| Id Trinity | TRINITY_DN49553_c2_g1_i9 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_405303 |
| Sequence | GGAATTCCACTTATAAGTTGGATATGGAATTCCACTTATAAGTTGGATATGGAATTCCACTTATAAGTTGGATATGGAATTCCACTTATAAGTTGGATGT GAGAGCACTCATTTCCCATGTTCTTGCACCACCTGGGTTCTATATTATATTTGTGGTACATGAACATGTTCCAAACAATTGAATTTGGATTAGAATCACT TCTTGATTTCCTCAACTTCTTTATCATTTCATTCCGTAAGTCTACCTCAGGACTCCCTTCTTAGTTATATGTTTATTAGTTTTAACGGTGCTTTCCTTCT AAAAAGTTCTGCAATAATATCTTTGAGCAAAGTGAAGACCATAAGAGCAACGGATACCAGAATGGAGAGGATTAAGAGAAGGAGCATTAGAATATGAGAA ATAATTAACATTGAACCTTCTTATAGATAAGATAACATAAATAATTATCGTTTTCAGGGCTTATAGTATCATTTTTCACTTAATTATTAGCTTAAATAAA GGGGTAAAAAGTGGTATGAAGGGGGAAGAAATTAATACTGTTTACTTCTTCAGTAATATGATGTCATATATGGTATAAAACGTTATAATAGTAACAAGTT GGTGGCTCAATTTGTAAGAACCAGGGCATGTAATGTAATATGCTAGATTTGGATATATTTAAGAGTATTGGTTTCAAAATACGCAATAAATTTTCCATAT AGTGGACTTATTCAAAAGATGGGCCTTCCCGTAATGGTTTCAAAACATGTTTTTTTTTTTGTTCCCAATGCATATCTTCACACGGGAGACAATGACGTCC GAGGCAGAAACATTCACAGATATGAGAATAACTCTTTCAATGAGTATTTTTTCATCCACAAAACATGTGTTGATATTATTCATACATAAATTAAATATTG TTTCAATATTATTAAGAAATGGTATAAAAATACTTCATTAATAAATTTGATGTGAAAATTGATATTAGAGCACATGCACAATATAGATACCAAGCAGTGC AACAAATGAGTAAACTGTAAAAGAATCCAATCACCTGTTCAGAGTTGAATTTGACGACAAAATGTGTTTCTTATAAATAGCACCTAGCTTATATGTGTTT ATTTTTTTAAATCTCAATGGTTTTAATAAATTTCTCTACCAAACCAACATGTCTTTTTCATTACTTGAAGGGTATTAGTTGTGAAGATTTGTGAGATAGC TATCTTGACCTTATGCAATTGCTTTTAAAAAATTAAATAATATATTTTCATCTTTTCAGGGAGATTATATATATTGTAATCATGAAAACAACGCAAGTTT AATAAAATTTTATATGAACTTGATATGGACTACTGCATAATAATCTTCAAGTACTAGGTCGTTTTCTTGACCGGAAAGTAATGGTGTGGTATTATTAAAA AAATGAGTATTGAAGATATTTGAGATATTTATTAAATTATTATAATTCTTCATGTGGGACAAGAGATACGAATTGGGGGAGAGAGATCTATGAATTAATC ATCATTTAGGATATAGATCACCTTCATATAAGGAAAAAAAGAAAAGTTCAAAATTTTTCAAAAATCTTAAAAAAATGTATTTGTTGTGTACATATAAGAT GGTATAATAGTGTAGTAAGCAAAATTACCAGAGAAACAGTAGCAGAGATATTTAAAAGTTTATGAACTTATCATGATTTTATATCAATATGGTAAGCAGT CAACAGAGTAAACAAAAATATAAATGTTTCTCTGTTTTAATGAAATTATCCTGACACTATATCAATCATTTTTATTACATGAGAACTTCAATGGGAACAA TAGATAAACCAAAAGCTAGAACATATTAACAAGAATAGTACAGAGAAAAAAGTAAAAACATATGACAAAAAAGGTGAGTAAATGAAGGATGATCCTCATT TGATTCTAATGCTCTAAAAACAAAATGCACCAATAAAGATCACCAAAACATTCAAGCCTTATCTTTTATTTCAACGTGGTCAAAGAATAATGTGAGATCT CCAAAATTTCAACCAACAAGACATTCTGAAAAATAAGAAAAATAGAAACCAAAAAACTTACATAAATCACTAAATCAGAAACCAAAAAATAAACGGGTAC