Ll_transcript_482994

• Id Trinity: TRINITY_DN49360_c0_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_482994
• Sequence: GTTCATCTTTCCCATCTCTTAATTGATCAGCGATTCATATTTAACCTATTTGGTTCCATGTTTGGTGGTTGTTGATTAACCATAAATCTTCATTCATACA TCACCGTTCCTTTTCGATTACCTCAAATTCAATCAACAACATCGTTAGGTTAACCTCTTGTACTTATTGTGCCAACGTTATTTTTTATTTCTTAGTTTCT GTGTTGCTCAGATTATGTAATTATGCTGAATAAAATCAATAGGGTGTGGGATTGGAGTCAATTAGGGTTTTTATTTTGGGATCAAGGTGTTTTAGTTTAT GGAGGGTGTTTGATTTAGTGAATTTCCTTTGCTTTTAAATTTTCAGTTAATTATGGTCGAACCCCGATTTCATGTGATTGATTCGTCATGGCATTTTTAC CCCTGGATTTTGATGTTGGTAGCATTTGCTATCTGATTTTTGGGGCTGTAGGATCTGGGTTTTGATTGTTCCTAATTTACATGCATTAGAGTGAAAAGGG TATATAAATTTTGTTGAAGATAGTTTTTTATGAAGCTTCCTGGGAAATGTGGCTTGTGTTGTGGTATGCTGCTGTTAGTGTTGGATACTGTCATCGATGG CTATGTCTGTGTCATAAAAATTGATTTTTTTCATCATGAAATAGCTAGAATATAGGCTTAGCACTGGTTACCTTTAATTGTTGTGATGGTTCATGGTTAT GCATAATCTGGCAGTGATTTTGCCTTTCTAGTATCAACAAGGGTTAATAAAATGATTTTAGTCTAAACTTCGGGGGTGTCTGCCTCATGTAAAGTTGCAT TTGCGAAGGCCCAAATGAATTTAGATTCTAAGTGGATAGTTTTTGTTATTTGGTAGGTATGATACTTCAACTATGGGATGACATTTGGAAGGGGATGTTC TTTAGAGTTTAGACTATATTCTTCTACGACATCATTTTTTTTATAAATCTTTGTTTGTGCTGTCAGTTCATGCTCTGGGTTCATTTTGGTTAATTAATGT CTGTCATGGATTTGTCAGTTCATATCAAGAAAAACCATATTGTTTTCAAGAATGGGGAATTTTTTATTTGTGTTAATAATATATCTTTTTATTTTTTAGT AAACTCTTCCCTCGTCAATGATGGTTATTTAATTGGAAAGTTTCTTTCTTTGTGGATAGTTTGATGTAAGAATTGATTTCACAATTTCTGATTCAGTAGA ATCTGTTGTCAATTGTTCATGCTAACTTATCTATTATTATTAAGTTATTAAATTATCATTAGAGATTTCGTAATTCAATGGTTGTTCACTTTTCTCATAT CTTATCGTATCTGAATGATTGTTGATGGTGTTTATTGATTTATTGTTGTTGATATCTGGTTTGGTATTGACCTATAATTTTGTCTCTTTGCGTGTGACCT ATATTCTTCATTAATACTTCAATATACAACACTAATTTTCTTTTTGAAGTTTTACATGATCCATATATTCAAAAGAAGCAAAATTTGATTTTAAATTGAA CTGCAACATCTGAAAACCTTTGAAGCTTTCTTGTCAAACAGTGAGTTGCTGTAAACTACATTTTTCCTTTTGGCTGTTAGTTATGGACAAGGGAACACCA CCTAGCCTCTTTGTTAATGATGGTTCATTCATGGAGAGGTTCAAGCAACTTCAACAAGAGCAGGACAAGGGAAAGGATGCCAAATTAGAGGAGTCTAAAC CAATTAAAATTGTTTCAGGATCCTTGACTTCTCCCTCCATTCGTAAGGCTAATGATACACAGAAACCTTCTCAGTCTAGTTCCGGTGGAAAGCTTGCTTT CAGTTTAAAACAAAAATCAAAGCTAGTACCACCCCCTGTTAAGTTAGCAGATGATGATGAAGAAGAAACAGATGCTGGGGATGTTTCAAATGATGCACCG CTGAAACGGCAAAAAATGGGCCAGGAGGATGGCACCGAGCAGTCATTGAGACATCTTGATGTTGCTTATTCCTCAAGTACCTATCAAGAATGCTGTATTG GCACGCCTGCTACAAGAGTAATTTCAATTCCCTTGTTCATGCTCTTGGTATTAATCAGTTTTATAAGTGATATGCAGCACCTTCTTCTCCAAGTGATCCT ACAGTGAAGAAAGTAGCTGACAAACTTGCAAGTTTTGTGGCTAAAAATGGAAGACAATTTGAGGATGTTACACGCCAAAAAAATCCTGGGGATACACCTT TCAAATTTTTATTTGATAAAAAATGCACTGAATACAAATATTATGAACATCAGCTTGTTCAAGAGGAAAAGGCTCTTGCACAGTCCAGGGAACCACAGGC CCATCATACTGGGGGTTCAAACATTTCATTTTCCAGGTCGTCAAATGGTCCTCAGAAGTCATCTCAACAACATTCAACCTACCAAATCCCAGCTTCTGTT TTATATGGGCGTACTCAAGAACCATGGTCTTCTGGATCTTCAGTTCAAGCATCATTAGCAGGAAGCACTGATGAACTTAGTGGATCATCCAATGCTGATT CTTTAGCACTAATGGAGTTCTACATGAAGAGGGCTGCACAGGAAGAGAGGTCGAGACGACCTAAGTATTCAAAAGATGAGATGCCACCTCCCGCTTCTCT TCAAGCAGCTTCTGGGAAGAAAGGCCATCACATGGGGGATTACATTCCCCTAGAAGAACTTGAGAAGTTCATGGCTACCTGTAATGATGCAGCAGCACAG AAAGCTGCAAAGGAGGCTGCGGAGAGGGCTAAAATTCAGGCTGATAATGTTGGCCACAAACTTTTATCAAAAATGGGTTGGAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_168681;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_482994

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.3
• PS1: 0.6
• PS2: 0.2
• PS3: 0.5
• PW1: 0.3
• PW2: 0.8
• PW3: 0.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_482994

• Blastp: SURP and G-patch domain-containing protein 1-like protein from Arabidopsis with 50.72% of identity
• Blastx: SURP and G-patch domain-containing protein 1-like protein from Arabidopsis with 62.86% of identity
• Eggnog: RNA splicing(ENOG410ZSH4)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G52120)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019453415.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;