| Id Trinity | TRINITY_DN49411_c5_g1_i14 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_354516 |
| Sequence | CTCAATACGATCATAACATTGATGATTAATTAAAGAGAATAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGACGAAGAGTAGAGAAAGTTCGACGGTGCAGTATCAAATC CTTTCCATGGATTCCGTCGTCTTCTCTCTCCTCCTCCACCACCAAATCCCTTCCTCCCCACGTCATCCTTCCTCTCATTGACACAGAAAAGCACCGATTC TTCTCCATTCTTTATTCCCACTTCTCTTTTATTCACAATACTGGCTCACATTAAAATTACCCTCTCTTTCCCTTCTTCTTATTCCTATCTCAACGATCCC TTCAATTTCAACTGGAAAACTAAGAAGAAGAGAAAACTCTTCACAATGTTGTGGCTTATCAGATTCTCTGGGTTTTGTTCCGCTGCGATGCTCCTCATTC TTCTTTCCCCTTCTCTTCAATCTTTTCACCCCGCCGAAGCAATCCGGTCCAATCACCTAGACCGGTTTTCTTTTCGTCAAGCTTCCACATTCCGCAATGC TCATCAATGCGTTTCTTCTAACCGAACCGGTGTGTGTGACCCTTCCTTGGTACACGTGGCCATAACCCTCGATCTCCAATACCTACGTGGATCAATCGCC GCCGTTCATTCCATCTTGCAACATTCACAGTGCCCTGGGAATATCTTCTTTCATTTCTTGCTCACTCAGACGAATCTTGAATCCCTAGTTCGTTCGACGT TCCCTGAGTTGAAGTTCAAGGTGTATTACTTCCACCCTGAGATTGTTAAGAATCTGATTTCTTCATCTGTGAGACAAGCGTTAGAGCAACCGTTAAACTA TGCGAGAAATTATTTGCCAGATCTTCTTGAAAGTTGCATTCAAAGAGTGATTTACTTAGATTCTGATCTGGTTGTGGTTGATGATATCGAGAAATTGTGG ACTACGAGTTTGGGTGGTTCAACGATCGGGGCTCCGGAATACTGTCACGCGAACTTCACAAAGTATTTCACGGCGGCGTTTTGGTCGGACCGGCGATTCT CCACCGCGTTTGCAGGGCGGAGGCCGTGTTACTTTAATACTGGAGTGATGGTGATAGATCTAGTGAAATGGAGGAGAGTGGGGTACACGCGCAGGATAGA GAGATGGATGGAGATCCAGAAGGTTCGTCGGATCTACGAGCTTGGTTCACTGCCACCGTTTCTTCTTGTATTCGCGGGACACGTGGCGCCCATTGAACAT CGTTGGAATCAGCACGGTTTGGGTGGCGATAATGTTCGAGGGAGCTGCCGTGACCTCCACGCCGGTCCGGTGAGTCTTCTTCACTGGTCCGGTAGTGGAA AGCCGTGGCTCCGGTTAGATTCGAAGCGGCCTTGCCCCCTCGATGCTCTCTGGGCCCCATACGATTTGTACGGACACACTCAATGAGGGGTAGTCGCTGT TGTACTCTGTTATTCTATTATGTGGTTCTTTCTCTGAAATGCAAAAAGAAAACCAGCTGGATATTCTGATCGGCAAATGGTATTCCATCCCAAACTGTTT ACTTACACTTCTTAGTATGAACTAACCAAATATAATTTTTATTTCACCTAATCATGATTAGTTAACTATTAGTTGTATGAAGAGGTGATTTGAAGTATTC TTGTAATTGATGAATGAACCAAGCTTACTGTAGAATTTGTACTTGCATCAACATTAAGAAAAAGCTGCTCTCTTGGATTGAGTTTGAAGATATAAAAACG AGGGCTTTTAGCCTTTCAATAATCCTATTAAATTAAACAAATGCAACTGACACTCATAACATTATTTAATTAGTAAACTGTTTTTTTCATTAGTGTCAGG TTGGGTTCTTGTTTTATTGTTTGGAATTTTTTACTATTTATTCCATGAATGAAACCGCAAGCGGTGGAGTTCCGATTTAGTAACCTAGAGAGCACTCACA ATAGTGGGTTCTTAAATTTTTAAGAAGGTTCATCATGTGTTCTGAGATAAATAATAGAAGTTCAGCATTAGAATAAATGTTCTAAATTTAAACAAATATA GAACAGTAGTGAAACCAGAACGAAAAATCATTCACGATGGTAAATCATTTTGAGGTTGGTGGGTATTAGCGGTTCCCATGTGAAAAATTTACATTCTACC CTATTCAGTGAAGTTTGTGTTGGGTTGAGAATAGAAGCTAAAACTGTTGTGGTTTCTAGTTATTTTTAATTAATAACGTGATAAGCAGAAACAGGAAGAA