CTATTTTTATAAGCAAATTAAATGAAACTGAAAACGCAAGTTTCACAAAAGAAATAGGTATGAATATTAGTGGAGAAAGATAGCTCTTGGAACCGTTAAA ACTAATAAATAAATAAGAAATGAAGGGAATGAAGTGAAAGAAGTTGAGGAAATGAAGAACTAATTATAATCCAAAGTCCCTCGCTTGGAATATGTTCATG AACCACTAATCTAATATAGAACTCAGGTGGTGTAAGAACAGGGGAAATGGGTACTCTCACACATCCAACTTATAAGTGGAATTCCCCGTAGGATTGGCTT CACTTATGCTCAGCACCATCAGCCTCTGATTCATGGAGAAAGACTGTATTAAAAGGTGGTGCCAACATTGTAACACTAACTCAATACTTCACAAGTGTCT CATTCAACTGAAAACTCATGTTGAAACTCTAACCATACTTGAGATAACTTTGAGAAGTGGGGTGTAGAATCTTCGGCCTTAGAGGTGCAAACATAGGATC CAAATAAGGAGGAGAAAATGCCTTAAACGCAGTTCAGTTGGATAAGAGAAATGGAATAAAACGATTACTCTACCATCACGCAATAAAACGATTGTGATAC ATTCTAGGAATAGTTGTAAGCTTTAGCACCTCGAACCGTGAATCATTTTCCTTTTCTGGTTTGTAGAGAAATGGATTCAGAACCAGGTGTATTGCTTGTT CCCATCCCATTGTACCTAAAGTTGCTCCATTAATGATCAAAATGTTGCCATTTGGGAGCATCACCGTATCATTCATAACCCTAGATCTTAGCATGTCCTC CATTTTCCTTGTGGCATTTGGATATGTGATTTTGATCCTACCACATGTACTCAACACTTTTCAGAAGCGACCAAATCTTGATTTTTGCCAAGACCCTCTA GGGTCCCCACCACAGATCAAAACTCCTGCCTCAATATTGACTCCAAATTTCTCATTAGAAGCAATACTGCAGAACGAGTACTAGGAAAAGACCTAGGATT CCCACCATTTGGGATGGGAGGGTATGTCCCCACTACAGTTCCACTTTTGTAGTTGAATAAAAGGTTCCTATCCATGTCCATAAAAACATAGGAGTAAAGA TTGTTCCTCCATATGGGTCAAAGGTTTCATTCAGAAATGGTAATGAATATGTTTTAGACTGCGAAGGTGTCTTAGGATAATACTCATAATTGAATTGTTT TGTGACTCCAATTATAATTTGACGTCCATCTGACAAAATGTGATTGGTGGAGTACCACCTTTTCACATTGAGTGCGTGCATTATCGATTTCATTCCAGTC ACAAGTTGAATTTGAATTTGTGCATGGAGCAAAGGTTCTAACATGGGGACAAATTAAAAATAAAGGTGAATATTTAAAATATTTTGATAGTAATTTTAGG CACCATTTAATTGGATTTATTTGATATGAGGTGCCTAAAAAATTAAATTAATTAAATTGATATAATAAATAATATATTATAATGTTCTTAGTTCTTATCC AACGCGTTCCTTCATTGTTTTCTCCCATTTGGTTGAGCATGCCATCGGCCTTGATAGAGTCAGAGGAGCACCACACGTCCGTTTCTAAGAATAATGGGCG TAAGTATTCTTTTGTGACACCATACTCAACAGAGTGAGCGATGCAATCATTTATATAAACTCTACCAATAGTGTAGTTGCGGCATGAGCCTTTAGGCAAT GGTATGTTTAAATACCCAAAATTTGTGCGATCATATATTTTCACATGATCATTGGGTAGAAGTTGCATGTGCATTGCTGCAATGCCTATGCTCTTCTATA ACATTTGCCATGTTCAATTGATGTGATTGAGATGAGATTGCCACAAGAGCGAGGAGGAAAATAAAAAATGAAAAGGGTAGCCATTGAAGGAAAAGATGGT AGTTGAAATGTCTAATGTAAAAGTTTAAGATGAAAATATATGGAGGGAATGTTAAGCCTTTAACTAGGATTGTAGTATTAATACTTTCGTCACCAAGTAT CATATGTGTTTTCACAACATGTATTCGTTCATATAAAAATAGTATCTAATTAAAAGTTCATAAAAGATCACATGTATTTACATAGGATTTATAAAATTTC ATTTGTTATTGACACAAATGGGATTGGGTGGTGGTGATATAGTTTACCAAAACACTTTAATATGAATATTGATTTTTTATTTCATATATTATCTAATTAA