Id Trinity | TRINITY_DN49384_c6_g2_i6 |
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Name Transcript | Ll_transcript_484929 |
Sequence | CAAGATTATGTGTAGAATAATAATAACATTTGTCCCATTAATGTCCTTAAGTTTCCCTTCATTCATATCCAGATCTTATCCAGTTCTATATATATAGCAT AGCACCAACCAAGCTCAAAGAGCATGGCTTCCAATATGATTCTAGTAGTCTCAAGTTTGGTTCTATCAGCTTTAGTTTCTCTCATACTTCAACTATTCTA CTTTTCACCCATTGACCCACTTCCACTTCACATACTACCTGCATCTTCATCCACAAACAACCATTTACAGGTGAAGAAGAGTTCCTACCATATCAAGGAA TTACTATATCACTCAAATATCTATGTCTTGTTCGAGCAAAGATTTACGTACACTCGTTCATGCTCAACTGTAAAGTTGTTACTTAGTCACTATGAGATTA CGAGTTCAAATCTTGGAAACAGTCTCTCTGCTTGCATGGATGAGGCTACGTACATCTACCCTCCCAGACCCTCCTAAGTGGGATCCTCGTATACTAGGCC GCCCTTTTTATACTTAAAAGTTAATGATGATTAAATATGAATGTTGATATTATAAAAGTGCATATATTTTTCTCTTAGTCTATATATAATTTTCCCTAAC AGAATGTGATAAAACTTGGAGAAGGGGATTTGAAGGATCCAGAAGATGTTTGTGTGGATAAAGAAGGCACTTTCTATACAGCAACAAGAGATGGTTGGAT TAAGAGATTGCCCAGAAATGGAAATTGGGAGAATTGGAAGCATATTCATAGTTCTACTTTGTTAGGAATCACAACAACAAAAGGAGGTATCATTGTATGT GATGCTATAAAGGTAACATAAATTAACTCATGCACTTGAAAAAGCAAAATATTTTTTTTAATATGAGTCAATCATATTCTGGTACAGAACAGCGAATAGT ATATTAAATTGCAAGAAGAACTTACTTAATTATATTTCTAGCCTCTAAGGTTATGGCCAATAACTTCCTTCATAAAAAGCCATAAAGGCATGCAACAAGG TTAAAGATCTTAAATCATAATGATTTCAGGGTTTGCTCAAGGTTACAGAAGATGGTGTCAGTATTCTTGTTTCACAAGTAAATGGTCTTCAGTTAAGGTT AGAGCCATTACCAAATAATTCATAACCATACTATTCATGTGTTCTAGTAGCTATTGTACCTGAATATTAAATGTCTCTTCATTATAATAAAACATGTCAA TTTCAACCTAAACAAAATTGACATATGTTAATTAAAATGACATATATACTACTTTTATAGTTGAGGATGTGTTATAGTTCAAATGACATATAACACTTCA ACCTATACATATTCTCACATGTTTTGTTGACAAAACAACATGCATTAATCTCAGTTATAACACTCATAATCATGAACCTTTGGAATGGTTGAACCAGTTT TGCAGATGATGTGATAGAAGCCTCTGATGGAAGTGTATATTTCAGTGTTGCTAGCACCAAATTTGATCTACACAATTGGCATCTGGATATGCTAGAAGCA AGACCTCATGGACAACTTCTTAAGTACAATCCAACATCAAATGAGATAGATATTGTCTTAGATAATCTTGCCTTTGCCAATGGTGTTGCACTCTCCAAGG ATGAAGATTATATTGTTATCTGTGAAACTTGGAAGTAAATAATTACATAGAATCTCCTATATGCTCGCTTAACCTCATTGATTTGTTTGTAACATGGCCC TAAGGTTTTAAACTGTGGTCGCAGTTACAGTTACATTGCTATTGTAAGAAAGTGGGACCATAATTACAGTTGTGGTGTAATTTGAAAGACGGCCTAAACC TTAATATTTCAGCTTCTTTTGTGATCGCTGACCCAAATTTAAAACCTTGTCGGCAAAATTCAAAATAATGCTTATTTATGTGCTAGTACATATTGTTCAC ACTGTATGTTTATCATCCTAACAATTGTTTTTCTTTTTGGTTAATCAGATTTAGGTGTCTGAGGTATTGGCTAAAAGGAATAAACAAAGACAAAACAGAC ATTTTCATTGAAAATCTCCCTGGTGGACCTGATAATATTAATCTTGCTCCTGATGGGTCTTTCTGGATTGCTCTACTTCAGATTTCTACCAAAGGATTGG AGTTTGTGCACACTTCCAAGGTAGCCAAGCTCTTGCTAGCTTCATCACCAAGGCTATATAACTTAATCAATGGTGCAAAGCAGAAGGCAACAGTGGTGAA GGTGGCAACTGATGGTAAAATAATACAGAGGTTTGATGATGATAATGGAAAAGTGATTAGATTTGTCACTTCAGCTTTGGAGTTTGAGGACCATCTTTAC CTTGGTAGTCTCAGTTCTAACTTTGTTGGAAAATTACCACTGCACAATACTAGTAACTAGCAAGTTCAGCTTGCTGCCACTGAATAAGAGTGTATCATCA AACAATGTAAGCATCTTTTGATTTGTATGATTCAGACACAACATATATAATCCAAGATTGTCCCTGTTATGCAAATTTGATGTTTTTTTTTTAATTTATG CAATTTTCTTGTTCTTCTTTTTAATTTATTGTGACATGTTAGTTGGATTAGTATTAGAGTGTAATATGTATGTACTGTCATTGTAAAAATTTACACACAG TAAGTACACCATCCACCATTCATTTGTATTATTTTTTCAAAGAGTCAACGATAATAAAGCATGAATGGTGGATGATACAATGACAACGTATAAAACTCAT ACAGAATACAGAAAGTGCATTTTTATGTCTTAGTATTATGTCAATAACTAAATGTTTTGAAATAAGTTGCATTCTTTCATGTGGACAAATATTGGGTAAA AGAACATTGCCTGATATTCATTCTCACACAAGGTGCAATATATCTTACAAAAACCAAAGTAGGTACTTAGCACATATATTGCAACTAAAATTCAAACAAG TTAATAGTAGCTAAAAAAGAGCCAAATTACTCTAACCTCATCTTTTTTTCTACTCTTGATGAATACTTTTTTGTGTCCTTTAACTGGTCCCCCTTTTCCT TCCTACTGTTGACGAATTCAGAGAAGGATGGTATTTCTGGCAATTTTGTATCAAAGGAAGAACTTTCTATTGGCATATCACAGGCCACAGTTTCTAATCT AGCATTGTCTGGGAGTTCATTGCTTGTATCTTCTTTTGCATTAGGATCTAAAGCGGGTGGTGGTGTGAGTGAATTCTCAGCTTTAGGCGAGACACTGATC GACGTGGAAGCATTCATTGCACCGAGTCGGTTTATCAGATTGTCAGGACTTGTAGTTGTCATCCACCTTACAGTACTAGCCACTTGTGAATAATAGAATG ATTTGCCAGCCTTGCTATATTTCTTGTAGCATTCTTCTTCAAGAAGAGATGCTGATGTTTCTACTTCAATCCTGAATAAATGTTTTAAACTGTCATTGTT GGTTCTGGTTGTTTTCCGGGGTGGGAAGATGCACCCAACACAATTAAACGTGATAATGTGTGAGGACCCACAACTTGATAACATGTTTTTGCTATGATAT GATTTAGCTGTGATATTTAAGTAGTTCAACTTTGGCACAGTAATTATGTGATATTGTGATCTTTAAACAAATTGCTTCGAGGTGTCAAAGAAGTTGCATA CTTGTTATAGCAAGCAGATATTGAGAAATCAAGTCGGTAGTTACTTTATGTGGCAGAGAAAGAAGCTTACTTGAAGTTATGAAGCTGTTGCTGGGCCTGC TTTAGAGCATTTTGTAATCTTTGCCTGCTTGCTCCTCGCATTGTATCGGAAATAGCATTGTTCTCAACTTTTTTGCTCTGTAAATCAAAACAGGTGAATG GGGTTGCACAGACAGGAAATAGGAGCAAAGAGTAGTAAGTTTGCTAAATTGATCGGAACAGTACAAAGCTAACAACATAATCACAGTAGTAAAAAAAAAA CTGCCTCGCCTTTTGCCCACTTTAGATTGCTAATCATGAGTTTGTTATGTTACCACCCAAAGGTTCTAGCCATGGAAAATAGAATGAGGCATAGGGGGAA AGGGAGAATTTAATTTTGTTAATGAATGATGTTGGTACAAGACTATATAAGTCATTGAAGATAAACCTGTTTATCAGTGTTCTTATTTCGATAGAAGTTT TCTTCTGCTTGTTGTAACAACGCAAGCTTTGCATTCACTCCCGATCTGGATTGAAGCTTTGACCTGGTTAGGTTGTTCACAACCTCATTACCATCTGCAA ATAAGAACCCATTGTACACAAATGAGTAGTGTATAATAACCACTCCTTCATCCTTCTTTACCCCAAGAGTAAAACACAGGCAACTGAAATAAATTTGGTA CCAACCATCTGAGTCAGATATTTCTTCCTCTGATCCACTTGCTTCATCACCACGATTCCAGAACTCAGATACCTGTTCTCTGTCGATTGTGCCAGTGGAA CTGAAAATGAAACTTGTGGATAAATCAGAAAATTATGGATGACTACACTGCATTAAGACTAATATATATAGTACAACTCTATAAGGCAACCACCATCAAA GTAGTTAAAAGATAAGCAATAATCGCCAG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_168886; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_484929
Blastp | ATP-dependent DNA helicase Q-like 3 from Arabidopsis with 42.86% of identity |
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Blastx | ATP-dependent DNA helicase Q-like 3 from Arabidopsis with 42.86% of identity |
Eggnog | atp-dependent dna helicase(COG0514) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G35740) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019415167.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |