| Id Trinity | TRINITY_DN49463_c2_g1_i4 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_353665 |
| Sequence | GTGGCAATAGAGTCAGTATGGAACATACAATTTAATTGAGGAAAAGTGGCAAGAGATAATAAGGGAAAAGTCATACCAATAACAGTGATAAGATCCCCGT TGTGGTAAAATTGCATAAAAGGTATGGTGTAATCAGAAAAAAATTTTCCTAAAGTTTATAACTATTGTGCCCAAGAACTATGTCAACCCCTTGTATAGGT ATAAGATAGAATGATACTATGAAAGTATATTCTGCAACTCTGAGTGGAACATTTGAACATAGGCCAATACATTTTAAATGGTCACCATTGTAGACCATAA CAGAAAATGAAAGCAATTTTTGAATGGATAAATTCAAGAAATCAACCACTCGAGGTTGAATGATGTTATGTGAACTTCCTGGGTCAACCAATATGGAAAC AAAATGCCCTTGTATGTGAGCATAAAATCTGAGTGTTTGTGGTGACGGTTGCATAGAAACTACTTGTAGGAAGAGGTGGAATTGATCAGATTTTGGTTCG TATTGTGTAGTGTCAAAATTGGTGAAGAATGGTTTGGATTGTGTAGTGTCAAAATTGGTGAAACAGAAAATATCCTCAGTAGAGGAGTTAGCACCAGGGT CTGGTGGTTCATTGTGAGCAAACAAAAACAATGGGCTAATCTTATAATGGTGGCCATGATGGTATTTCTCATCACAATTGAAACATAATCCTTTGATTCT GTGGGAATCCATTTCAGTTCGGTTTAATAAACGAATTGGTGGTGTACTTTTGGTGATGGAAGGTGGTATGGTTAAGGGTAATGATGGTTGTGGTGCATTT GGTAAAATAGTACGAGGTTGTGGTGGTGGTGTGGGTAGTATAGGTGGCATAGATCGAGGTTGAGAAGGGCGAGGAACATAAGCTAAGTTTGTGTGTGAGA CAAATAATTTGGTTTCCACCAATTTGGCCAAACTAATGGCTTCCGAAATAGAATTAGGATGCAATATGGCTAATTCATTTTGTATGTCAAGGTGTAAACC AAAAATGGAGGAGTCCAAAATGGAATGAGGAGGCAAGCCAATGACATAGTTGCACAAACGTTCAAAATCACATTGATAATCTGAAACTGATGTGGCTTAT TGCAAATTAAATAATGCTTGTTGATGATTTTCATATGCAGATGGCCCAAATCTAAGTTCCAAAGAATGCACAAATTCCTCACAAGCTGTAAGCAAATGGT TGTTATGCATCCATTGGTACCAACCAAGTGCATCTCCTGTCATATAACAAGAAATTTTGGTGAGACGGTTAGGAGGAGTGATTGAATAATGATAGAAATA TTGGTTGGCATGGAAGATCCTTTCCATTGGGTTAAATTCATCAAAAGGATGAAGGGTCAATTTAGGGGGTTTAATGGTGTTGTCTCTGTTTGGTGGAGGG GGAGGAGATGTTTTTGGTTTAGGTTGTAAATTCTGAAAGTTCTGTAAATAGGATTCATGGTGGAGATCTTGGTGAGTTTTGAAATCATGGAAAGTAGTAG TGAGGGATGCAATTGAGTGTTAATGTTGCTACAAGTCTTGTGAGCGAGTATTTATGGTATCAATGATGAAAGCACTAATGGTATGTTGATGAGTATGACA ATGATGTTTATTCCAATTTGAGAAGGAACAAGTCTCCTAAGAAAAGAAAGGAAGAATGTAATCTTGTCTAAATAATAGTTTCCTTATTCATTTCACAACA ACAATATTATATAACCAATACAAATAACTTATTCCCTAAGATTAAGGATCAGATGACAGTTTCTTTATAACCTACAAATTTAAAACTGTAACTTAATAAC TAACTATTACATTTATTTAACATAATGTGCATGATGTGTAGGAGGCTTTGTCACACGTTTGGGTTTATTTGCAGCAAATGAAGACCCAATCTCAGCAATA CTTCTTTGTGCAGTAGGCCCCTCCGTATCAATGTACTTGTACAAATGTTGTATCCAATTTACGAAAGAGATTGATAAGATCGAATCAAACCTAAAAAGAC TTAATATTCAAATTCTTCTTCGAGATTTTGCATTACCTTACTATTTTCTTCTCTATTGTAGGTAAAACCCCATTATCTAACAATTTCTTCAAAGATTGAG AGGGATATTTGTACTTCGTAGTATCCTGAGGAAATATTGTAGATTTAGATGGTGTGAAACAGAGATTCACTATCCCTTTTTCGGTTCTCTACAAAAATTG CTAGGAAAATTAACTTGTCTTAATGAACAAGTACAAGCAAGATTTGCACAATGACAAAATAAATGGAAAAGGAATAGATTTCGATGTAAATATTGCCATC CTACTTCTATAAAGATGATTAGATTTTAGATGCATTTGTGGCTTGTGATTGAAGCTACAAAATTTGATGAGTACTCAAATGTATTATTGGCCATAAAAAT TAGTGGCAACAAAATTCCAGTATATGCTTTGCCTTTTATGCAAAGAATCTACTTTGCCC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_169573; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_353665
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_020222119.1) |
| Pfam | Retroviral aspartyl protease (PF08284.10) |
| Rfam | - |
| GO | - |