Id Trinity | TRINITY_DN49358_c0_g1_i5 |
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Name Transcript | Ll_transcript_483309 |
Sequence | TTATAATCTGACACATTAGTTAAAAAATTAAACATTATTGATTTTATCTATTTTTATTCATTTTGATGTTATATTTTATTATACATGTGGCTAACGTTGG AGCCAATTCCAGAACAGAAGTGGAATTTAGCTATAATTAATTTAATTTATGATTAAGAGCTTCTTGCTTATTGTTGAGAAAGTAAAGAAGATTGGTTTGA AATAGTTTTCCTAGGATATTCTCTGGGAGAGATACACGTTAAGTTGGAATGAAGGAAAATGCATTGCTTACAGACAAAGCATAACAAGTATTTTTTTCCC ATAATTTAACAACAACTTTCACCTACAGAGAAAGATGGCTTCATGGAACTAGGGAGCAAGAAGCATATTTATATGAAGAGAATGGAATAACTTGGGCTTG TGAAAACAAAACATTTCTATTTCCACACTCAAAATCACCCACCAGACAAGAAACCAAGAAAATTGTGGCACGTTTGGTTAAATTTGTTATAACCAGAACC AACATATAGTTACATTAATTGTGGTAATAAAAAAATGAATTTTTTTTCATCACATTAATCCTTAATCTATTTTAATTGGTCATGAATTTTATCTAAGATT TGGTTTAAGAAAAATAGGGCAAGCCTCTTCGCTGAATGAATAAAGTTTTTCTATTTTTATAGAAATAGTAGTTAAATCATGTTACAACTAGTTCAGTTTG TAGGATTGAACTGAGCCTAAGAATATGGTATATGCTATCGGGTCGGGGGAATATGCTATTGGATCGGGTTAATGTTGGAGGGTGAATCTTACATTTTACA TTCTTTGTATCCATAGATGAACAATACAAAACGTTACATACTAATACTGCAATTGTAGTAAGGTTTTTCATCCATGGGAGGTGGAAACAGAGGAGGAAGA TCGAGATCCAGCAACAACAGAAACCGTAAAAATGCAATCTTTGTTGAAGGGGGTTTCTTATCTGATTGCCATTTATCCTCGTCCCCCACTTTCAATTCAC CAGGTGGAAACTGTAGCTCGAAGAAAGGGTCGGGTTCCAAATCTGGGAGGGTACATAGAGCAGAAACTTCTGCTTCTAAAACAGTGATTGTTCCAAACTC TTATTTGGGGACTACTATTGGGTATAATTACCCTTCAGCAAATAATATTCAGGTTTGTCACGCCTGACAAAGTTTTTAACTTCATATATTATTTTTAAGG CAGATGATAAATCAGATTTAGTGTTAATTTTGAACAATCTATATGCTTTTAACTAAAATGGTGTTTTTGACCTTAAATGGGGTCTTGTGCTATATTGTTC ATTATGTTTCAGCAGTTGTGTTTAACTCTCATTATACACAACACTATGGCACTACCTAAGAGGGCGAGCCTCATGCAACGGTAAGGGTGTAAATCTGTTT GCCTCCCCAGACCTCACGAGGTGGGAGTCTCGGGCAGTGGGATGCCATTTTTTATAACGGTAAAATTCCTACATACAGCATAACCAAGCAAGATCATTCA CTCTACTTAATCAGATAGCTAGTGCATTTTGACTCGCGTGATGTTATGCCCAAGTGTGTGGTGCACATTCTACTCATGCGCATAAGTATCCTAGAGAATG AACATTGCTGGAATCTACAACTTGATGAGTACTTGAAAATTAAACCATTCATCTTGTAACTTATCTCCCCCATGTTGTTTCACTGCTTGTTTCTGTTTAA ATATGCATGTAATTTCATACAGATTAGATGAGCTTTTTCCATCATAGCATCAAAGTAACTTGCATTTGTTGGTATATTATTAGGATGACTCATGTTTTGG GAACAACAGTGAAGATAGTAATTTAAATAAGCTACAACATTTTGCTTTGGTGGATTCCAAGCAGAAGAATCAAGTTATTGCTCATGTAGACCAAACACCT CCTTCAAAATCCAACAAAGTGGAATATACTTATGCTTATGGCTCAGATTTTGTTTTGGGTGACAGCTCTCATAGAGGATTAGGTTTCCATTCTGAACATG ATAAAACTCCAAGTGGCATTGGCACATCGTCCGATCAATTGCCCCAATCAACTGCAGTTTTAGATTCTTCGTCTGTTGAGAAGGATGTTGGTTCTGATGA GGGTATGGGCGGTGAGTTAAGCAATCAGATGACTGAAGGGTTGCCGTCAAAGATGTCTGCTGAGAGAAATCCAGGGTTTCTGTCAATTGGAGGGCTTAAA CTATACACCGAGGACATCTCAGATAATGAAAGTGATCAACATGATGATGAAATGTCATCGAACGAGGATGGATCTGGTTCTTCTGAATCAGAAGAATTGG TTGGATCATCTGAAAGTGATGACTCTGAGGACACATCTGACAGTGATTCTGACATTGATGAAGATGTAGCTGAAGATTATTTGGAAGGAGTTGGTGGTAG TGATAACATCATAGATGCAAAATGGTTGCTAAAACCTGATTTGGACGAGTCTGATGATGATGATTCTCCTAGAAGTTGCTATGACAAGACTTTGGAGAAG TTGAGTGGCATTTCCCTTCAAGAAGCCTCTAGGGAATATGGCAAGAAGAAATCCCGATCATCGAAAAAACGGTCTGGACATTCTGGGCCTTTAGCTTTGG ATGATCTAATGCTGGAAAAAGATCCAAGAACTTATTCTGCTAGAAAGAAGCATGTTCCTCAGTTCCCTCGCTCTTGGCCTTTGCAGGATCAAAAGATTGA AGCTTCCATAAGAATTCATGGTGAAAAAAAGAAAGTTCGTAAAGAAAAGATTGCTGTCAAACGTAGAGAAAGAATGTTTCACCGTGGAGTTGATCTCGAG AAAATTAACTTGAAATTAGAGCAGATTGTTTTGGAGAAAGTGGATATATTTTCTTTTCAGCCTATGCATTCTCGGGATTGTTCACAGGTACAGCGAGTAG CAGCACTTTATAATTTACGCAGTAGTTGCCAAAGCTTTGGGAAAAAAAGATTTGTGACAGTGATGCGAACACAATTCACATCAATGCCATCTTCAAGTGG TAGACAGCGACTGTCAAAGGTTCTGTAGTTTCACACTTGTACTAATTATATCTTGACTTTTATTTATGCATTACATATTGTTTATGTTTTTACTTTTTTC GTTGTCTGAGTGAACATATGAGACAAGGTCTATTTAGGAATTAATGCATTAGAGAGTATGTAAGGATAGCACCTGGTATGGAAAAGATGGTAGAAATTCG TCTTTACGTGATTTAGCAATGGAGGAGAAACCCACTTGAGTCCATAGAAATAAGAGTAGATCATAAAGGTTATGGAATCTACAGAAAAGCTACTGGTGAA ACCATTAAAAAAGGAATAGGACTAATGGCCTTTCCAAAAACACGATTTACGATAGAATCCTTTTATCCGACCCAGCCTAGTGGGAAAAGATTTTGTTGAC ATATATTGAGAAGTAGCATTTATGTTTTCCTCTTGTTTCCATCCTTCTATGAGATACAGATTGACATCTTGCTCTGATCCCCTCGTCAACTCTCCTAGGC CAATGCAATTGGAAGTTGAAAGATGGAAATCTTAATTAGAAGCTTCTGGTGTTTCGATGACTGGCGATTTCTTTCAAAGTTTAGACGTTTTTAGCCATGC ATTACGTACATGTTTACATATTTGCAGTTATTTGTAAGTTGTTAGTTATAGTTGAGTCTAATTGTTATATGAATTTCAGCTTATGGGAGTTGATGATGAG AGTGTTGATTTTGCCATCACCGGCTATATAAATAAGAAGCCTGTGACTGGAGACAGGAGTTCAGCAAAGAAAAGTGCTAAAAGGAATGACTTCAGAATGC AAGAACCTCAATCAGCACAGAACAAGACATCAAAGTACTCAAAGAGCCGAGGCAGCGGTAAAGGGATGGACAAGAAAGGAAGTGGACAAAAGGGTCCATT AGCTAATCAACCTGTCTCATTTGTATCAAGTGGCTTAATTCATTCAGAAACTGTGCAGATCACAGCTGTTGATACTGAAGAGAGTGATAGCCCTTATAAG AAGAGTGTCACTAGCTCTGCCAATATCGGTTCGTTCGAGGTACACACCACTGGTTTTGGTTCAAAAATGTTGGCTAGAATGGGATACATGGAAGGAGCAG GGTTAGGGAAAAATGGCCAAGGTATGGCAGAACCCATTGAGGTTATAAGAAGGCCTAAATCACTTGGTTTGGGTGTGGAATTCTCCACCAGTCCTCCTGA GCCAGCTTCTGAACCAGTTAGTAGGAACAGCAAGTCTTCAAGTTCAAGAATTGGTGGTTTTGAAAAACATACCAAAGGTTTTGGATCAAAGATGATGGCG AAGATGGGATTTATTGAAGGGACTGGATTAGGCAGAGACTCACAAGGCATCACGAATCCATTAAGCGCGGTTAGGCTACCAAAGTCGCGAGGATTAGGTC CGAAGCGTTAATTTAGGTGTCATTTGCGTTTGGTTTCCTAATGTACATTAGTCTCTAATGATTCTCCAATCTGGTTTAGTTTTAATGTAGCATGATGACT GTATTTGCGTATGTAGCATCACTTTTAAAATGCTATATTTGCTGTCTCTAAACGAAAGAAAGAAACCAAGTTCTATGGAAGACATGTTATGTAATTATGT TGAAGACAAAAAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_168672; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_483309
Blastp | - |
---|---|
Blastx | G-patch domain-containing protein C1486.03 from Schizosaccharomyces with 41.24% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019463089.1) |
Pfam | R3H domain (PF01424.21) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |