| Id Trinity | TRINITY_DN49358_c0_g1_i7 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_483311 |
| Sequence | TTATAATCTGACACATTAGTTAAAAAATTAAACATTATTGATTTTATCTATTTTTATTCATTTTGATGTTATATTTTATTATACATGTGGCTAACGTTGG AGCCAATTCCAGAACAGAAGTGGAATTTAGCTATAATTAATTTAATTTATGATTAAGAGCTTCTTGCTTATTGTTGAGAAAGTAAAGAAGATTGGTTTGA AATAGTTTTCCTAGGATATTCTCTGGGAGAGATACACGTTAAGTTGGAATGAAGGAAAATGCATTGCTTACAGACAAAGCATAACAAGTATTTTTTTCCC ATAATTTAACAACAACTTTCACCTACAGAGAAAGATGGCTTCATGGAACTAGGGAGCAAGAAGCATATTTATATGAAGAGAATGGAATAACTTGGGCTTG TGAAAACAAAACATTTCTATTTCCACACTCAAAATCACCCACCAGACAAGAAACCAAGAAAATTGTGGCACGTTTGGTTAAATTTGTTATAACCAGAACC AACATATAGTTACATTAATTGTGGTAATAAAAAAATGAATTTTTTTTCATCACATTAATCCTTAATCTATTTTAATTGGTCATGAATTTTATCTAAGATT TGGTTTAAGAAAAATAGGGCAAGCCTCTTCGCTGAATGAATAAAGTTTTTCTATTTTTATAGAAATAGTAGTTAAATCATGTTACAACTAGTTCAGTTTG TAGGATTGAACTGAGCCTAAGAATATGGTATATGCTATCGGGTCGGGGGAATATGCTATTGGATCGGGTTAATGTTGGAGGGTGAATCTTACATTTTACA TTCTTTGTATCCATAGATGAACAATACAAAACGTTACATACTAATACTGCAATTGTAGTAAGGTTTTTCATCCATGGGAGGTGGAAACAGAGGAGGAAGA TCGAGATCCAGCAACAACAGAAACCGTAAAAATGCAATCTTTGTTGAAGGGGGTTTCTTATCTGATTGCCATTTATCCTCGTCCCCCACTTTCAATTCAC CAGGTGGAAACTGTAGCTCGAAGAAAGGGTCGGGTTCCAAATCTGGGAGGGTACATAGAGCAGAAACTTCTGCTTCTAAAACAGTGATTGTTCCAAACTC TTATTTGGGGACTACTATTGGGTATAATTACCCTTCAGCAAATAATATTCAGGATGACTCATGTTTTGGGAACAACAGTGAAGATAGTAATTTAAATAAG CTACAACATTTTGCTTTGGTGGATTCCAAGCAGAAGAATCAAGTTATTGCTCATGTAGACCAAACACCTCCTTCAAAATCCAACAAAGTGGAATATACTT ATGCTTATGGCTCAGATTTTGTTTTGGGTGACAGCTCTCATAGAGGATTAGGTTTCCATTCTGAACATGATAAAACTCCAAGTGGCATTGGCACATCGTC CGATCAATTGCCCCAATCAACTGCAGTTTTAGATTCTTCGTCTGTTGAGAAGGATGTTGGTTCTGATGAGGGTATGGGCGGTGAGTTAAGCAATCAGATG ACTGAAGGGTTGCCGTCAAAGATGTCTGCTGAGAGAAATCCAGGGTTTCTGTCAATTGGAGGGCTTAAACTATACACCGAGGACATCTCAGATAATGAAA GTGATCAACATGATGATGAAATGTCATCGAACGAGGATGGATCTGGTTCTTCTGAATCAGAAGAATTGGTTGGATCATCTGAAAGTGATGACTCTGAGGA CACATCTGACAGTGATTCTGACATTGATGAAGATGTAGCTGAAGATTATTTGGAAGGAGTTGGTGGTAGTGATAACATCATAGATGCAAAATGGTTGCTA AAACCTGATTTGGACGAGTCTGATGATGATGATTCTCCTAGAAGTTGCTATGACAAGACTTTGGAGAAGTTGAGTGGCATTTCCCTTCAAGAAGCCTCTA GGGAATATGGCAAGAAGAAATCCCGATCATCGAAAAAACGGTCTGGACATTCTGGGCCTTTAGCTTTGGATGATCTAATGCTGGAAAAAGATCCAAGAAC TTATTCTGCTAGAAAGAAGCATGTTCCTCAGTTCCCTCGCTCTTGGCCTTTGCAGGATCAAAAGATTGAAGCTTCCATAAGAATTCATGGTACCTCTATC CCACATCCACCTATGTCAAATATTTGATTTTGTTCTCTTACATCTAAAGACTTTCATTTACGCAAATTTCTGTGGCTCGTTGAGTTTACATTATACATCT TGAATCTTGAAAGCATTGAGTCACCCTGTTAAAGCATTGATGTAGACGTAGTAATTAATTAAGTGCATTAGTAGTATCATTACTTATCTTTACTGTTTTA ATATATTCTTTATGGGTGGCTGAAACAAATAGTGGGGATTGGCGAATAACAAGCCGATAAACAGGTGTGTTTAATGTGTGTTTGTCTCCATATTTGTGCC TAGTGCCTGAGCTATAGAATTTTATGAATACTATTGCAACTTTTTATAAAAAATAAACTAAAATTATTGAGTTGATGGAACAGCATGTTTCAAGCATATG GGGATTTAACATCTATAAACTGTAATACCAAAAATGGTTGAACTTCTAGTGGGAAAATTATAGATCCTGAAGAAATGGATAAGCAGTCATGTAAGGCAAC AGGGAAAAAGTAAATGTAATTATTTAAATTTTTTGTTTGAGATGATATGGAATTCCAGCCACTTCATTTTGTTAAGGCTTGTTTTATACAGGTGAAAAAA AGAAAGTTCGTAAAGAAAAGATTGCTGTCAAACGTAGAGAAAGAATGTTTCACCGTGGAGTTGATCTCGAGAAAATTAACTTGAAATTAGAGCAGATTGT TTTGGAGAAAGTGGATATATTTTCTTTTCAGCCTATGCATTCTCGGGATTGTTCACAGGTACAGCGAGTAGCAGCACTTTATAATTTACGCAGTAGTTGC CAAAGCTTTGGGAAAAAAAGATTTGTGACAGTGATGCGAACACAATTCACATCAATGCCATCTTCAAGTGGTAGACAGCGACTGTCAAAGGTTCTGTAGT TTCACACTTGTACTAATTATATCTTGACTTTTATTTATGCATTACATATTGTTTATGTTTTTACTTTTTTCGTTGTCTGAGTGAACATATGAGACAAGGT CTATTTAGGAATTAATGCATTAGAGAGTATGTAAGGATAGCACCTGGTATGGAAAAGATGGTAGAAATTCGTCTTTACGTGATTTAGCAATGGAGGAGAA ACCCACTTGAGTCCATAGAAATAAGAGTAGATCATAAAGGTTATGGAATCTACAGAAAAGCTACTGGTGAAACCATTAAAAAAGGAATAGGACTAATGGC CTTTCCAAAAACACGATTTACGATAGAATCCTTTTATCCGACCCAGCCTAGTGGGAAAAGATTTTGTTGACATATATTGAGAAGTAGCATTTATGTTTTC CTCTTGTTTCCATCCTTCTATGAGATACAGATTGACATCTTGCTCTGATCCCCTCGTCAACTCTCCTAGGCCAATGCAATTGGAAGTTGAAAGATGGAAA TCTTAATTAGAAGCTTCTGGTGTTTCGATGACTGGCGATTTCTTTCAAAGTTTAGACGTTTTTAGCCATGCATTACGTACATGTTTACATATTTGCAGTT ATTTGTAAGTTGTTAGTTATAGTTGAGTCTAATTGTTATATGAATTTCAGCTTATGGGAGTTGATGATGAGAGTGTTGATTTTGCCATCACCGGCTATAT AAATAAGAAGCCTGTGACTGGAGACAGGAGTTCAGCAAAGAAAAGTGCTAAAAGGAATGACTTCAGAATGCAAGAACCTCAATCAGCACAGAACAAGACA TCAAAGTACTCAAAGAGCCGAGGCAGCGGTAAAGGGATGGACAAGAAAGGAAGTGGACAAAAGGGTCCATTAGCTAATCAACCTGTCTCATTTGTATCAA GTGGCTTAATTCATTCAGAAACTGTGCAGATCACAGCTGTTGATACTGAAGAGAGTGATAGCCCTTATAAGAAGAGTGTCACTAGCTCTGCCAATATCGG TTCGTTCGAGGTACACACCACTGGTTTTGGTTCAAAAATGTTGGCTAGAATGGGATACATGGAAGGAGCAGGGTTAGGGAAAAATGGCCAAGGTATGGCA GAACCCATTGAGGTTATAAGAAGGCCTAAATCACTTGGTTTGGGTGTGGAATTCTCCAACACCCCTCCTGAGCCAGCTTCTGAGCCAGCTAGTAGGAACA ACTACAAGTCTTCAAGTTCAAGAATTGGTGCTTTTGAAAAACATACCAAAGGCTTTGGATCAAAGATGATGGCAAAAATGGGTTTTATTGAAGGCACAGG ATTAGGTAGAGACTCACAAGGCATTACTGATCCATTAAGTGCTGTTAAGCTACCAAAGTCACGAGGACTAGGTGCCAAACGTTAATTTATGTCATCTGCT TTCTGTTCATAATGTATATTAACTTCAAATAAATCTAATGATTCTCCTTCCTAGTTTAGTTTTATGGTATCATGACTGTGTAACTGTATTTGTTTATCAT TTTCAATGGTAAGAAAAGAAAGTTCAGAAGATTCCTTGTATATGGTTAATTAATTATTTAAATCCAGTGATGTAATACTTTATATACGCCG BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_168672; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_483311
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Zinc finger CCCH-type with G patch domain-containing protein from Drosophila with 55.56% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019463089.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |