Ll_transcript_405325

• Id Trinity: TRINITY_DN49501_c0_g1_i12
• Name Transcript: Ll_transcript_405325
• Sequence: AGCTAACCCATATAGTTATTTATATGTCCATGTTCATCCACTTTTTCTCCATCCCCTCTTTCACTCTTCACCCATCATCAACACTTTCTCTCTTCAACCC AACCAAAAACATGGCTTCAACTAGATCAAAGACCTTCACCATGATCCTCATCATGCTCACACTCTTAACCCTTTCATCAGCCATAGACATGTCCATAATC TCTTACGACAAAACCCACATGAACAAAAACAACGACGAACTCATGACCCTATATGAAGAGTGGTTAATAAAACATGGTAAGCAATATAACGCACTGGGTG AGAAGGAAACCCGGTTCGAGATATTTAAAGAGAATCTCCGGTTCATTAACGAACATAATAACGGTCTGAACCGGACCTATAAGCTTGGGTTGAACCGGTT CGCTGATCTGAGTAACGAAGAGTATAGGGCTAAGTTTCTTGGAACTAGGCTTGATCCTAAGAGGAGGATGGTTAAGTTGAGGACAAGGAGCAATCGTTAT GCGCCACGTGTCGGTGATGAGTTACCGGAGTTTGTTGATTGGAGGAAAGAAGGTGCTGTTGTTGGAGTCAAAGATCAAGGAAGCTGTGGTAAGCACTATT TTTTTATAGTATTTCATTTTTCTAACTTTTTTATTTCTTCTTTTACTTCAAAAAAGACATAAAAGTATAAAAATATTGATCTATTATAATTATAGTTGTT TTATCCTTTGAAAACATAAAATATGGAAGGAATTGAGCATTTTATGTTGTTGTTGTTGACTTGTTGTTAGAAATATTAAATTATTTATTAGATTATACAA AAACTTGAATGGTAATGGAAAAGAGACTAACAAAGTTTTAATTTTGAAACTCCCCTTTTGTCAGATTTGTATGTAGGATTGTTGATTTTGTTTCATGATT TGACTATATGAAACTATCTTGGATTGAACCTGTTGAATCTTTACGTATGATATGATTTATGATTGTATTTTTTATAAGAGTTATACTTTCTCGTTGTCAT GTTTGCTCAGCTGAACAAACTTCATTGGTAGAAATTAATGAAAAATAGAAGTGTTTTTATTAACCATTGCATTTAAGAACTCCAAAAGAGTAAAGTTAAT ATTGAAAAAGTGAAAACTGATTTCTATTTTATTAATACACCATTTCCAAAGTTAAATTTATTGTTTTGGGTTATTAAGAAAGATAATTGTCACCAAAATC CCAAAATAAATAAAATTTTACCTACAAATCTTTACATTCTCTAAATCAGTGGATTTCCACTGTGATTGCGGTCTGTGGAACTTACCCGAAATTTTTCGTT GGGGTTTCATGATTTAATAAAAGAAAAAAATTGTTTGAGGATATTTTTATGCTTCCAGTATTTGTAATAATCAGATAAATTTTGAGAAAAAGCGAAAACA TTTAAAATAAACTGTTATATTGCTTTTCTCAGAAAAATACCTCCTAAAAAAACCATATCACATAATCACTTATTAGTAAAAGCTAAACAAACTGGTCCAT CACGTTATCAAGTAATATTGATTTTTTGGAAAATGGGACAAATGGGGTTAACATGAAATATTTTTCCTCTATTAAGCCTATCATCATCTAATATTACTCT CTTTAGTCTTTATCTGACCAAAAAAGTGTTTTTACTTGGCAAAGAATAATCAACATGCTTGACTTTTCCCCTACGTAGATTATTAATAACAAAAAAATCC TTTATCCTATGATGAGTAAGTCATGGTTTATATTATACATTTGACATATGATTAATAAACATTGTATGTTTTTTGTTTGTTTTTTGATGTAGGGAGCTGT TGGGCATTTGCAACAATAGCTGCTGTTGAAGGAATAAACAAGCTTGTAACAGGTGAACTGATTTCACTATCCGAACAAGAGCTTGTGGATTGTGATAAAT CATACAATCAAGGATGCAATGGTGGAGTTATGGACTATGCCTTTGAGTTCATAGTCAACAATGGTGGTATTGACTCTGAAAGTGATTATCCCTACAAAGG TGTTGATGGTACATGTGATCAATACAGGGTTAGTCACTGAATCTTGGTTATTTGGTTTTAACAAATGCTTATAAAAGATTCTTACCATTCCAATGTTTGA TTCTTTTTCTTGTGTGCAGAAAAATTCTAAAGTTGTTGTAATTGATGAATACGAAGATGTTCCTGCATATGATGAGAAAGCCTTGCAAAAAGCTGTTGCA AATCAACCTGTGGCTAATGCTGTTGAAGGAGGTGGCCGGGAATTCCAGTTATATGAATCTGGTATATTTACGGGGAAATGTGGAACTGCATTGGACCATG GTGTTAATACTGTTGGTTATGGTACAGAAAATGGTAAAGATTATTGGATTGTGAGGAATTCATGGGGTCCTAGCTGGGGAGAAGACGGCTACATCAGATT CGAGCGTAATCTAGCCAGTAGCAAATCTGGCAAGTGTGGAATTGCAATTGAGCCATCTTATCCTGTTAAGAAGGGCCTAAATCCTCCGAAACCTGCACCG TCGCCGCCGACACCTGTGCAGCCACCATCTGTCTGTGACAATTACTATACCTGTGCTGAGAGCACTACTTGTTGCTGTATCTTTGAGTTTGGAAACTCTT GCTTTGAGTGGGGATGTTGTCCTCTTGACGGTGCTACCTGCTGTGATGACCATACCAGTTGCTGCCCACATGACTATCCCATCTGCAACGTTTATGCAGG AACCTGTCTTAGGAGCGCGAACAACCCATTTGGAGTGAAGGCATTGAAACGAACTCCAGCTTTGCGCCGCAGTTCGGTTGGAGTGGAGAACAAGATAAGC AGTGCTTAAGCTGTATAAGCAAATGTGTACGTGCAAAAGGAGTGAATAATGAATTCAAGGGAGGATGAAGGACTGCAACTCTAGTTGATAACTCTTTTCC TTTTGTTTTCATTCATACTGAACTATTCACATAAATCTCAGCCATTATGATACAAATTGATACATGCTGTGTCAAGTTTCAATAACACATTGGCTTTGTA CATAGGGTTATTTTCTGTGCTGTATTTGTATTCAAATTTCAAACAAGGAACTTCTTGATTATTGTATGTTTTAAACTTATATAATTATGTGATCAAGCAT CACTAAACTGTTCCTATTCAGTGTGTCCTTTTCTTCATTTGATTATTCTATAAAGTTTCAGTCTTTTTGTATAAGTTTCCAACCTGGTTATGCTCCAGTT GGCCATAAACAGTAGGGTAAGCAAGAAATTGCGAAGGAAATGTTGTTGTATAATTCAGTTTTAGCATTGTTAGTTAAAGTTGCCATTTATAGAAGGGTAG TTAGTTTTCAGGTTGTTAAAAGTTACTATAATTAGAAGGTGTGTGAAACTCATTTAACACATGTGTAAAAATTGATTGCTATAAGTTTGTAAGCTTTCTT TTTGATGAATGAGATCACATAACAAGTTATCCTTTAAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_169877;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_405325

FPKM

• PAB: 7.4
• PNAB: 1.8
• PS1: 1.2
• PS2: 0.1
• PS3: 0.6
• PW1: 1.6
• PW2: 1.6
• PW3: 1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_405325

• Blastp: Oryzain alpha chain from Oryza sativa with 73.49% of identity
• Blastx: Oryzain alpha chain from Oryza sativa with 73.49% of identity
• Eggnog: cathepsin(COG4870)
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019447132.1)
• Pfam: Papain family cysteine protease (PF00112.22)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;