTGCAAGGTCTTGACTATCCATCAAAACCAGACTT CAATTCGCAATAGTTCTAAAAGCTAATATTTTCACATCATTTAACAAAAGATATGGAGACTCCAAGAACACTCTACTTTCAATCTTTAAGGGTCTGTTTG CTAGTCGGTTTTTGTAGGTGTAGGGAGGGAAATGAAGGTTTGAGAGTCGTGAAATATACTTGTTAGATGACCCTGAAGTCTTCCTCTTCAAAACCCAACT CGTAAACGGACACTAAAAGAATGTAACGGGCAAGTAAAACTCGGCTCACGACAAGTGATCTGCGAGGCACTTAGTATGATTTCTCTCCTTATTTTATGTA AATTTTAAGATGAGGTGCCTTTGTAAAGTTGAAATGAAGGGGGAGTAGGGTGATAGGTTTGAGGGACTAATGTGTTAAAATTGCTTATAGTTCAATACCT GTTTGTCAAGTTGTAATAATGCAATGTTCTTAATTCTTTTCAATTTCTCATTTTCAAGTTGTGGTTATGCACTTATACCATTAATCATTGTTTGAAGAAT TGTAATGGATCCTC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_168446;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_484873

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.2
• PS2: 0.2
• PS3: 0.2
• PW1: 0.1
• PW2: 0.1
• PW3: 0.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_484873

• Blastp: -
• Blastx: Probable protein S-acyltransferase 14 from Arabidopsis with 81.75% of identity
• Eggnog: Zinc finger, DHHC-type containing(COG5273)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G60800)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019447214.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;