Ll_transcript_415432

• Id Trinity: TRINITY_DN49627_c4_g3_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_415432
• Sequence: AATCAATGGTTTTTCAGTAGCCACTACAACACTAGACTCTCTGTTTTCTTTGTTCTATTTCAATTATCTTCATGGCTACCAATTGTGGTGCTTCAAAGAG AAAAGCCTCAGATGAAATAGACTATGTCAATTTTTCAATCAGGGGACAGGATGGGAGTTTGTTATTCTACAAGGTGAACAATGATACCGAGTTCAAACAT GTATTTGAAGATTACTGCAAAAAAAAGAGATTAGAATATGCAACTATACAATTTTTACATGAAGGCCAACGTGTTTTGGGGAGACAAAAGCCCAAAAAGG TTAGTATTGTTCTTTCAAAATTTCAATGAGTCTTTGAAAATCATGATTATTTATTTATGAATTTTGTGTTAAGATTTATTCTAAAACCAATAAAATGAGT AACCCAGTATGTACCCGTTGGACTAGACAAATTGTTATGTTCGATTCATAATTAAAGAGTGTCTTTTGATCCAAAGATATTGAAGATATTATTGTATATC ATGTTAAAGTTTCATCTAAAAAATTAATTGATAATGAGAAAAGTAAGTTAATATATATTTAGATATTTAAATCATGTCTAAAAAAATGAGTAGAAATGCT TGCTTTCCAAATATATAAGTTTCGGAATAATATGTAGGTAATTATTTGTAACGTGGTAAGCTATTATTGTGTTTGAAAATCACTATAAAGATGATACTTA TGAGACAATATATGTAGAAATGAGTCCAAGAAGGAATATTGAGAGAAATTAGAAGTATCTCACTTATATTTTATGTGACTGTCGCCTGTTTCATAACAAA TGTTTTTAAATTTTACGGGTATTGGTTTAAGTAGTATATGTTTGATTCTCTTTAAGTAAAGTCTCGGTTTCAAGTTTTGTGCATAAAAAATGTCTGCTGG AAGAGTTAGCCCCACATACCTGTGGAGGTTCCGGACATGATTGCCTCCAGTATGATGATACATGTGTGAAATAAAAAAATATAACTTTTCACTTATACTG TCAAATGTTCATAACTTCGGATATAAAGGTTATATCAGGTGAGAATAATGTGTTTTAAAAATATGATAATAATTAATATGGACCAACTTTATTCTTTTTT GTATGAGAACTAACTATTTTACTGAAGTGTCGCTCATAGGAATCGAATACTTGACTTTTTAATCTTTGTGAAGATCTTGTAGAGCATGTTATTCCCATAT GTATAAAATTCAGTGTTTCAACTTGGTGTGTATATTAAAACATTACTGCTGTTATTGTATAGATTCATTTTACTAACCTAAAGTCCTATTTTCTATGAAT GCAACTTGACTATTGTAGCGCAATTTGGAAGATGGTGCTGAGATCCTAGCCATGAAACAAGTAATGGGAGGTGGTGTTGCAACACTAATCTTTTATTGAA TGTTTGATTACTTGAGAGTTTGTTTGTTTAACTGTTATGGTGCATGATAAGAAGAGTAGGTAAGGTTTGTAAATTAATTGAATGCTTCAACTAATACTGT AATATTGCTTTTTCCATCATGAAAAATGTAAAACATGAATTTATCTTTAATTGTTTTATCAGTATAATTTAATTGTAATGCCACCCCAGAATTCAGTTAG ATAAGTTATTCATGCTAAAGTTTGAATATATGGATTATGAAAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_170904;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_415432

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 1.1
• PS1: 1.5
• PS2: 0
• PS3: 1.7
• PW1: 0
• PW2: 0.1
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_415432

• Blastp: -
• Blastx: Small ubiquitin-related modifier 2 from Arabidopsis with 27.54% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G55160)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019460654.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;