Ll_transcript_484921

Id TrinityTRINITY_DN49384_c6_g2_i5
Name TranscriptLl_transcript_484921
SequenceCAAGATTATGTGTAGAATAATAATAACATTTGTCCCATTAATGTCCTTAAGTTTCCCTTCATTCATATCCAGATCTTATCCAGTTCTATATATATAGCAT AGCACCAACCAAGCTCAAAGAGCATGGCTTCCAATATGATTCTAGTAGTCTCAAGTTTGGTTCTATCAGCTTTAGTTTCTCTCATACTTCAACTATTCTA CTTTTCACCCATTGACCCACTTCCACTTCACATACTACCTGCATCTTCATCCACAAACAACCATTTACAGGTGAAGAAGAGTTCCTACCATATCAAGGAA TTACTATATCACTCAAATATCTATGTCTTGTTCGAGCAAAGATTTACGTACACTCGTTCATGCTCAACTGTAAAGTTGTTACTTAGTCACTATGAGATTA CGAGTTCAAATCTTGGAAACAGTCTCTCTGCTTGCATGGATGAGGCTACGTACATCTACCCTCCCAGACCCTCCTAAGTGGGATCCTCGTATACTAGGCC GCCCTTTTTATACTTAAAAGTTAATGATGATTAAATATGAATGTTGATATTATAAAAGTGCATATATTTTTCTCTTAGTCTATATATAATTTTCCCTAAC AGAATGTGATAAAACTTGGAGAAGGGGATTTGAAGGATCCAGAAGATGTTTGTGTGGATAAAGAAGGCACTTTCTATACAGCAACAAGAGATGGTTGGAT TAAGAGATTGCCCAGAAATGGAAATTGGGAGAATTGGAAGCATATTCATAGTTCTACTTTGTTAGGAATCACAACAACAAAAGGAGGTATCATTGTATGT GATGCTATAAAGGTAACATAAATTAACTCATGCACTTGAAAAAGCAAAATATTTTTTTTAATATGAGTCAATCATATTCTGGTACAGAACAGCGAATAGT ATATTAAATTGCAAGAAGAACTTACTTAATTATATTTCTAGCCTCTAAGGTTATGGCCAATAACTTCCTTCATAAAAAGCCATAAAGGCATGCAACAAGG TTAAAGATCTTAAATCATAATGATTTCAGGGTTTGCTCAAGGTTACAGAAGATGGTGTCAGTATTCTTGTTTCACAAGTAAATGGTCTTCAGTTAAGGTT AGAGCCATTACCAAATAATTCATAACCATACTATTCATGTGTTCTAGTAGCTATTGTACCTGAATATTAAATGTCTCTTCATTATAATAAAACATGTCAA TTTCAACCTAAACAAAATTGACATATGTTAATTAAAATGACATATATACTACTTTTATAGTTGAGGATGTGTTATAGTTCAAATGACATATAACACTTCA ACCTATACATATTCTCACATGTTTTGTTGACAAAACAACATGCATTAATCTCAGTTATAACACTCATAATCATGAACCTTTGGAATGGTTGAACCAGTTT TGCAGATGATGTGATAGAAGCCTCTGATGGAAGTGTATATTTCAGTGTTGCTAGCACCAAATTTGATCTACACAATTGGCATCTGGATATGCTAGAAGCA AGACCTCATGGACAACTTCTTAAGTACAATCCAACATCAAATGAGATAGATATTGTCTTAGATAATCTTGCCTTTGCCAATGGTGTTGCACTCTCCAAGG ATGAAGATTATATTGTTATCTGTGAAACTTGGAAGTAAATAATTACATAGAATCTCCTATATGCTCGCTTAACCTCATTGATTTGTTTGTAACATGGCCC TAAGGTTTTAAACTGTGGTCGCAGTTACAGTTACATTGCTATTGTAAGAAAGTGGGACCATAATTACAGTTGTGGTGTAATTTGAAAGACGGCCTAAACC TTAATATTTCAGCTTCTTTTGTGATCGCTGACCCAAATTTAAAACCTTGTCGGCAAAATTCAAAATAATGCTTATTTATGTGCTAGTACATATTGTTCAC ACTGTATGTTTATCATCCTAACAATTGTTTTTCTTTTTGGTTAATCAGATTTAGGTGTCTGAGGTATTGGCTAAAAGGAATAAACAAAGACAAAACAGAC ATTTTCATTGAAAATCTCCCTGGTGGACCTGATAATATTAATCTTGCTCCTGATGGGTCTTTCTGGATTGCTCTACTTCAGGTAATATTCAGAACATTAT AGGTATTCTTCAAGAAAAAATTGATTATTATCAATATTCATGTGTACCACCATAAGTCACTATTCATGATAATAAAGGTACTATGGTGCTGTAAAACTCT TTCTATGATAATAAAGGTACTATGGTACTATAGTGAAGTTTATAATTAAACTACAAAGACATGATAATGATTTTTGAATTTGTGTTCTTCAATATTGATA TGCCACAGATTTCTACCAAAGGATTGGAGTTTGTGCACACTTCCAAGGTAGCCAAGCTCTTGCTAGCTTCATCACCAAGGCTATATAACTTAATCAATGG TGCAAAGCAGAAGGCAACAGTGGTGAAGGTGGCAACTGATGGTAAAATAATACAGAGGTTTGATGATGATAATGGAAAAGTGATTAGATTTGTCACTTCA GCTTTGGAGTTTGAGGACCATCTTTACCTTGGTAGTCTCAGTTCTAACTTTGTTGGAAAATTACCACTGCACAATACTAGTAACTAGCAAGTTCAGCTTG CTGCCACTGAATAAGAGTGTATCATCAAACAATAGAAGGATGGTATTTCTGGCAATTTTGTATCAAAGGAAGAACTTTCTATTGGCATATCACAGGCCAC AGTTTCTAATCTAGCATTGTCTGGGAGTTCATTGCTTGTATCTTCTTTTGCATTAGGATCTAAAGCGGGTGGTGGTGTGAGTGAATTCTCAGCTTTAGGC GAGACACTGATCGACGTGGAAGCATTCATTGCACCGAGTCGGTTTATCAGATTGTCAGGACTTGTAGTTGTCATCCACCTTACAGTACTAGCCACTTGTG AATAATAGAATGATTTGCCAGCCTTGCTATATTTCTTGTAGCATTCTTCTTCAAGAAGAGATGCTGATGTTTCTACTTCAATCCTGAATAAATGTTTTAA ACTGTCATTGTTGGTTCTGGTTGTTTTCCGGGGTGGGAAGATGCACCCAACACAATTAAACGTGATAATGTGTGAGGACCCACAACTTGATAACATGTTT TTGCTATGATATGATTTAGCTGTGATATTTAAGTAGTTCAACTTTGGCACAGTAATTATGTGATATTGTGATCTTTAAACAAATTGCTTCGAGGTGTCAA AGAAGTTGCATACTTGTTATAGCAAGCAGATATTGAGAAATCAAGTCGGTAGTTACTTTATGTGGCAGAGAAAGAAGCTTACTTGAAGTTATGAAGCTGT TGCTGGGCCTGCTTTAGAGCATTTTGTAATCTTTGCCTGCTTGCTCCTCGCATTGTATCGGAAATAGCATTGTTCTCAACTTTTTTGCTCTGTAAATCAA AACAGGTGAATGGGGTTGCACAGACAGGAAATAGGAGCAAAGAGTAGTAAGTTTGCTAAATTGATCGGAACAGTACAAAGCTAACAACATAATCACAGTA GTAAAAAAAAAACTGCCTCGCCTTTTGCCCACTTTAGATTGCTAATCATGAGTTTGTTATGTTACCACCCAAAGGTTCTAGCCATGGAAAATAGAATGAG GCATAGGGGGAAAGGGAGAATTTAATTTTGTTAATGAATGATGTTGGTACAAGACTATATAAGTCATTGAAGATAAACCTGTTTATCAGTGTTCTTATTT CGATAGAAGTTTTCTTCTGCTTGTTGTAACAACGCAAGCTTTGCATTCACTCCCGATCTGGATTGAAGCTTTGACCTGGTTAGGTTGTTCACAACCTCAT TACCATCTGCAAATAAGAACCCATTGTACACAAATGAGTAGTGTATAATAACCACTCCTTCATCCTTCTTTACCCCAAGAGTAAAACACAGGCAACTGAA ATAAATTTGGTACCAACCATCTGAGTCAGATATTTCTTCCTCTGATCCACTTGCTTCATCACCACGATTCCAGAACTCAGATACCTGTTCTCTGTCGATT GTGCCAGTGGAACTGAAAATGAAACTTGTGGATAAATCAGAAAATTATGGATGACTACACTGCATTAAGACTAATATATATAGTACAACTCTATAAGGCA ACCACCATCAAAGTAGTTAAAAGATAAGCAATAATCGCCAG BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_168886; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_484921

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_484921
BlastpProtein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 10 from Arabidopsis with 35.29% of identity
BlastxProtein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 6 from Arabidopsis with 42.31% of identity
EggnogSMP-30 gluconolaconase LRE domain protein(COG3386)
KeggLink to kegg annotations (AT3G57030)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019415167.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;