Ll_transcript_353530

• Id Trinity: TRINITY_DN49490_c2_g3_i21
• Name Transcript: Ll_transcript_353530
• Sequence: GAGTCTTCTTGGTGAAGGTGGTTTTGGTTGTGTATTCAAGGGGTGGATAGAAGAAAATGGATCTGCTCCATTGAAACCTAGAACTGGGCTAACTATTGCT GTAAAAAACGTCAACCATGATGGGCTTCAGGGGTCATAAAGAGTGGCTGGTTGAAGTAAATTTTCTCGGTGATCTAGTTCATCCAAACCTTGTTATGCTT GTAGGATGCTGAAGATGATCAAAGGTTGTTAGTGAATTAGTTCATGCCTCGGGGAAGCCTTGACAACCACTTGTTTAGGAGTAAGTAATATTTTTTTGGG ACTAATTTCCTCATTTTATTTATCAATAGTAATGTTTGGACCACTATTGCATCTTGAAATTTAGACGACCTAATGTCTCGTGAAGTATGGTTGCTTACAA ATAAAAGTTCTGATAAAAAATGTTTTGCCTTCTGACATAAAAATAAAATTACAACTAATTTATATCATTGTAATGTTGTTTCCATCAATAAGCATACTAT TTCTATGAGTATCTCACTTGTTTGTTGCTGGATTTAGCAGCTTTCTCTAGCATGCTAGAGTCATGACGGGAACTTAAAACTTTTGCTTTATGTTTAGATT ATTTTCTTTATTTATGTTCTCCAGTAAAACTTATATGATATAGATTATTTCCTTCCATGAAGAAGCTGAACTTTATTGGTGCGTTATAATTTTCTTTTTT ATCCCATCAATGGTGTATAAATACACATTTTGTAATAATATGTAATTAAGTCCTTAGCACGAAATATGAAAATGACTATTCTCTCCATTATATGATGTTA ATCAATCTTTCTATCATTGAGATGACCAAATGCTAAGACTCTCGGCACCTTCATTGCTGAAACAGGACAGTTCATATACTTCTTTTTTTATAAAAAATTT GTTGATTTTGGTTTGTATGTAGTATTCAATGTTGCAAGATTTACGGGCTATGCCGCCTGTGAATATTGCAGGCTTGGTTTCTTGATTTGGGGTACAGTGC ACCATGGGGTAAGGCTTCATTTCATATTAAAATTTTTGTTGAGTAATTAGTATAGATGGAAAAGTTAAACTGTTAAAGTATACGTGTGCTAAAACATACT TGTTTTAATCTTTGCTTACAGTGGAATTGGGAGACTATAGTGATTGGAATATCATTCTTGATCTACCTTCTAATAACCAAGTATATTGTAAGAATGCCAA CAATTTCAATTTCCCTTCATTCCTTATTCCTTTCTATTTTAATTTTCATAACTGTTGTGTTGTAATGGACATGCTAAAAAGAGAATTTGGGTGGCTGCAA ATGCTAAGGTAAGATCAATATTAAGGGATACTTCTTCCTTACTCATGGATACATTATAGGAATTATGACTAAAAGCATATGCACTGCTCACATATTGCCA TCATTTTTGGTAAAAGAATTGATATTCTTACTCTATGGTCCTCTCAAAATAATATAGAATTGTATGAGAGGTTTCAATTTTTGAATGTCCTTTATTTAAC TATGCAGGTGCTGAACTTGGAAGCCATGGATAAATTCCACACCAGTGATCTACTACATTTGATATTCTCACTAGAACCATATAGTTTATCATTGTGTATA TGCATTTGATATACATCA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_169772;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_353530

FPKM

• PAB: 1.2
• PNAB: 3.6
• PS1: 2.6
• PS2: 6.7
• PS3: 5
• PW1: 2.5
• PW2: 6.2
• PW3: 13.4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_353530

• Blastp: -
• Blastx: Serine/threonine-protein kinase BIK1 from Arabidopsis with 63.64% of identity
• Eggnog: Serine Threonine protein kinase(COG0515)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G39660)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_013450927.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;