| Id Trinity | TRINITY_DN49544_c2_g1_i19 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_405566 |
| Sequence | AGAAATCTGTTGCTGCTGTATCCCCTGCTAATGATGAACTTGCCAAGTGGTATGGTAAGTCTTCAAAATTCATGTCTATGGTACTAACTTGTAAGTTTTT AAGTAATGTGTGATTGTGTGTATAGTTTTTTTTATGAGTTTAATATCAACCTTTCATTTGTATTATTTTTTTTAAAAAGTCAATAATAATAAAACGTGAA TGGTGGATGATGCAGGGATAGTGTTTGAAATTTATACACTATCGGTGCATAAATTTTTTTTCTTTTTTATTTAGATTACTCTTTCACATTATCTTTTAGA TACTAAACAATAATGTGGTGTAGTAGTGTGTTGGTCCAGGTGGAAGACTGTCTGGAGCACGTCTTTTGTCCCAAAAAAGTGTCACTCTTAAGTTCGATCT CGATATCCAAAATGATAATGTGATGTTCTTGTAAGAGAGAAAATTGGAATAGACTTGGTTCATTTGAGTATATGTGATGTTCATTCAAGAGGGAAATTTG TATAAACTAATATGGTGTTCATTTATGAGATTTTGTTTGCATAAACTCGGTACATTTAAGTTTTGTCCACTAGGCCAATATGAACATATTGTTACTTATA CAGTTATACTTAATTATTGGTATTTTATATTAATTCATAATGTGATTGGTCTATTGAAAGCAAGTTTATGTACAAATTTCTCTATCTAACAGTAACAATG TACGTTAAGGTAGAAAACTAAATGCTAACTTTTGCTGCCATTTGATGTCAGGTCCTGACAGGAGGGTCTTCTTGCCAGAAGGTCTCTTGGACCGATCTGA GATCCCGGCGTACTTAACCGGAGAAGTGGCAGGAGAGTATGTAGTTTATAATGACACGCAAGTTGCTGAAACTAGTTTATGATGCTTATTGAATTCTTGT TTTGCTTAATTTTGTTAATGTGTGCCCATGCAGCTATGGTTATGACCCGTTTGGTCTTGGAAAGAAGCCTGAGTACTTCGCCAAGTATGTCAAACAATCT AAAACTAGATATCTATGTTATTTTGTGTTTCTTCAGTATATGCTTGTATAAAGAAGGGTGGTCCACTGCACGAGACTCCCACTTAATGGGGTCTGGGGAG AGTAGCCGTATACAGTTTTACCCCATAAGCAAAGAGTCTGTTTCCATAATTTGAACTCGTAATCTCATAGTCATTAAGCAACAACCTTATCGTTGTGCCA AACTCACTATTTGAGGATATGCTTATGTAACATTAATTTTGTGGTAATGTGTCTTGGTCCAGATATCAGGCAAATGAGTTGATTCATGGCAGATGGGCAA TGCTGGGTGCTGTTGGACTCATCATTCCTGAGGCCTTTAACAAATATGGAGCTAACTGTGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGGTTTGCAACCTCTATCA CAAAACTTGCTATTTTCGTTATTAATACTATAGTTACATTTTCGTTATTTGAACACTCAGAATATGACATTAACACAATATCTAACTCACATATACATAT AGTATATTCCTTGGTTATATGACACTCAACAAATGAAATTTGATATGTCATTTCCACTAGTATGCATTCCAACTCTAATGGAGTGCAAATATTGAATTCT ATTTGTGTAAATAACCATTGTAGTGACTTCAGATTTAGTACAATTTATTTTTTCAATTTATTTTACCCACCCCATCTTCATTTTTCTGCCTTTATTGTTA TTGACCATGTCTAGAATCAATGCTGATTATTAGGCAAATAAACTATTTTCATTAGTGTTACTTTCAACCTCTGTTTAGAATATAGAAACATGGCATATTT GAAAATTCCATTCATTGAATATTTGTGATGCCATTGTTAACATTATGGCAATTCAATTTTCTTTATGGAACCAATGCAGACAGGAGCTCTGCTTCTTGAT GGAGGTATGTTGAACTACTTCGGCAAACACATCCCCATCAATCTTGTTGTAGCTGTCGCCGCCGAGGCTGCTCTTGTGGGTGGTGCAGAGTACTACAGAA TTACAAATGACCTGGTATGCAACTTCTTCAATTTTGATATTATTTCCAGTTTTCAAGTCATTGTTACATAGAGTCTTCAGACGCTTAAAATATATTATTA CATGAAGCCTCACATCGCCAAAGCTCCCGGATATTTTTCAAATCATTTAACGAGTTAATGTTTCATGTAGTCTTAACATAGCCAAACTCATTAAATGGCC TGTCAACAGACAATCCGACGATCGTGTGAACCATGTCACTAAAATGTCGATAAATTTGAAGGAATTTGTAACAAAACTTGAGACTTAATTTGGGCAGGAT TTGGAAGACAACCTTCATCCAGGTGGTCCATTTGACCCATTGGGGCTAGCAAAGGATCCAGA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_170260; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_405566
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic from Arabidopsis with 75% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019453242.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |