Ll_transcript_404999

• Id Trinity: TRINITY_DN49581_c3_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_404999
• Sequence: CCATGTCCACTATCACTGATGCTCAGGTTTCTGTTCCAGCACAAAGGTAATATAATACAATAATTCCAACACCTTCAACCCATATTTATGTACTTTATCA TTCTTCATTTTCTAACTTTTCATGCTCGAACTTTAGCTATTACTTTCGTGTTCACAAAAAAATCTGTTTTTTGTTTGTTTTGGATTTAGTTTAATCAACT TGCCATTGTTTTTATGCTTTATTTCATCAGATTTTGTGTCAGATATCATATACTTGGTTTAAAATAGGCTGTGAAAATTTTTATACTCCTCTATGAATTA TTTAACCCTTTTTTCTTATTGGTTTAGCATAATCAAATCCATTTTTACTTGTTTTGACTGTTGTAGTTTTTCACTGTAACAGAAAGCTTTCCCTGTTTGT TAGTTATTAGGGAAAATTCAGTGATTTGTTAATTATTTGGAATTTTATCCAATCTTTGACAGTGTTTTTTATTTATTTTATTTATTACCCCTTTTTTTGG GGTAAGAAAGATTTTCTTTATGATATACTCATTTTTCCTTCATGTACAAAATTGATTGAAGTTTTTTTTGCAGTATAATCTTGGTTCTACCATTTTTCCT AAAGCGTATGGATTTTCCTTTTCAAATTCTTGGCTGCTTTTACTATTTGATTTCTTTTGACTCCTCTGATGCCAGATCCAATCTTTCTGAGGAAATTCCC AAGTCCAACTACCTAATTGATTGACATAGCTTTTGTTTTTCTTTTTTATTTAACAAAATATTCTCTTAACATTCTATCTGAACTTGGAAACGTGGTTCAA TACTCTTCCACAAATATAGGAGATTAAGTAATAAGTGAATGTGTTACCCTTCTTCCACAATCTTGAGATTGAGTATATTGTGGCAATTCATTAGATTGGA GTAGGGTTGTTAGCAAGAATGAATAACAAAATATCGCGAAGGCGTCCGTCTTTAACATCTTTGATCATCCTACATTGTACAATTCTTCCTGTCACTTTTA AGATTTGGTTGTTGTTGTTGTTGCTATAAAATGTTAAACACCTGTTAATGTCTGCATTTATCATGAATCATGGTATTACAAATTGTCACTCTTGAAACAA GGACCTTTCTACATATAATATGGTATATGGATGTTGGATGAGACTTAAAGCAAAGTGAGATAAACATTCAGGGATCTTACCACATATCCTAAGTTCATCC TATGAAATCTAAGATTGTTTTGTGAAGTAATATATCGGAGTGCCTACTCTAATGTTTATTAGAATTGTAAATCGGAGTGTGTACGATTAAAGGGTAATGC GCAATACCTTTTCATATGCTTTTCGATATCCTTTTACTTGTTGTATTTGCCATAGTTGAGATCGAATTTATGAAAATGTTGAATGCTCCCCTGTACACCA TATGTGACTTTATGTTCTGTATGTTTTCTCTTCTTCAGGTTATTAGGCAAAGTGGCTTTGGTTACTGGTGGAGGCTCGGGAATCGGAGAAAGCATTACCC GCCTGTTCCATATCCATGGTGCCAAAGTTTGCATAGCTGATCTTCAAGACAACCTTGCAAAGCAGCTCTCTGAATCCCTTGGTGGCGAAGCAAATGTTAG CTTTTACCATTGTGATGTTACATCAGAGGATGATGTTCGAGGTGCAGTGGACTTTGCCGTGGAAAAATATGGCACCCTTGATATCATAGTCAACAATGCA GGAACCTTTGGATCAATTTGTCCAGATATTCGCGATGCGAGTTTATCCGAGTTTGACAAGGTATTCAGTATAAACGTGAAGGGAGTATTCAATGGGATGA AACATGCTGCTAGGATTATGATTCCAAAGAAGAAGGGTTCAATCATTACTATAGCTAGTATTGCAAGTACTACAGGAGGCATAGGGATGCACCCATACAC AGGTTCGAAGCATGCTGTGGTCGGACTCACGAAGAGCGTTGCAGCTGAATTAGGGAAGCATGGAATAAGAGCGAACTGCGTCTCACCTTATGCAATCCTA ACAGCTTTGACTCTTGCTAATTTGCCTGAGGCCTTGAGGTACGGTGATGTCGCTGCTGGTTTTCGCAATTTTATGAGGGCGAACGCCAACTTGCAAGGCG TGGAATTGACTACTGATGATGTGGCTAATGCTGTGCTCTTCCTAGCAAGTGATGAATCAAGGTATATCAGTGGAGATAATCTGATGGTTGATGGAGGCTT CACCAATGTGAATCACTCACTCGGAGTTTTTAGATGAATGGTTAGAACATCACAATCATTGTACCGGCATGAATTTCTTTTTCAGTCAATAAGGGAACAA ATTCATCCAATTAATAATACATGTGAATTTGCAAGATTGATATTTTGAAGCATGAGTTTAGTATAAGAAGAATGTGTTATTAATATGTGTTGTTGGGTAA GCATGTAAGAATGCATTACCAAGTGGTGCAAATATATAGAAATATATAGAAGATGGTGGAATGATGAATGAAGCCATATTCTAGGATGAGTTCCACACTC ATATAATAGGGACTCAGGTGACATAACAAACTTTTACATTAGAGAAGCTTTTGATAAACACCAAGCTTAAACTACCAACCTATGTGTGTTAATAACATGT TTTAAAGTGCAGTAATATTATGGTTTCGAGA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_170563;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_404999

FPKM

• PAB: 2.1
• PNAB: 1.2
• PS1: 2.6
• PS2: 5.8
• PS3: 10.2
• PW1: 0.6
• PW2: 0.5
• PW3: 0.6

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_404999

• Blastp: Xanthoxin dehydrogenase from Arabidopsis with 67.29% of identity
• Blastx: Xanthoxin dehydrogenase from Arabidopsis with 67.29% of identity
• Eggnog: Dehydrogenase reductase(COG1028)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G52340)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019427658.1)
• Pfam: short chain dehydrogenase (PF00106.24)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;