Ll_transcript_483309

Id TrinityTRINITY_DN49358_c0_g1_i5
Name TranscriptLl_transcript_483309
SequenceTTATAATCTGACACATTAGTTAAAAAATTAAACATTATTGATTTTATCTATTTTTATTCATTTTGATGTTATATTTTATTATACATGTGGCTAACGTTGG AGCCAATTCCAGAACAGAAGTGGAATTTAGCTATAATTAATTTAATTTATGATTAAGAGCTTCTTGCTTATTGTTGAGAAAGTAAAGAAGATTGGTTTGA AATAGTTTTCCTAGGATATTCTCTGGGAGAGATACACGTTAAGTTGGAATGAAGGAAAATGCATTGCTTACAGACAAAGCATAACAAGTATTTTTTTCCC ATAATTTAACAACAACTTTCACCTACAGAGAAAGATGGCTTCATGGAACTAGGGAGCAAGAAGCATATTTATATGAAGAGAATGGAATAACTTGGGCTTG TGAAAACAAAACATTTCTATTTCCACACTCAAAATCACCCACCAGACAAGAAACCAAGAAAATTGTGGCACGTTTGGTTAAATTTGTTATAACCAGAACC AACATATAGTTACATTAATTGTGGTAATAAAAAAATGAATTTTTTTTCATCACATTAATCCTTAATCTATTTTAATTGGTCATGAATTTTATCTAAGATT TGGTTTAAGAAAAATAGGGCAAGCCTCTTCGCTGAATGAATAAAGTTTTTCTATTTTTATAGAAATAGTAGTTAAATCATGTTACAACTAGTTCAGTTTG TAGGATTGAACTGAGCCTAAGAATATGGTATATGCTATCGGGTCGGGGGAATATGCTATTGGATCGGGTTAATGTTGGAGGGTGAATCTTACATTTTACA TTCTTTGTATCCATAGATGAACAATACAAAACGTTACATACTAATACTGCAATTGTAGTAAGGTTTTTCATCCATGGGAGGTGGAAACAGAGGAGGAAGA TCGAGATCCAGCAACAACAGAAACCGTAAAAATGCAATCTTTGTTGAAGGGGGTTTCTTATCTGATTGCCATTTATCCTCGTCCCCCACTTTCAATTCAC CAGGTGGAAACTGTAGCTCGAAGAAAGGGTCGGGTTCCAAATCTGGGAGGGTACATAGAGCAGAAACTTCTGCTTCTAAAACAGTGATTGTTCCAAACTC TTATTTGGGGACTACTATTGGGTATAATTACCCTTCAGCAAATAATATTCAGGTTTGTCACGCCTGACAAAGTTTTTAACTTCATATATTATTTTTAAGG CAGATGATAAATCAGATTTAGTGTTAATTTTGAACAATCTATATGCTTTTAACTAAAATGGTGTTTTTGACCTTAAATGGGGTCTTGTGCTATATTGTTC ATTATGTTTCAGCAGTTGTGTTTAACTCTCATTATACACAACACTATGGCACTACCTAAGAGGGCGAGCCTCATGCAACGGTAAGGGTGTAAATCTGTTT GCCTCCCCAGACCTCACGAGGTGGGAGTCTCGGGCAGTGGGATGCCATTTTTTATAACGGTAAAATTCCTACATACAGCATAACCAAGCAAGATCATTCA CTCTACTTAATCAGATAGCTAGTGCATTTTGACTCGCGTGATGTTATGCCCAAGTGTGTGGTGCACATTCTACTCATGCGCATAAGTATCCTAGAGAATG AACATTGCTGGAATCTACAACTTGATGAGTACTTGAAAATTAAACCATTCATCTTGTAACTTATCTCCCCCATGTTGTTTCACTGCTTGTTTCTGTTTAA ATATGCATGTAATTTCATACAGATTAGATGAGCTTTTTCCATCATAGCATCAAAGTAACTTGCATTTGTTGGTATATTATTAGGATGACTCATGTTTTGG GAACAACAGTGAAGATAGTAATTTAAATAAGCTACAACATTTTGCTTTGGTGGATTCCAAGCAGAAGAATCAAGTTATTGCTCATGTAGACCAAACACCT CCTTCAAAATCCAACAAAGTGGAATATACTTATGCTTATGGCTCAGATTTTGTTTTGGGTGACAGCTCTCATAGAGGATTAGGTTTCCATTCTGAACATG ATAAAACTCCAAGTGGCATTGGCACATCGTCCGATCAATTGCCCCAATCAACTGCAGTTTTAGATTCTTCGTCTGTTGAGAAGGATGTTGGTTCTGATGA GGGTATGGGCGGTGAGTTAAGCAATCAGATGACTGAAGGGTTGCCGTCAAAGATGTCTGCTGAGAGAAATCCAGGGTTTCTGTCAATTGGAGGGCTTAAA CTATACACCGAGGACATCTCAGATAATGAAAGTGATCAACATGATGATGAAATGTCATCGAACGAGGATGGATCTGGTTCTTCTGAATCAGAAGAATTGG TTGGATCATCTGAAAGTGATGACTCTGAGGACACATCTGACAGTGATTCTGACATTGATGAAGATGTAGCTGAAGATTATTTGGAAGGAGTTGGTGGTAG TGATAACATCATAGATGCAAAATGGTTGCTAAAACCTGATTTGGACGAGTCTGATGATGATGATTCTCCTAGAAGTTGCTATGACAAGACTTTGGAGAAG TTGAGTGGCATTTCCCTTCAAGAAGCCTCTAGGGAATATGGCAAGAAGAAATCCCGATCATCGAAAAAACGGTCTGGACATTCTGGGCCTTTAGCTTTGG ATGATCTAATGCTGGAAAAAGATCCAAGAACTTATTCTGCTAGAAAGAAGCATGTTCCTCAGTTCCCTCGCTCTTGGCCTTTGCAGGATCAAAAGATTGA AGCTTCCATAAGAATTCATGGTGAAAAAAAGAAAGTTCGTAAAGAAAAGATTGCTGTCAAACGTAGAGAAAGAATGTTTCACCGTGGAGTTGATCTCGAG AAAATTAACTTGAAATTAGAGCAGATTGTTTTGGAGAAAGTGGATATATTTTCTTTTCAGCCTATGCATTCTCGGGATTGTTCACAGGTACAGCGAGTAG CAGCACTTTATAATTTACGCAGTAGTTGCCAAAGCTTTGGGAAAAAAAGATTTGTGACAGTGATGCGAACACAATTCACATCAATGCCATCTTCAAGTGG TAGACAGCGACTGTCAAAGGTTCTGTAGTTTCACACTTGTACTAATTATATCTTGACTTTTATTTATGCATTACATATTGTTTATGTTTTTACTTTTTTC GTTGTCTGAGTGAACATATGAGACAAGGTCTATTTAGGAATTAATGCATTAGAGAGTATGTAAGGATAGCACCTGGTATGGAAAAGATGGTAGAAATTCG TCTTTACGTGATTTAGCAATGGAGGAGAAACCCACTTGAGTCCATAGAAATAAGAGTAGATCATAAAGGTTATGGAATCTACAGAAAAGCTACTGGTGAA ACCATTAAAAAAGGAATAGGACTAATGGCCTTTCCAAAAACACGATTTACGATAGAATCCTTTTATCCGACCCAGCCTAGTGGGAAAAGATTTTGTTGAC ATATATTGAGAAGTAGCATTTATGTTTTCCTCTTGTTTCCATCCTTCTATGAGATACAGATTGACATCTTGCTCTGATCCCCTCGTCAACTCTCCTAGGC CAATGCAATTGGAAGTTGAAAGATGGAAATCTTAATTAGAAGCTTCTGGTGTTTCGATGACTGGCGATTTCTTTCAAAGTTTAGACGTTTTTAGCCATGC ATTACGTACATGTTTACATATTTGCAGTTATTTGTAAGTTGTTAGTTATAGTTGAGTCTAATTGTTATATGAATTTCAGCTTATGGGAGTTGATGATGAG AGTGTTGATTTTGCCATCACCGGCTATATAAATAAGAAGCCTGTGACTGGAGACAGGAGTTCAGCAAAGAAAAGTGCTAAAAGGAATGACTTCAGAATGC AAGAACCTCAATCAGCACAGAACAAGACATCAAAGTACTCAAAGAGCCGAGGCAGCGGTAAAGGGATGGACAAGAAAGGAAGTGGACAAAAGGGTCCATT AGCTAATCAACCTGTCTCATTTGTATCAAGTGGCTTAATTCATTCAGAAACTGTGCAGATCACAGCTGTTGATACTGAAGAGAGTGATAGCCCTTATAAG AAGAGTGTCACTAGCTCTGCCAATATCGGTTCGTTCGAGGTACACACCACTGGTTTTGGTTCAAAAATGTTGGCTAGAATGGGATACATGGAAGGAGCAG GGTTAGGGAAAAATGGCCAAGGTATGGCAGAACCCATTGAGGTTATAAGAAGGCCTAAATCACTTGGTTTGGGTGTGGAATTCTCCACCAGTCCTCCTGA GCCAGCTTCTGAACCAGTTAGTAGGAACAGCAAGTCTTCAAGTTCAAGAATTGGTGGTTTTGAAAAACATACCAAAGGTTTTGGATCAAAGATGATGGCG AAGATGGGATTTATTGAAGGGACTGGATTAGGCAGAGACTCACAAGGCATCACGAATCCATTAAGCGCGGTTAGGCTACCAAAGTCGCGAGGATTAGGTC CGAAGCGTTAATTTAGGTGTCATTTGCGTTTGGTTTCCTAATGTACATTAGTCTCTAATGATTCTCCAATCTGGTTTAGTTTTAATGTAGCATGATGACT GTATTTGCGTATGTAGCATCACTTTTAAAATGCTATATTTGCTGTCTCTAAACGAAAGAAAGAAACCAAGTTCTATGGAAGACATGTTATGTAATTATGT TGAAGACAAAAAAAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_168672; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_483309

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_483309

Blastp-
BlastxG-patch domain-containing protein C1486.03 from Schizosaccharomyces with 41.24% of identity
Eggnog-
Kegg-
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019463089.1)
PfamR3H domain (PF01424.21)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;