TAATACATAGAAATCAAGGTTTATATTTATGTTAAACCATGACTATAAAAAATGAAAAGTAAATTATTTTTTACGAAACAAATTAAATACAAGAAGTTAG ATTTTTCTTTCATTTTTTTCCCGGATAGCTTTATTTTCATAGACAAAACACACTATAAAAAGGGATTAATTACTGGCGAATTGTGATTGTTGGAGTACCA CCTTTTCACATTGTCCACTGTCAATTTTGTTCCCGTCACAAGTTGAATTTGAGCATGAAGTGAATGTTATAACAGGGAAAAATTAAAATGAAAGATGATT ATTTAAAATATTTCTTTACATAAGCACACCAAATTAAAAGGAAATATGAATATTTAAAATATTTCCATATTAATTTTAGGCACTATTTAATTGGATAAAA GCAAATTAATATTTCATATGAGGTGCATGAAAAACTACATTGGTTAAATGGATAAAAATAAATAGTCAAACTAAATATTTATCAATTGTTTTATTATAAT AGTCACCGTATCACCCTAAGAAGTTTTCTAAATATAATATATAGAAAAAAGTAATGGTGAAAACAAAGTTTGGTCCTCCATACATAATATATTGCAATTT TCTTAGTTCTTATATTCTCTTTGTGTGCTACCTCTGGTTTGGATTAGCATGCCATCAATATTGATGGAGTGTAAACATCTGTTTCTAAGAACAACATACT TTTAAGATTGTTGGTGACATAATATTAACAGACTGAAGAGTGCAATCATTTATTAATTAGACCTTACCAACAATATAGTTTTGGCATAGGTTTATAGTTA AGGATGTATTTGAATAGTCATAATTTGTCATACATTATTACATACACAATCATTGCACAGATGTTTCACATAAGTTGCACATAAGTTGCACAGAAGTTGC ACATAAGTTGCACAGAGATTGCACGTGCATAGTTGAAATATCTATGTCAGATTCCATTGATGACTAAGGTTTGGAGATGGAATTGTCACAAAATTGAAGA GGAAAATGTAAATAAAAAAGGGTAGTCAATGAAGAAAAAAATACGAGGGGAAATGCCTATGCTCTTATGCAAAAGTTTAATATAAATAATGTAAGGAGAG AATGTCCCTTTTAAGATTGTATAATTAAATAAGATTGTATAATTATATCATGTATTCATTCATACAAAAATAATATCTAACTACAATTGCATTAGGCAAC AATTGTATTTTTCGTACCTTATTTATAAAAATTGAATCGTTATTGACACAAGTGAAATTGATTGTGGTGGTAGAGTTTACCAAAACTTTTAAATATGTAT ATTATTTGTTATACATATTAAGAAAATTCATCATTGGTATACATATGAGATTAATAGATAAAATGGAAATCAAAACTTGTTGTCAGCTAGCTGTGTGAAT TGAATACTAGAAAAGGTCCTATAACATAATCTAATGTCTCTTTGTTAATTTCTCATTCATTTTTTTCCTCCAAAATGGTTTCATATCTTTTATGTGTATA TTCTCACACTTTATATTTCATTTCATTATTTTTCCCCTCCAAAATGGTTTCATATCCACGCTTTAGATTGATGAGTACTTGGAAATTGCAGAGTTTGATC TATTTGACAAAGATAGATTGACTTAACGGAATAAATACCGAACGTCTCAGCACTCCACCTCCACATGTCCTTCGTATCTCTTTTACAAGGATGATTATGC AAAAAAGAGTTAAGTTTCAACCAAGACTCTTTCTCTGTTAATCTCAAGTTGATATATGGATGTCCCAAACCCATATATCAACATTCCAATATCCACAACA CCAACAACCACCAATCTATCCAGAGCAAGTGAAAATAATCTGGGAAAAACCTCCTTCAAGGGTTGATTCCTAACCCAAATATCCAACCATAATATAATTT TCCTACCATTTTCAACCTATTTCCAAATATTATTCTCAAACCAATTCCCATGAGCCGTACAATTATTTATATGAACTCTACCAATAGTGTAATTGTGGCA TGAGCCTTTAGGTAAGGATATGTTTGAATATCCAAAATATGTGCGATCATACATTATCGCATGATCATTGGGTAGAAGTTGCATGTGCATTGCTGCAATG CATATGCTCTTCCGTAACATTTATCATGTTCCATTGATGGGATTGCCACAAGAGCGATGAGGAAAATAAAAAATGAAAACCGGGTAGCCGTTGAAGGAAA AGAGGGTATCTGAAATGTTTAATGTAAAAGTTTAAGATGGTAATATATGGAGGGTAGGTTAAGCCTTTAAATAGGATTGTAGGATTAATACTTTCGTCAT CAATCACATATGTTTTCATAACATGTATTCGTTCATATAAAAATAGTATCTAACTAAAAGTTTATCAAGCATCACATGTATTTTCATACCTCATTTATAA AATTTCATTTGTTATTAACACAAATGGAATTGAGTGGGTGGTGATATAGTTTACCAAAACACTTTAATACGGATATTGATTTTTTTTATTTCATATATTA TCTAATTAATACTAAATAGAAATCAAGGTTTATATTTATTTCTTCATTAACTATAAAAAAATTTCTAGGGGTGTTAGAAGTGCTCACAAGGTTCTTATGT CTAGGGGTGCTATCAATGAGAAGAGTTTCTATAGAGATTTGTGGGCTGCTAAGGTACCTTCGAAATTGAGCTCTTTGGTTTGGAGATTGTCTGTTGATGG TATCCCAACTCGTGTGAATCTTGCTAAGCGCGGTGTGTTGGCCCCCCCAACTTTGTTGCGTTTTTTGTGGCCTAGAGGACGAATTTGTTGACCATCTTTT CTTCTCATGTCATTTCTCTTACGCGGTGTGGCAAAAAATTTACTATTTGGTTGATTTTAATTCTGATATCCCAATTGGCGTGGTTCGAAACTTCCGTTAC CAATGGAACTTGCTAAATATGGAGGAAAAGGCCCTACAACGATGGATGGTAGTTTGGTTTGTGACTATCTGGATGGCTAGGAACAATATCATTTTTCACC ATTCATCTGCCTTGTTGCATGAGGTTATTTTCTCGATCCACATTCACTCTTGGAATATCCTTAAGGCCCGTTTTTCTGATTTTTCTTACTCTTTCCTGCA ATGGGCTTGGAGTCCTTCTAGTTGTCTGTGTAACACTGTAAGTGTTAGTGGATAGGAGCACTACCTGTTCTCCTAATTCCTTCTTTATTTTATGAAATGA ATTGATGATAAAAAAACTATAAAAAAATTTGCATTTAGGTTTTACTATCTTATGTTAAACCATGACTATACAAAATGAAAAGTAAATTATTTTTTTTACA AAACAAATTAAATACATACATTGAACAAGAAGTTAAATTTTTCTATCATTTTCTTCTCGGATAGCTTTATTGTCATAGACAAAACTCACTATAAAAAATG GATTAATTTCTAGCTATTGATTGTAAGACAAAGCCTAATTTAATATAATAAAAAAATATGCATTACTCAATAATATAATAAAATGGGATAAGTAACGTGC AAAAGCAATTGGCCGCAAGGAGTCAAACTCCTTTAGGTACTCGAGAGGAAAGTTAAGAGAAAAATATTAAAAATCCAATAGATGATTACATTTTTATCCT TTAACGTATAATTATATTACATGTTTACCAAGAAAAGTGTACTAAAAAATAGTTTTGTGATCTCCATTGCTAAAGAGGAGGGTGACTCTGGGCGAGGCCT TTATAAATGTTTCATCTTTTTATAAAACATGGCCTTATAATATACATATTGGATTTTTTCAATGCTCCAACTTGTGTGTACCCTTTTGCTTACTTGCATA CTTCTCCCTTATAAAAACACTTACATGGGAACTAAGAAAATTGAGGACATCATAAAGCCTATCTAGTATGAGTTTGATAATTAATCATCTCACCATCCCA ACTCAACCTTCCAAATTTGAAACTGAGATTGTCATAGACATGACAACCTCAAATGTTATAAGCCAAAACATTAGTACTAATAATATTCAAGAATCTTCCT CCTTCATGATAATTGCAATTGCAAAGCGCTTGTTAATGTCACTAAGTTCTACACTAACCAAATTTCATGCAGGTTATTTTAGAATAAGCCTCTCCCTAGG TAGCCAAGCTTTATTATGGAAGACACTAATTGGACCAACACATGACACAAGCACTCTCCGAAACGTGCTTAGCACCCTTAACCCTACCATTTTCCTTGTA CTATGGTTTCTGGCTCTCTTCACACTCGTATTACTATCTATTCTTTACCTCCTACGGTGCATTTTTTTCTTTAATATGGTTAAGGCCGAGTTCTTGCACC ATGTTGGGGTTAACTATCTCTTTGCTCCATGGATCTCTTGGTTTCTCTTGCTTCAATCAGCACCATTCTTGGCTCCAAAAACCACAGTTTATTTAACGCT CTGGTGGGTTTTTGCAATACCTGTGGTGCTTCTTGATTTGAAAATATATGGTCAATGGTTCACCAAAGGGAAGAGATTTTTATCAACGGTGGCTAACCCA ACAAGCCAGTTATCGGTTATAGGGAACTTGGTTGGGGCACAAGCTGCGGCTCATATGGGTTGGAAAGAGAGTGCTGTGTGTATGTTTTCACTAGGGATGG TGCATTATTTAGTGTTGTTTGTTACACTGTATCAGAGATTATCAGGTGGAAAAGGACTTCCAGTGATGTTAAGACCAGTTTTCTTCTTGTTCTTTGCAGC ACCAAGTGTGGCTAGCTTGGCTTGGGCATCTATAGTTGGGGTTTTTGATATTGCTTCGAAGATGCTATTCTTTCTATCACTATTTCTTTTCATGTCACTG GTAATTATTATTTCTTTATTTATAATCTTTGTAAGAGTGATTTTCCCCCCTAATTTAGCCTTTAAAATTGAAAATTATGAGGAAAAACCAACTTCATACT TAAAAATCTCAAATTTTATTCGAAATATTATTTTTGGGACATAATAATCCATATTAAGAGCTATTTTAACCCTTATTTAAAATTTTAGGAATAAGTTGAG ATTATTTTATTTCTTTGGGACCAGCTCAGAAGAAACTTTTTTTTTCTTAGAGAGGAAGTTGAATATTTACTCTTCATATAATTTATTTAATATTAAGTAA TTGATTTTTTATCGGGTATAATATCTATATAAGTAACATGGGAAGGACATGTTTGTTTCATTCATTAAAAAAAGACAAATATGATAACATTTGAAAATTA TAATAATTTATTAAATATCTCAAATATCTTCAAGACACACTTTTTAATAATACTACACCGTTACTTTACGGTCAAGAAAACGACCTAGTTCTTGAAGTTT ATTATGCAGTAGTCCATATCAAGTTCATATAAAACTCTATTAAACTTGTGTTGTTTTCATGCATGCAATATATATAATCTCCCTGAAAAGATGAAAATAT ATTATTTAATTTTTTTAAAAGAAATTCTATAAGGTCAAGATAGCTATCTCACAAATCTTTACAACTACTACCCTTCAAGTAATGACAAAGCCTACAGCTG GACATGTTGGTTTGATAGAGAAATTTATTAAAACCATTGAGATTTAAAATAATAAACACATATATAAGCTAGTGCTTTTTATAAGAAACACATTTTCTGG TCAATTTCAACTTTGAAACAATGTTTAATTTCTGTATGAATAATATCATCACTTGTTTTGAGTAGAGAAAAAACGTAAATATGAGTTTTCTTTCAATGAA GTCCAAATATGGGAAGACCCATCTTTTGAATAAGTCCAATATATGGAAAATTTATTGTGTATTTTGAAACTAATACTCTTAAATATATTCAAATAATTGA TTGCCAAATATTTTCTTTATTAGACATAAACATTATACAAACACATAAGTTAAAAAGGTTCACCACCCATAGCTTTTTATACCATATATGACATCATATT ACTAAACAGTATTAATTTCTTTGCCCTTCATACCACTTGTTATACCCCTTTCTTTAAGCTAATAATTAAGTGAAA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_170301; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_405303
| Blastp | S-type anion channel SLAH1 from Arabidopsis with 59.65% of identity |
|---|---|
| Blastx | S-type anion channel SLAH1 from Arabidopsis with 58.65% of identity |
| Eggnog | S-type anion channel SLAH1-like(ENOG410YDIV) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT1G62280) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019438040.1) |
| Pfam | Voltage-dependent anion channel (PF03595.16) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |