Ll_transcript_416721

• Id Trinity: TRINITY_DN49615_c1_g2_i10
• Name Transcript: Ll_transcript_416721
• Sequence: TTTCTCTCTTAGCATTTTTGTCAGATGAAGTAAAATACATTTCAACTTTTAGATTATAATGCTTTAATTTTCATTTATGAAGTACAATAATGTTTAGGTG AATTTAGGTCAACAATAGATTCCTGTCTCAGTCTAATCTCCAAACTGAAAGCATTGGCAATCAACTTGAAAGATCTTAAAGTTTGTAGTAATAATATTGA TAACATGAAACTCAAAAATTGAAATTTTAATGTCAGTTGTATTGATAGTTATTGAATTTAAGATTTTATTATTAGAGGTGGATTCACGGACACTTTCAAT GGAGGTGTGGGAGCAAGAATGAATAACGAAAAATAGAATGAAAGTAGAGTTAGGGTTACACTGAGATAAGAGAAACAATCTATGGTTACCAGTTCTCTTG GTCATATGGTTCACAAATAAGGCAGAGTTGCAATCAAAGGGTTGCCGTGGTGATATTTTTATATGAAGTCTAGGTTATGGTCATCTTGTAACTATGTTGA ATTAGTCACATTACACCCTATTATTAACCTCAATTTTCTCATATTTTAGCTTTAGTTTTAAATTCATTTTCTTATGTATTCTTATTTGATTAGCTTAAGG GTTAATTTTTAGTAGCAGGCATGATGGAATTACTGTTATGGTCAATTAGAGAAAACTCGCCTTAACCTGCATGATATTCTAAATTAAAGGGGCACTTTTC TTGAAAATGGGAATTATGTGTGAAAAAACTGAAATAGGTATGGAATCTTTTGATGACATTGTCTTGAATTAAATTCTTGTTTTGGTCCATGAGCAATGGC AGATGGGAAGTCTCTCTGCCAAAATTGGAGGTGCAGGGTTTGATCCCCTATTCCCCAAACTGTCAATAGATTTTGGTAACCTGATTAGAGTTAGACTTTG CTGCTAATCTGCTACCACATAAACTTATCCCTTTTTGATGAATGTACATTATGTAAATGCGGTCGATGTTTGAACTTTGATCATAGTTATATGGGTCGCA GTGGTTTGTCGCTTTCCTTGGCAGTTAAAACTGCCCGTATATTTATAAGTATGAGTTTGAAGGACAGAGTGAACATGACTTATCAATAGACTTGGTTTGT CTAGTGGATGCTCATTGTTCTGCTGCTTTGTTCGAAAATGCCAAATATAGTTGCAAGATGTATTGACACTTTTACACAGCTAAGACGCATTTCCTATATG GATATTTGTTTTGCAGGGCATCATGTCAATAGCAGATGCAAGGTTGGGAGTATTAACAAGTTCAACTTCTAATGACAGAAATGAAAGGATACCACTTTTA AAGAGGGACATTATAATGAACATGGAAGAATTGCCTAAAACGTCAAGCCATCGATATCTTCCCCGGGGTTTCCTGAGCTCGCGACCAGCTATGTTTGTGA TTGCTTCACTTGCTGTATGTTTTGGGTTATGTGTAGCGGTCCTTCATCCTGGGAAGGTTAGTGAGCTTGCAGTATCCATCAGAAGGTGCTTGTTTAGCAA TTCATAGTTGCTTCAATTTTTTGTACCTATTCTGTTGTTGGTATATATTCATTGTAACACTAAATAAACGTATGCTATTAGGATGAGTAATTAGTTATTA CATTAGAAGGTTAATTTATGGTTGCTTCTAATTTGTGCATTAGCATATCAATTTAATTTGATGCCCCTAAAGGGAACATATGCTAATTTGAATATCTGTA GTGCTAATATTAAATTGAATGCATGCCTTATGCTTCATTTTATACATATCTGGTGCTAAGCCCAGATGAATGATGAAAATTATGTTAGACAGTCGATAAT TAAAATGAATCATTCTCGAAT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_170805;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_416721

FPKM

• PAB: 0.8
• PNAB: 0.5
• PS1: 0.8
• PS2: 0.2
• PS3: 0.3
• PW1: 0.3
• PW2: 0.9
• PW3: 0.5

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_416721

• Blastp: -
• Blastx: Squamosa promoter-binding-like protein 7 from Arabidopsis with 40% of identity
• Eggnog: Squamosa promoter-binding-like protein(ENOG4111YFE)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G18830)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019419596.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;