ACGTGTGTTGCTGGATAGCTTAGTTGTCCACGTCTACAGTGAGAGATATATGATGAGGCTATTTGCTGGCAGCATTAGTCGATCGATTCAGAAACAATCC AATGAGTTTCATGCATTGCGTTGGAAACTAAGCTTAAACTAACCTAAGGGTACCAGTGCTTCTGCTGAACATTTGTGAACTATCTTCCTCAACTCTCATT TTTGTCCTTTGTATCCCACCACATGAATAGTTGCCAATTTGTATTTGCTTATATCTTCCATTGCCCCTGAACCCATGCTGACACCATTGGATAATTCAAT TTTATTCGAGAAAATAATCTCATTTAAAATAATGTGATGGACGCATAGCTAGGAGGTTGAACAATTCAAGTTCAATGGTTATATGTTTTGAAAGCTCATT GATGTCATTGTTACTTGTAAGTGTCTGCTTAATGAGAGGGTGTGGGGACCGATTCCTATTCACCTCTGAAATTACACGTGCTCCGTTAATTGGATTCTTC TTTATTGTTTGGGGCTACATTTGGTAGTTATTTGTTTTTTAATTTATAATTTCATTTTCTTTGAGATACATTTTGAAGGGAAAAGAAGCCATTGTGTAAA ATAATGTGATCGGTTAGAGTGGAGGCTATCACTCGATTGTTTTTTATCTCAAGTTATTATGCAATTTAAAGTAGGTTGTGAATAATGTATGTGACTAACA TCGTTGGATTTTGGGCTTTGCTAGCTGGAGGCTATATAAGACTTAGATAGTAGATTAAATTATTGAGGAAAAGTCTAGTGTCGGGTTCAAGATAATATAC CTCTAACAGAAGATTAGGACGTTGCAACTTATGCCTTGGCCTATTATAATCAAAAGATTATTCATTTTTTATTGTTTGGATTTGATATTATATGTTTGAA CTAATTCTAATGGAGATGGACATAGGAGGAGGACGTGAAATGAGGCAAAAGACAACGCGGCTAGCCACATAGCGATTAGGCACAGGCCAATTTGATCGTA GTTTGTTAGCTCTTGAATTGTATTAGAGAAGCACAGCTTTATATTATTAATGTTTCTGGCTCGGACATGATTGCCTCCGGTGCGAAGATCCTGTAAGAAA CAAAAAAAAAAGTATTGTTGGGTGTTGCCAAACAAATTTTGTTTGAAACACACTGCTGATGAATAAATATATTCAGACTTATACTGATACATGGGGTAGT TAAAAAAACGTAGTTCATTAGTTCCACTTGGTACTTTGTTCTGCTAAAAAACTCTTGGTACAACCAACCATTTCCCTTTATTAATTCGTACGCCTTTTCT ATGTTCATTTCTTGTCTCCTAGCATTTGGAATGGCTTCAACATTATGAAGCAAAATAAATTATTCGTAGTAAAAATTGTGTCACCAAAATCTGAATGGGG AAAAGTAGTTAATTCACGTGGATGGAGTTGGAACCTGATTTCTTTTTTCGATGTCAATATGCAGATTCTTTCATGGGTTTTACAGTAAACATTTGAAGGT AAATAAAAGACGCTCATTGGGTGCAAATTGTCAAAGATTTTTCATGGCTCTTTCTGACTGCTGGGAGGTACACGGGATTTTAGCCCCATAACCAATCTTA ATCAATTGGTTCCTCATTTCATCCTGGTGTGTGTTCTTGGTTTATTTTAGAAGTTCATATCATAGGATAATATTAAAATGGCAAACTAATAACGATGAAA GCGTAATTTGGACCATTGAGTGATTAATTAATTACAGTGATATTATCATTCTTTTTTCTCCAAAATTTCTTTTTTAAACCTATGTCATAACTATTGATTT TCATTTTGAAAATAATGTGTATAAATAATGTGTAAGAAGTGTTGTGATAAATAAAAGTGGTGATGCCGTGAATCCGTGATGTCAACATTGTCCAACTTTA TTTTATTCTGG BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_169111; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_354516
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Probable galacturonosyltransferase-like 7 from Arabidopsis with 77.37% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019441317.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |