Ll_transcript_354868

• Id Trinity: TRINITY_DN49425_c1_g1_i7
• Name Transcript: Ll_transcript_354868
• Sequence: TTCGTTTCTTTCCATTTTTTTTTTTTTTTCATTCTCTGAATATAATAATTACGTTTTTTCTTTGTTTTTCAGATGGCATGGATTCTCATCATTGCTTCTC TCATTTCTCTTTGGATCCTTTCTCTTTTCAAACTCCTCCTTTTCTCCCACTTCCCTTTTTCCAAACACTTCAACCATAAGGGTCTCTTTTCTTCATTCTC TTTTTCACTAAAAATCACTTTTTTTAACTGAATTTTAATACAAAATGTCGGAATGATTGAAATATGTTATTATACGAAGTCTTACATTTCCGGGTATTAG ATATTATGACTTAACTTCCTTATTATTACTTGTACTGCACCAATTAGAAACACATCATCAACATTTGGGTTTACGAGTGTGCTAGAGCTTGTAATCCTTA TTCTCTTAATATATATTGCTAGTCTGTAAATGCTCCTCGGGAGGTAGACACGATTGGTAGAACCCAGTTAACAAATTCTTTTATTGTTTAGTTATTTATT CTACGCTCCTTTATTTGATTGCTTGTGGTCAACACAAAATAAGTTAAGTGAATCACTTCTATTTTCTAAGAGAGTGAACCCTGACACAAAGGTAAGGTTG TTGCAGTGATCAAGAGGTCACAAGTTCAAATCCCGGAAAAAGCCTCTCTCACTTGGCTGCGTACATCTGCTCAGAATCATGCGCTTGGCCGCCTTTTGAT TTCAACTTTTATTTTGCTTGTTTGTTTTTAGGTAGAGCTCTTCAGAAGAGAAATGTCTTGTTGGTTATTGCTCACCCGGATGATGAATCCATGTTCTTCA CGCCAACTATAAATTTTCTGACTTCAAGGGGGCATAGTGTTCAAATACTTTGCTTATCTGTTGGTGATTAACTTTAGATAATCTGTTTTTTGTTTTTTTT TTTTAGTTTATATAAGTTATGTTATATGTGTTTTGTTGATTGATTGTTATTTTTGCATGTTACTCATTTTTATTCATTTTAAAATAATTGTGTTTTTCTT TCTTCTATGGTTAAAGCTTTGTCGAATCTATATGAAATTGATAAATGATGTCATAGTGTTAATGTTAGGTCGTTGCCTAGAGGCAACACATTGTATCGTC TAGGTACAAGGTCAAAAGAGCAAGGGTCGTTGCATCGCCATCTAGGTATAGTGAAAAATAAACACATCTTCGTGATAATATTTAACTAAAATAGATAATA TGTAAAAACGAGTCCAGTATTATTGATTAGATGATAATAGACATGTATGTTATATTTACGAAAGTAATAAACTGCTGTAGCATTAACAATATAGCTTAAG CCTGACCTTCATAAATCAGGTTTATTCTTGTTATCAATTTTTACTGTTTGCATGTAATAAGATTTTTTCTTCTTTTTCTCTTCCTATAATTCGGTCTTAG AATGTCACCAAATCAAATCTTCAAGTTTTGCCTCTAAGAAAGGTTTAACATTTATATTAAAAATCATTAGATAGTTTTATATGTTTTGATTTAATTATTA TTCTGCAGGTGATGCAGATGGCAAAGGAAATATCAGAAAACAAGAGCTTTTTCAGGCTTGCGTAGCTCTCAAGGTGATCTATAAAATGGTTTTAAAACAG TTATGGTTGGAACATAGTTTCAGATCTTATCTTCAAATATTAGACATTGCCCCTCACCTGAAATTATTTTTTAGTTTTCTCTTTTGATCATTTAGTGGTC ATTGCTTTCCTATCCTAGAACCGAATTTCTTGGGTAAACTAGAGACCCTTTCATCCAGAATTTTCCTCGCATAAGTTGAAGATGACACACTGTATAAATT TAAAATGGCCGTCTTTTGTATGACATTGGACATTGTGAGCACAGGTTCCCATGCAGCAAGTGAAGATTTTCAACCATCCAGATCTGCAGGATGGTTTTGG TAAAGCTTGGAACCATAGCTTATTGGCAAATATTATTGAGGAAGAAATAACCACTCACTCCATTAATATGGTTATTACTTTTGATAACTACGGTGTATCA GGTCATTGTAATCATCGTGATGTGCATTATGGAGTATGCAAGGTACTATATGATACTTTACAAAGAGATATTGAAGTTTGGGAGCTTGTTAGCAATAATA TATTGCGCAAGTATAGCGGTCCTGTCGATATCTGGTTGTCTATGCTTTGGCCTATACTGCTCTCAAATGAAACAATGCAGTGCTTCGTAAATGAAAATCC ACGTAGGAGCTATCTCGCTATGGCCCAGCATGCAAGTCAATGGGTGTGGTTCCGCAAGCTTTTCGTGACCTTGTCCAGTTATACCTATGTGAACACTCTT AGGAAGATCAAGTAATGTTTCGACGCCGCCGGAAGAATTAGATTGCTTGTAGCTTGTGATTATCTGAGATCAAGTAAGCATTCATACTCGTATTTGTTCT AACCCGGTTTGGTATCTACATGATTGTACATCAACTTTGTGCTTGGTTCAAGCTAAACAATGCATGGCACTGTGGCTCTAGAACCTCACTTCCTCTTGAC ATTCTTGAAAGAAATGGCTGCAATATTTCTTCATATTATCCTAGATGCATATGTTCATTAACATTGCTCAGAATTTGACTCAGTTTTTGCTTTTTTTTGT TGTACAATTGATTGTACTGGTTGAGTAGCACAATAAATGCTGTTTACTACTGATGTACTCTCACAAATGGCTATTACCATCCTTTGTGGTTTTATCTTGA GTCACACCCACAACCTAATGCTTGTAAATGTTCTGCAATTATATTTTGTGATCCTTCTTTCAAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_169252;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_354868

FPKM

• PAB: 0.2
• PNAB: 0.4
• PS1: 0
• PS2: 0.2
• PS3: 0.2
• PW1: 0.3
• PW2: 0.2
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_354868

• Blastp: Probable N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol de-N-acetylase from Dictyostelium with 31.98% of identity
• Blastx: Probable N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol de-N-acetylase from Dictyostelium with 31.98% of identity
• Eggnog: lmbE family(COG2120)
• Kegg: Link to kegg annotations (DDB_G0293136)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019447785.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;