Id Trinity | TRINITY_DN49360_c0_g1_i10 |
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Name Transcript | Ll_transcript_483003 |
Sequence | GTTCATCTTTCCCATCTCTTAATTGATCAGCGATTCATATTTAACCTATTTGGTTCCATGTTTGGTGGTTGTTGATTAACCATAAATCTTCATTCATACA TCACCGTTCCTTTTCGATTACCTCAAATTCAATCAACAACATCGTTAGGTTAACCTCTTGTACTTATTGTGCCAACGTTATTTTTTATTTCTTAGTTTCT GTGTTGCTCAGATTATGTAATTATGCTGAATAAAATCAATAGGGTGTGGGATTGGAGTCAATTAGGGTTTTTATTTTGGGATCAAGGTGTTTTAGTTTAT GGAGGGTGTTTGATTTAGTGAATTTCCTTTGCTTTTAAATTTTCAGTTAATTATGGTCGAACCCCGATTTCATGTGATTGATTCGTCATGGCATTTTTAC CCCTGGATTTTGATGTTGGTAGCATTTGCTATCTGATTTTTGGGGCTGTAGGATCTGGGTTTTGATTGTTCCTAATTTACATGCATTAGAGTGAAAAGGG TATATAAATTTTGTTGAAGATAGTTTTTTATGAAGCTTCCTGGGAAATGTGGCTTGTGTTGTGGTATGCTGCTGTTAGTGTTGGATACTGTCATCGATGG CTATGTCTGTGTCATAAAAATTGATTTTTTTCATCATGAAATAGCTAGAATATAGGCTTAGCACTGGTTACCTTTAATTGTTGTGATGGTTCATGGTTAT GCATAATCTGGCAGTGATTTTGCCTTTCTAGTATCAACAAGGGTTAATAAAATGATTTTAGTCTAAACTTCGGGGGTGTCTGCCTCATGTAAAGTTGCAT TTGCGAAGGCCCAAATGAATTTAGATTCTAAGTGGATAGTTTTTGTTATTTGGTAGGTATGATACTTCAACTATGGGATGACATTTGGAAGGGGATGTTC TTTAGAGTTTAGACTATATTCTTCTACGACATCATTTTTTTTATAAATCTTTGTTTGTGCTGTCAGTTCATGCTCTGGGTTCATTTTGGTTAATTAATGT CTGTCATGGATTTGTCAGTTCATATCAAGAAAAACCATATTGTTTTCAAGAATGGGGAATTTTTTATTTGTGTTAATAATATATCTTTTTATTTTTTAGT AAACTCTTCCCTCGTCAATGATGGTTATTTAATTGGAAAGTTTCTTTCTTTGTGGATAGTTTGATGTAAGAATTGATTTCACAATTTCTGATTCAGTAGA ATCTGTTGTCAATTGTTCATGCTAACTTATCTATTATTATTAAGTTATTAAATTATCATTAGAGATTTCGTAATTCAATGGTTGTTCACTTTTCTCATAT CTTATCGTATCTGAATGATTGTTGATGGTGTTTATTGATTTATTGTTGTTGATATCTGGTTTGGTATTGACCTATAATTTTGTCTCTTTGCGTGTGACCT ATATTCTTCATTAATACTTCAATATACAACACTAATTTTCTTTTTGAAGTTTTACATGATCCATATATTCAAAAGAAGCAAAATTTGATTTTAAATTGAA CTGCAACATCTGAAAACCTTTGAAGCTTTCTTGTCAAACAGTGAGTTGCTGTAAACTACATTTTTCCTTTTGGCTGTTAGTTATGGACAAGGGAACACCA CCTAGCCTCTTTGTTAATGATGGTTCATTCATGGAGAGGTTCAAGCAACTTCAACAAGAGCAGGACAAGGGAAAGGATGCCAAATTAGAGGAGTCTAAAC CAATTAAAATTGTTTCAGGATCCTTGACTTCTCCCTCCATTCGTAAGGCTAATGATACACAGAAACCTTCTCAGTCTAGTTCCGGTGGAAAGCTTGCTTT CAGTTTAAAACAAAAATCAAAGCTAGTACCACCCCCTGTTAAGTTAGCAGATGATGATGAAGAAGAAACAGATGCTGGGGATGTTTCAAATGATGCACCG CTGAAACGGCAAAAAATGGGCCAGGAGGATGGCACCGAGCAGTCATTGAGACATCTTGATGTTGGTAATTACTTCTCACATAAACTTCCTACAGTTTGTA GGTTTGTGTTCGCATTCTGAAATCCCGACGAATGTAGGATTCTAGTAGGATTTATCACGTAACGTGGTGAAATGATGGTTCTATATGAATGTGATTTTTT TATGACAATCCTATCCTTTCATGCTAAATTTTCCTTCTAGATCCTTACTATTTAATGGTTAATTTTCTTTATACGTTAATACATGTTATGAATCATCATA TTATTTTCTGCCACTTTCAAGTGATTGCTGGTGTCATCTATTAAATATCTTACTTGCAAGTTGCAACTGTTCCCTCCTTTGTGCTTGTTGTTGATTTTGT GTTTTTAATCTGCCTTTCATTTTTTCTATTTTGCTTTTTTCTGTCTCAGTTTATGAAAATTAAAATTTTCATTGCCTTGAATGAGAGAATGAGATTTTTC CTTTCTTTGCATCTTCAAAAGCTTCTAAATGAAAAAAGTTACCTACCACAAATTTATGTTTTTAAGTTTCACTTAAGGATGAACTGAAATAGGAGATAAC TGTATGACAATCTAATAGAAACTTGTCATTCATTTGAACTTATCCTTTGGATCACACAAAGGAAATAGCTGAAGAGTAAAATGGGTATCAACTTGGGTGC ATCTGTGAAGTGTGTTCTGAACTTCCCCTTAAGGTATTTAGTTGAAGGAATATCAAAGTGTGTTGTTGCCTCAGCAAGTATGCATGCAGTTGCTTTCACC ATTTTTTGCTGTGTTTTTTGTTTCTTGTAAAAAAGAGAGTCATTCTCTATGTCAAGCGAAAAGGTAATCACAGTATATTCCTTCTTTGCCCATTGAGGGT GCATTCAGCAAAGAGTAGAAAACGTCTTGAATATCTTTGTGCCATGAATGCAGCTTATTCCTCAAGTACCTATCAAGAATGCTGTATTGGCACGCCTGCT ACAAGAGTAATTTCAATTCCCTTGTTCATGCTCTTGGTATTAATCAGTTTTATAAGTGATATGCAGCACCTTCTTCTCCAAGTGATCCTACAGTGAAGAA AGTAGCTGACAAACTTGCAAGTTTTGTGGCTAAAAATGGAAGACAATTTGAGGATGTTACACGCCAAAAAAATCCTGGGGATACACCTTTCAAATTTTTA TTTGATAAAAAATGCACTGAATACAAATATTATGAACATCAGCTTGTTCAAGAGGAAAAGGCTCTTGCACAGTCCAGGGAACCACAGGCCCATCATACTG GGGGTTCAAACATTTCATTTTCCAGGTCGTCAAATGGTCCTCAGAAGTCATCTCAACAACATTCAACCTACCAAATCCCAGCTTCTGTTTTATATGGGCG TACTCAAGAACCATGGTCTTCTGGATCTTCAGTTCAAGCATCATTAGCAGGAAGCACTGATGAACTTAGTGGATCATCCAATGCTGATTCTTTAGCACTA ATGGAGTTCTACATGAAGAGGGCTGCACAGGAAGAGAGGTCGAGACGACCTAAGTATTCAAAAGATGAGATGCCACCTCCCGCTTCTCTTCAAGCAGCTT CTGGGAAGAAAGGCCATCACATGGGGGATTACATTCCCCTAGAAGAACTTGAGAAGTTCATGGCTACCTGTAATGATGCAGCAGCACAGAAAGCTGCAAA GGAGGCTGCGGAGAGGGCTAAAATTCAGGCTGATAATGTTGGCCACAAACTTTTATCAAAAATGGGTTGGAAAGAAGGTGAGGGTCTAGGCAGCTCCAGG AAGGGTATTGCAGATCCTATCATGGCAGGGAGTGTTAAGAAAGATAACTTGGGGGTTGGTGCTGTCCAACCTGGGGAAGTGACGCCTGAGGATGACATAT ATGAGCAGTACAAAAAGCGGATGATGCTCGGCTATCGTCACAGACCCAATCCTCTGGTAAATAAATACCTTTCTGTTCTTGAATTGTTTTTTTCAATGAC CATGTCTTCTGCTACTTCGTGTAATCTGTTTTCAACGGTTCGAATTGGAAATGTTTGTTTTTACAGAACAATCCTCGTAAGGCTTATTACTGAACATCAT GGAGGAGGCCTTCATGTTCGGTTTATCGTGGGAAGGCTATTTACCATAGATGAATGGGCGTAGTGATTATAAGATTTTGTGAACGTTTGTTTAAATAGTT TGAACGTTTGTTTAATTAGTTTGTGTTTTTTGAACACAATATGTTTCTTTTTTTTGCTGGGGAGTGAGGGAATTGTGGGTAGTGTTTACTATGGTCACAT TTTATCCAAGAAAGAATTATTTTTCTACTGTTATATCATTGGAGGTTGCTATCTATTGTACTTGTTATTTTGCAAAACCCAAGATTGCGGTCTGTTTCCA TGTCTGGGGTATGAGGATGGTAGATGTTGTAAGTAGATAATCTGTTTTCGAGATTTGAGCCTGACTCCTTTAACACTAAACAACAACCTTATTGTTGTGT TGAGATTCATCCTCTTTCTTGTTCATTGGTTAGTTAAGAAATATGAAGGAATGGAGAAGAGTAAATAGTAGACCTAGGATATAGGTTATTTTGATAGGCA ATGGTTATCACTTATATTGTATAAAGGCACTATAAAATCTGAAGTATCAACCTATGTTGTCTAAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_168681; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_483003
Blastp | SURP and G-patch domain-containing protein 1-like protein from Arabidopsis with 80.75% of identity |
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Blastx | SURP and G-patch domain-containing protein 1-like protein from Arabidopsis with 67.53% of identity |
Eggnog | RNA splicing(ENOG410ZSH4) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G52120) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019453415.1) |
Pfam | G-patch domain (PF12656.6) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |