Ll_transcript_415220

• Id Trinity: TRINITY_DN49641_c0_g1_i16
• Name Transcript: Ll_transcript_415220
• Sequence: ATTAGATTCTTTGTTTGCTTGGACTGTTCTTGACAAAGCATATATGAGTGAATGAGTCAATTATGATGTCTGTCAGTGTTCATATAAATTTACCAATTTG GAAGTAAAGCTAATTGAGCTGAGAAAAGATACATCAAAATCTTCTGAACATTACCTTTGAGAGAGAGATGGCTATACCAGACCCAACATCTTTTCCAAAT CTATTTCAGAGGGTTGCTTCAGCACAGTTTAGAAGGCCTCTCCTTCATTTAGTGTCCACTCAAGAAAATAGACATAGATACCTAACTCAATGTGTTCCCC TTCACAAAGCAGCACTGAAAGGTGACTGGAAAGAAGCTAGTAAAATAATAGAACAAGATAATACATTGCTGAAAGCAGCCATAACAAAGGGTTGGGCCAC AGTTCTTCACATAGCAGCAGGAACAAATCATGTTCACTTTGTGGAGGAACTAGTGCGAAAATTGAAACATGAAGATTTAGAGTTGGAAGATGAAAAATCA AACACTGCATTCTGTTTTGCTGCAGCAGTTGGGAATGTTGAAATTGCTAAGATAATGTTGAGAAGGAATGAATCATTGGCACAAATAAGGGGTGGAGAAG GATTAACTCCTCTTCACATGGCTCTTTTACAAGGAAGAAGGGAAATGGCATGGTACCTGTTACCTAAATCTAAAGAAATACTTCAAGAATTAGACTGGAA GGTGTTGTTTCACATTTGTATAAATTCTGAACTCTATGATTTAGCCTTGGAAATGCTAAAGGAAAAGAAAATGCTAGCTTTTGCTCCAATTGGAGATACT GGTGAGACAGGTTTGCATGTATTGGCCCGAAAGGCTTCAGTTTGTTGTTGCCAAAGTCTACAATATGGAAAACACCTCTTGCATTTCTGTAAGTGTCTAT AACATTGTTATTATATCGTATATCAGTTGTCAAATCGACCAGGATATTAATATAATAGTATAACGGTTTAATCAATCCTCACTAATTAAATCACATACCG GTAAAATTAAGTATGCATATAATATATTAATATTAATGTTGAAAAATCAATAATATTTTATATTTTCATTAAAAAATAATTTTAAATAAAAATCTGTCGG TTTGATCGGTACGATTCAATTAAAAACTGACCAATATGACCGGCAATTAGCATGACTTTAAGTGCTAGTTTGGTTTCAAATTAACCTTTTGTTTGGCTTT TGGTTTAGGTTAACAAAATTCTGTTTTCACCATTACATATAAAAACTCTTAAGTGCTAGTTTGGTTTGTAAATTTGTTTTGTTGCCATTTTTATTACTAG GCCACAACAAGCCTTTGAATCCTAAACAATATTCTCTCATCGATAAAATATTAATTTTTAAGTTTTTGCTGATCATCTTACTTATGATTTTTCTTGGCAT CTCTCTTCCTTTAGAAGTTAGACTTATCTCCATATGATTTACTAGGTTAATGAGACTTCTAATCGTTACCTCTATACATATCCAAACTATCAAAGACACA ATTATACAATATTTTATATTATAGGAGCTCCTTAAACTTTATCCCTAATACATTTATTTCTAATCATATAGTTTTGTGTACGCTCTCATCGGACTCAACA TTCACATGTCTGGTACATGAACTTTATTCTTTTATTGATATTTTTCCCGCTTAATATCCATCTCATTTTTTGTTTCTATTAATAATTTAAAAAACATTAT CCTTATTCTCATTTTATTTCCCGTTTTTAGTGATTAGTAAAATATGCTTTCAAAAGACTAACTTCTCAGATTGTGTCTACCAGGTACAAATGATACTTTC ATCCTTAAACTCATCAACTTTATGTGGAATATATTTCTTACCGAGTTGGATGATTCAACATTAATGAATGCCATAAGACAACCTTCTCAAGTAACATTTA TTGCTGCTGAAGTTGGAAATTTTGAGTTTTTATCTGTTGTTATTAGCACTTACCCAGATTTGATATGGGAACTAGACACAATGGGTCGAAGCATAATTCA CACTGCTGTTTTGCATCGTCATGCTAGCATATTCAATTTAATACATGAAATAGGCCCAATGAAAGATTTGATTCTAACTTTCGTAGATGATGAAAGGAAT AATTTATTGCACTGTGCTGCAAGATTAGCTCCACCAAATCGACTTAATATTGTTTCTGGAGCAGCTCTTCAAATGATGCTCGAGTTATCATGGTTTGAGG AGGTGAAAAAAATAATGATACCATTATTCATAGAGATGAAAAATTCTGAAGACTTCACTCCTCGCCAAATATTCACCAAAGAGCATGAAGAGTTACTAAA AAATGGAGAGTCTTGGATGAAGACTACAGCAAATTCTTGCATGGTGGTTTCAACACTCATTGCTACTGGAGTGTTTTCTGCTGCATTTAGTGTTCCAGGT GGTAACAATGACAACACAAGAAGTCCCAATTATATGGAGAAACCAGCATTCCTAGTATTTGTTTTGTCAGATGCTATAGCATTCATCTCATCTTCAACAT CAATCATAATTTTCTTGTCCATTCTTATGTCGCGATGCGCTGAGGAAGATTTTCTCAAGTCATTGCCATTGATGTTGATATCAGGACTAGTAGCATTGTT TATCTCAATCATAAGCATGATGGTAGCATTTAGTAGTGCCTTTTTCATAACATATTACCATGGACTGAAGTGGGTACCTAACTTCATTTCTGCACTTGCA TTTGTACCAATACCCTTATTTATATTCTTGCAGTTCCCTCTCTGGTCTGATATAGTTTATTCAACCTATATTTGTAGCTCTCTCTTCAGACCAAGTAAAC GTATGATTCACTAGAAAGATGGAGCTTTATTGAATAATTAATTTCAATTTCCTAAAGTGTGTGCCTTCTCCTTGAGTTATAATGGGTAAGTAGCAATTTA ATGTTGACATATGTTCTATGTATAATAGAGCGGGTAGGTATCGGTGAATAGGTCTCTGGGCTGGATGAACGGC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_171034;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_415220

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.2
• PS1: 0
• PS2: 0
• PS3: 0
• PW1: 1.8
• PW2: 1.2
• PW3: 0.7

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_415220

• Blastp: Delta-latroinsectotoxin-Lt1a from Latrodectus with 28.97% of identity
• Blastx: Alpha-latrotoxin-Lhe1a from Latrodectus with 24.26% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019418119.1)
• Pfam: Ankyrin repeats (3 copies) (PF12796.6)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;