Ll_transcript_405904

• Id Trinity: TRINITY_DN49546_c1_g1_i9
• Name Transcript: Ll_transcript_405904
• Sequence: GTTGCCTTCTCTTTCTCTGCCATGTGAGAATAGAATCACGTTATTTGAACAATTCTTACAACTATAAAGGCAACTTGTTTAAAACTTTTAATTTGGTTAC TTTAATAATATTATCTCATTGCAATTGGAGATTCCTCAAGTTAGGATATGGAAAATACTTCGTAAAGGCATATGATGAATGTTGTTGCTCTCATGGGCCA AGGCAATGAAGTATATTTTAACCCTCATAAATTTCTCACACAAAAATTATTACCAGATCAACTCCTTAATGCTTATAATCTTTTTAATTTTGTGACTAGT TTATTTTTCCATGCAACAAAAGTATAATTGTTTATGCAAAAATCTTATTGGCAGTCATATCTTCAATACTAACCGAAAAAAATCTCAAACAGGAAAAAAC CATTGAAAAGAAACATGGTTCCTATTCTTTCTCTTTCACTGCATCATCATTCAGCACTTACAGGGTTTCTATTTTTAGTTACTGATGATGAGGATTTGGG GATTGAAGATCGTGTTCGCTGTTTTGCTTTGTGGGTCCTTTTCCTCCTCCGCCGAATCTAACACCGGCACGGTTTCTCTCTCCGCCGTGTGTCGGAGGGA ATCAGTTTTCGATTTCATCATAGGGGTTTCAGATTCTACCTGTTCTATCCCTCATTCTCCTCCATCATTTCGTTATATTCGTGCCACCGAGGTATCTAGC TCTTTCTTTTTCCTTTTAAATTTTTATTTTTATTTTCTATTTATTTGGGTATTATAATACATGTTGTGATTTTGGATTAGGAAATTTAGTATCTTTGTAC TCAAATCAACAACCTTAAGAGTTCTGAATCATGGGTACTTCAAAATATTTGGATGCTTCCTAGACATTCCTAACTGAGTTTTACGCTTTGTTTTTTCATT TACTTCAGTTTTATACCATGATAGATTAAAATGGCACTACGAATTAGATAAAATTTGCATTTTTATCATGTATACAATAACCCATATTTTACTTTTAAAA CATTATTCATCTCTTCTAATTTAAGATTTGTGTTTTAACATTAACTTAAGTAAAAAATTATTTGAATCATAGTTGTGCTGCGTTTGTAATTTGTAGAACT TGCCGTGTCTGTTTCTGGTGTTGTATCTGTGCTTCTCAGTTGTGTAGTGGTTGGTTATTTGCAACATGTAGATTATGTTCTAATATATACGTGTGTGTAT TTGTATATTGTATTAAGCTTTGTAACATGTAGCTTATTTGTTTCGATGCTAATACAAGATTGTGAGTATGCTTCTCATGGAAGCTAAGGATTCTGTAATA TGCAGGGAAATGAGGTTTCTTTGCAGAAGGTGCTAAACATGGTTGAGAGGAATAATCACGAGTATGTAGCTGTACTTTTCTATGCATCATGGTGCCCTTT CTCTCAGATATTTAGACCGGTTTTCTCAATCCTGTCGTTCCTCAATCCTTCCATTCTGCATCTTGCTATTGAAGAATCATCTGCCAGGCCAAGCACCCTG TCAAAATACGGTGTCCGTGGTTTCCCTATACTATTCATTTTAAACTCTACCATGTGTGCTCGTTACCATGGATCTCGGACACTGGACTCTTTAGTAAGTT TCTACAGTGATGTTACTGGTAAGGCTCATTCTTTCACTCATTACACATAGGGATTCTTTCTTTTTTTAATCTTAATATTTTGTTCATATAAATGAATGTA ACTGTAAGATTCACATGATTTTCTCATTAGTCAATTTAATTAATAAATAGAGCTTAAATTCGATCTACTGTACTTTTTTACACTCACTAAACTATAGCGA GTGCCACATGATTGAACTTTGGTTTTTCATTTCCAGCAAAGCTTTATTATTTTTTAAACAGGTGACACTGTCTGGTTCACAGGTACTGTAGAACTTATTA TAATGTTAATGGATTAAGGATACTGCACTAAACAGAGTGCTCAAGCCATTTATAAAGCTTTCAAAAACACCCTAAAGTACCGATCTCATTAAAATCTAGT TTCCAAACATGTCACCCCATTAGAGAAACTATTAAAAAAGTGGATTTATTTCACACCAAGGAAATGTTATATTTAATTATTTTGTACATCTGAGTGATTT TCTTTGATTTTTTGCATTTTTATTTTATGATGAGCACCTTTATGATTGACAATAAATTTCAATATCTGACCATTCATGTGCTTTGTCTGTGCCTTAATTG TCTTTATTGTGATTGAGTTGTTACCATGTCTTTTACATGCCAAAGGGAAACAGTTGGGCGAGAATAAATGGGGTTTCATGCAATCTGGTATTTAGTTCAT TGTTCGGCTGTCATTGTAGGGGTCAGAATTGATTCACTTGATCAACCATCCCTTCAGAAAATTGGGCGTTTGTTAGTTCGTGAGAAGCACAATCACACTG AGCTAGAAAGTTTCCCATTTTCATGGGCTAGATCTCCAGAAAATTTACTGAGGCAGGAGACTTATTTGGCTCTAGCCACTGCATTTGTAGTTTTGAGGCT ACTCTACTTATGTTTTCCTACACTGCTTATTTGTATTCAATATGTTTGGAGAAGAGTCATCCAAAATGTTACTTTTGGGAGCTTGTTGGAACATCCTTCA GTATATCTGAAGCATTTGATACAGTCGTTTAAATGTCTGAATGAGCCATGCAAGAGAAGTAATCTGCAGGAAGGAGCAATGAATGCTAAAGCATGGGCTT CCAAGTCCCTTGCCACTGTTTCAATTGGAGAGGGAAGTACCAGCCGCGGATGCACCAGTAAGTAGACTGTTTACCAACCAGTTTTCCCTCATGAAATTGA CAATTTCGATATACTCTATGCAAGGCTTGGCTGCAAGTTATGCTATCTACCTTTGTTACCAGGATCATCGTCAAACCCTTGAGGTTTATGCCTTGTAAGT TCAATCATCATGTTACTGAATGATGTGATGTATACCTTGTTTGTCTATATAATTAAGAAAATACTTCATCCAGCGTTCTAGAAAATTTAAACATCATTGT GAATAGTATAAATGTAGCAAACTTGAGCTGAAATTTGTAATTCTTTGACTTGTAGGTTTTACTTGAAAGTCAGTGATTGACCATCAATAATAAATTAATT TTTGTTGGGAATGATTGATTGCTTATACAATTATACTGACCGCGTGTAATGTTCATGTACTCTGCATGATTATTTGGAAAATCTCTAATATAATAAGGTG TAATAATCTGATTTTAAATATCT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_170269;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_405904

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 0
• PS1: 0
• PS2: 0
• PS3: 0.2
• PW1: 0
• PW2: 0.2
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_405904

• Blastp: 5'-adenylylsulfate reductase-like 4 from Arabidopsis with 54.81% of identity
• Blastx: 5'-adenylylsulfate reductase-like 4 from Arabidopsis with 65.09% of identity
• Eggnog: thioredoxin domain containing 15(ENOG4111M6Z)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G34780)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019417607.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;