Id Trinity | TRINITY_DN49359_c0_g1_i10 |
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Name Transcript | Ll_transcript_484446 |
Sequence | TATGGCTTCACTCATTACTTTTTTTACTTATATGTTTTATTAAAAATGCTTTCTTTTTATTCCAATTAACATGTTCTTATTGCTGCTTATGTTTTAAGGT CTTTTCTGCTCTTCTGAATTTCATAATTAACAACAATCATATTTCAAAAGTGCTTATGTGTTATGTTTTGATGTTGTGTCCATTGGAAGAAGTAATGTTA AGCAATCAAATGGAAAAATTTTATTTGTTCTTTTTCTTTTTGTTGTGATTATTGTAATGTATGATTCATTTCTCTTTTGCTTTTTTCTCTCTTTTTCCCT TTCTTCTTGCATAGTTTTTGTGGTTCTCTTTGAACAACCAAAAGTCACCAATGGTTTTTAACATCTTGATTTTGTCATGGAGGGTAAGATTGGGCAAACA GCTTAATTAAAATGCTTATTCAATAAGCTTTTCTTGAAATAAGCTAAAAATAGCTTAGAAAAGTCATAAGCTATTTTGAAGAATTTCAAACTTTTTTTTT GTTAACAGTGTTTTGGGTAAGATGCTGATTATACCATTTGTTTGCTATGGATGAATTAAATGTAACTGTTTAGTGCATTCTGAATCCTTATGCAGATTTG GTTCTTGTTTTTATATTTTCAAGAATTTCAATCTTTTTTAATCATTGTTTCATTGATTTTAATGTAGGTGCTGATTATACTATTTCATTGTCTGGTTTAG CAATGGAGGAATCAAACGTTGTGAATGGTGCAGCCGAGGAACGTAGCGGGAGTTACACACCCAACAAGGAAAATATTACAACACAGCAAGCATCTCCGAG GAGTACACTGAGTCCAAGAAGCATTCAGAGTAGCGACTCTATTGATTTGGCCATTGATGGTATTGTGGATACATCTATTGAGCAACTGTATCACAATGTG 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GGAAAGTGAATGTCGATGCACCTGTTCTTGAGTACAAGGATGCAGTTCATGAATTCGCAACACTTGACATACTTCTGAAAACCCCTCAGGCTCAGGTCTG TGCTGAGGACATTGCCATTTGGGTCAAGAAATATATCTCACTCCGAGGTCACGAATTCTCGTATTGAGTAGGATATGCCAGATTGAGAGGATTACTAGTC ATAGAATCTTTTTCCTCTCTTTGAAATTAGCTTCAGATCACTTTTCAACTATCAATTGACTTGGGGATGTTTGATATTTCCTACTTTTGTTATGATGCCT GATAAGGTCCTGGTTGTTGATCGATTCCACCTCTACCGGTCGGTTCTTTTTGTAAGATAGATTTGCTTGAGAGGGAGATAGTTGAGGCAGTTATATGCAT TTACCTCATGCAGACCACTTTTTGAATCCCTTTGTTCCATTTTTTTCCTGTGTATTATGATGTACTATTTAAGATATATAAAATTTAGTGCACTGTTCTT TTAGCTAAGTGCCACTATGCAGTCTCCAATGCATTATCCTATCTCAAGCCCCATGGAGAGTAATGAGAGCATAGTTACTAGATACAACTTCTTTTTTCAT TCATAATTATCCTCTCAACACCATTTGTTGAAGGACTCTTGCATAGAATTTGACTCCTCAATATTGTTGAAGGACTCTTGCATTGTCACCTTCAACCATT TGCACTAGGAAGCTTTCAACAATGAATATAAAATAAATGTTCATTGATTTGTTAGTACAAAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_168677; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_484446
Blastp | Protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 2 from Arabidopsis with 64.58% of identity |
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Blastx | Protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 2 from Arabidopsis with 57.68% of identity |
Eggnog | repeat-containing protein(COG0457) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G27960) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019434352.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |