Ll_transcript_483652

• Id Trinity: TRINITY_DN49334_c0_g1_i9
• Name Transcript: Ll_transcript_483652
• Sequence: GGCCCAAAATATGGCCCATAAATAAAGCCCTAAATGAGGGTCGAGAAGTGCATTATAAAACATATAGAAAGCAGAATTAGGGTTTCCTGCAAGAAAGGCT GAAAGTGTGTGCGCAGATTTTTCTATTGTTGCAGCCTCAACCTTTTCAATCATGATCATTTCCGAGAAGAACCGTAGGGAGATCAGCAAATACCTCTTCC AAGAGGGAGTTTTGTATGCTAAGAAGGACTTCAATCTGGCGAAGCACCCGGAAATAGATGTGCCAAATCTGCAAGTTATTAAGCTGATGCAGAGTTTCAA ATCGAAGGAGTATGTGAGAGAGACATTTGCCTGGATGCACTATTACTGGTTCCTCACCAATGATGGCATTGAGTTCCTTAGGACTTACCTCAATCTTCCT TCAGAGATTGTCCCTGCCACTCTTAAGAAACAGGCTAAGCCAGCTGGAAGACCCTTCGGAGGTCCACCTGGTGATCGCCCTAGGGGCCCACCACGCTTTG AAGGAGAAAGGAGATTTGGGGGTGACCGTGATGGATATCGTGGAGGTCCCCGAGCACCCGGTGGTGAATTTGGAGGAGAAAAGAGTGGAGCTCCTGCTGA CTACAGGCCATCTTTCGGGGTATTGTTACTACACTTTATATTTATGTCATTATAGTATTATTATGTTGTTTTTACAAGATTATGCTTCATTACATTGTTA GACCATGATTGTAGTTTGCTCTGCTATTTGTTGTGGCCTAGTTTTAAGTCAATTTCTGTTGCCCTTAATCTGATTGTCTTGTTTATCGAATCTTTTTTCT TATGCCTAGTTCCTCTCTTATTTGATTAATTTTATTGATACAAAATACATATAAGTTGTGTTGTCGTAGAGCTTATGAGATTGTTAGACCATTGACACTC TGAATTATCCATTCAATCTCTTAAAAACCAATGCTACTTATTATTTTACAAAATTTTGAATAGTCAGTAAGTAGTGTGAATGATTATTTGGTAGTGCCAA CTGCATCATCACCCAAAGGGTATCTATTATATGCATATTGGAGCTTTCAAATGAAATGATGCACAATGTTTTCTTGTTGACCAAACCATGTTGAGTGGGA CACTGATGCCTAATCTGTTATTTTTTTGTTTCTGTTCTCATAGTTTAGTTTTGTAGTTTCATGTTCTGTTTGGAGTGGCACCATTTATGTATGTTTTATG AGGAAGTTATTGATTAGGTTCTAACATCTATCGTCCGCACTGTCTGTAACCTTTTCTTGATGCTAGTTCTTTTGTGGAGCGAGTTCCTTTTGTAGTTTCC TTAATCTGTTTGTGGGCTTTTACATTATTGTTGTGCAGGGTCCTGGTGGACGGTCTGGCTTTGGCCGTGGTGCAGGTGGTTATGGAGCACCATCTAATAC AAATGCTTAAAATGTATTAATTTATGCTCCAGTTTTTGCAGTTTTAGTTTTTTCTGGCCGTCATTGGAGTCAATATTATTTCCCTTTTCCCAAATGTTGT TTTTATCGACTTTGCAAGTATTTTACTTTAAGATTCAGTGATTCATGTAATGAAGTTTTTGTTTTGAGTACTTTTTCTAAGTTGATTGACAATCTTGGTC TTAAGAGATGCGGAATGGTTTTCGTATAGTTAAATATACCCTTGACCGAATGTTTTTGGTTGGATACCCTTGACCTAATGATTTGCTAGATGATTTTATA TAGAAGTGAAATCATTAAAGAATCATTGATGTATCTCATGTAACTCGGAATGCTAATAGTGTTAAACTTGATAAATATTTAATCTCCTAATATTATTCAA TCTTGGGGTGAATGTATCCCGTTAGTCATAATATTCGCCATATTTCATTAATCAAGAATTGGGTAACGCTAATGATCATATAATATTTCTACCTTATTCG CGATCAAGAATTAACACCAAATATCGCCGACCGATAATTCATGGTAAATAGGTTAATTGTGCCCAGTAAATGTTTTTTTATGGGGATCCCAGTAATGTCC TTCTGGTCGGAACTGTTGCCTTAAAATTTTGGATTGTGAATTATATTGGTTGCTCCCGGAAGCTTTTGAAGTTCGAACGATATAATACACTATTATCTTT TGAAGCTGTTGCCTTGAAATCTCATCCTAAATGATAAATGCAGACGAATTGATATGCTCGCTTCTTCCTGTATGAATAAGTTGGTATTCGTATCACTTCT CTTTTACAAAACAATTAATTTACAAATGCAGTGGATAGAAACCATCATCAATCATTACGCTGAATTTTTTTCCATTTTATATTTAAATACCTAATCCCAA AATTTTCTGATATTAATATATTACTTGTTAGTTCCTTAAAAAGATATTATACCTGTTTCTTTTCTGTTGAACTTTGGATTTTAAGTTGAAAGCTGAAACT GCGCCACGTGTGATACTCGTGTCTTTATGGAATTTACTAATTTAGTGCTCTGGAAACTTCCTCAACTATATTTTGCTTTTCTACGCTGTTCTATTCCATC CAATTCATTCCTTTCTGCAAAAACGGGACTGTAGCTATTGAAGTACATGCGTGGAATTGGTGCACTTCTTCTGTCAAAATACAGATTGAAGCTATTATAC CAGGAGAAAGCTTCAGCGGGTAAATTGACAACTTCAACACGGAAGAACCAAGAAAACAACGAATTTAGCAAAATGAGATTAACTACTAAAGAGACAGTTG ACCCAGTAGTCGCATTTAGCAAGCCTCCACCACCTCCTCCAGTTCTAGGACCATTGGTTGCACTCTCTCTGTTGCAGACATGGTGGAAGGGTAGTGACGG TGATGATGGCAAGTGAGGTGATACCATAGTGTAGAGCAAGAACAAGAAAATAGTGTTCTTGTTTTGAAAAGTTAGGATTAGTAAGATTATGTAATTGTGT GCTTCCAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_168487;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_483652

FPKM

• PAB: 2.3
• PNAB: 3.2
• PS1: 1.6
• PS2: 2.8
• PS3: 2.1
• PW1: 2.1
• PW2: 2.8
• PW3: 2.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_483652

• Blastp: 40S ribosomal protein S10-2 from Oryza sativa with 81.41% of identity
• Blastx: 40S ribosomal protein S10-1 from Arabidopsis with 88.54% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (4329619)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019424423.1)
• Pfam: Plectin/S10 domain (PF03501.14)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;