Id Trinity | TRINITY_DN49449_c0_g1_i11 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_354123 |
Sequence | TTTTATTTTTGCTATCTCTATATGCACCCATTTAAGTGTAGGTTTTGAATTGTTTCCACCATGATAGTTACTAGTTATGCACTAGAATACCAATTAGGGC TCGCCAAAAACAATGTGGACTCTTTTATGTGATATATTGAGATGGATGAGCCCAACAAATTCAAACCCTATTTGTATGGATTTTATTTTGGCAGAGATTG GTCCACTTAAGTTAACGCTGATTGATGGAAAATGGGAATATGCCATTTTAGAAATGCGTTTTGTTCTCCAGATTCGTCAAAAATAGTAACAATTTAGTAA AATTTAGTCAATTTGTAACTGTCTTCATCTAATCTCATTCTTTCCTATCTATAAATAACAAAAACAAAAACAAAAAAGGAGTCATTTGCAATTTGCAGCA ACAACCGCAAATCGCAAACTCTCTTTTCACCATTCAACGATGTCTCTTCCTCCTTTCTCATCGCTGCTATTGCTATCTCTCGTGTTAGCTACGGTTGCGT TCGTTTCTTCAATCGAAGAGTTCGATTTGGATTTGGATTTGGATTTGGAAAGAAGAGGACATAGACAGAGAGAGTTTGATTATTTCGCTTTGGCGTTGCA ATGGCCTGGTACTTTCTGCCAACGTACACAATATTGTTGCTCCTCTAATGCTTGTTGCAGAGGATCCAATGCTCCAACAACATTCACCATACGTGAGTAT CACTTTTAAAATATGACGTTGCTGTTTCGAATGTAGACCATATGGAATAGTAGGTAGCATAGTGCTATAAAGGATAAACTCTCACTATGTGCATTGTGTA GGGAAGGGTTGGACCCATTTTATGGCTCTGTATTAGGCAGCCTTACCTTTTGTTGATACGAGATTGAGTTCACCTATGATCTCATTGACTTGTGGATTGT ATAGCGACCACTCCCATCTGTTGCACAAAGACCATTATGGGGTCTAGAAAAATTCTTAAAATATGCCAGTGTTTCAAACCATTGAGAAATTAATTTGATG TGTGCCTTTTTCCCTTGGTCAATCCTTTTCTCACTCATTTCTTCTGGATCTCACCTTTTGTGTTTACATTGTTTTTATTTTAAAAATTAGCAGAGGTAAG AAGTATTTTGACCTTTTACATTTCTATTCTGAGTGTGGAGATCCTTGCAAGAGAAACTTAACGACATCATATCTACTTTATGATAGATGGACTCTGGCCT GATTATAACAATGGAACCTGGCCAGCGTGTTGCACTAAATCTTCTTTCGATCCAAATGCGATATCAACATTGACTGATGCTTTAGAGCAATATTGGCCAT CATTAAGCTGTAGGGAAGCACCATCATGCCATGGTGGGAAAGGTTCATTTTGGGGTCATGAGGTGGTCTTCAAAATTCATGTAGCTTCTTATTTGAACTT AAATCACTATGGATTCTAATTATTTTTTAAAATATCTTTTTCAGGGGCTACCACATCGGTTCGCATTTGCAGTGGGAGAAGCATGGGACATGCGCATCAC CTGTGGTTAGCAACGAATATGATTATTTCCTGACAGCGCTGAACGTCTATTTCAAATATAATGTCACAAAAGTTTTAAATGAAGCTGGATATGTTCCATC TAACTCAGAAAAGTATCCCATCGGAGGCATTATTTCTGCCATTGAGAATGCTTTTCATGCATCTCCTCAAATTGTTTGCTCAAGAGGTGCTGTGGAGGAA CTTCGTCTGTGCTTTTATAAGGACTTCACGGTTGGAAATCTACCTTTGCTCTGTAATATATTCAGCATATAAGAAACTAAAAGACGCTGTCCAAACATTT GCTTTATTCACCATTGAGATTTAGATACCAATTAGTGTTGTTAAGGACTAAATAATTTAGTCTGTGGTAATTGGTATTTTCAACTACTGATATGATTATT GTTCTTCCTGTTCAGATTTAAGGCATTACTGAAAAAGATTCATGAGTTATACTTGTGAGATAACTAAGCTGTTTTGTACTTGTAGGATAGTGCCATTTAA TTCGAAACTTATAAATTCTGTGCAAATTTGGTTTAATTTTAGAAAATGAAGGAAAAGCCACACTGTACTGTAGAATGTATTACTGATTATGATAGAATCT CCATGACCTTGTACTCTGCAGGGTACTCTATTCAAACCCAATATTTTGGCAAGCATAATTATTTTAGCACATTGTCCTTTTTTTGCAGCCACGAGATTGT GCTGTTGGACCTGACAATAAAATTGACATCGTCGCTTCAAAAGGATCATGTCCCCAATATGTTAGCTTGCCGGAACTTGCATCGCCAGGTTAGTTCACTG TTGTTCTATCTTTACACCAGTATAGCTATATTTCTATTTCGTAATATTATAGTAGATTGCTAAAAGTTACACATAAGTGGTCTTGTTGGATTAACATTGA AGGAAGAAACTGGTCTGGGGTCAATTCCAGACCCACTAAGATTTACAAATGATGTGTGCCTGGTCAAAATCCTGTTGTACGTTGTGAGTATATCTGAAGC TAGTTTACCTGAGGCCACATAGAGGCACCAAGTTGGTTCAAATACCTATTTCACTATTAATACTTGGTTCAACACCACGTGCGGGGATTGATTTATCTGT ATCCCTATTTTTCAAATCGATTTATTCGTGTCGCCAGTAATGACATTTATACTTCAACATGCTGATTCTGACTTGACTTATATACATGATTCTTTGTCAT TTTCATCATTTGAACAATAAGCTTTATATCATTTTGTCACAAGCATTCTAGGCATCTGTATCACTGAGAAAGAGTCAAAGAATAATTTTCCTTTTCCTGA CAGAAGAAATTCATAAGATAAAAAAGATGCACAATTGTGAATATGATAAGAAATTTACCATATAAGACTACAACAACAAAACCTAAATTTAGGGGTGTGG GTGGGGACTAAGTATTAAGCAACTCTTCCCAATCTTTGGAAACCCAAGAGCATAACACCATTCCAGCAGTCATGATTTGAGCATAACACCAGAGTCCAAA AACTATCTTGGGGCAAAGAAATCTTTTTAAAGATATGATTGTTTCTCTCTAACTATACCATGGTCCTTGCCCTCTCTCCTAGAGCACCTGGCAGAAAAAG TCCAAATTGTGCACTGAGGTTTGTACCTGTGATCTTTGCAAATGACTTTTAGCTGCAACATTGAGTATTGTGAAAGTTACTTGAGTTTGGTACACACGTA CAAGATTGTAACTGGCATCACGTGTTACTCATCTGAGTTTCATGCCTTATGTTTTGCGTCATTTGATACCTTTCATAACATGTGGAAGAGTATCTAGAAA TTGAAAATTGGATATTTTAAATTTGCTCAGTGGCTGCTAAACATGGGCATAATACATGCTTAGAAGAATATGGTACAGACAATGTGTGTTCCAAACACGA AAATCGTAAATATCCATGCATCTTTTAGTTTTCTAGGATTCAAAGATGGTGTTTATTGTATGACTTAGCCGCTGTTGACTTGGCTTCAGCTCTGGTAGTC CATAATTCGGTAATCTAGTGCTATTTTATGGCTGTCTAATTTATCATGGCCAATTGTTAAGTTTTCGCTTAGTTGATGCGTTGATAGAACTTCCCTTTGA TTTAGAACAAAATATGTAATGTGATAGATTACTCTTTCCCGAAAAATTTGTTGATCTGTTGAGAGTAGCCCAACATTGTGTAAGACAATTATCAACTGCA TTTTATTAATATTATACAAATCTTTGCATCTGTAGGACGTGATGAACTTCAAAGTTGGGTGTCTGATGAAGCGGCTCTTTAAGGTTATGGTAGAGTGCTT CTATTTGTAGTTTTCTGTAACTTGAGAATGGACAGCCACATTCATAAATAAGTTTATATGTTGTACCATTTATCAATTTGGAGAGGAATGGTTTATTGAA GAGCTGGACATTTGGGTTGAGACCCATGCCAGATATAAACCTAGCTCCAAATTTGAAGAGATGGCTAAATGTATTATTATGGATCTACTTCAATTTCTAA GCCTGCTTCCATGTTAATGGGCTGGGACTTTATCTGTATAATAAAGCGTGTTGTTTTATCAATAAGGAATTGAGGATAATATATTATCCTCATGTACTTT TTATTATACATCTCTGTTTCTTTAAAAGCATTTACGTTTTCCTTGTATCACAAATGATGTCAAGCACAAGTACATGATGAACTACAAG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_169467; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_354123
Blastp | - |
---|---|
Blastx | Ribonuclease 2 from Arabidopsis with 67.44% of identity |
Eggnog | ribonuclease T2 activity(ENOG4111M7G) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G39780) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019460218.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |