Ll_transcript_416577

Id TrinityTRINITY_DN49644_c2_g1_i11
Name TranscriptLl_transcript_416577
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CCTCAGCAAAGCCATTAAGATGGTACAAATCAATGCCTAACCTGCATAGTTGGCATAAATGCAGCTATGAAAGTATTAAGTTTGTCTGCCACCATGCAAA TTGAAAGTATTAAGCTGATACCCTTCTATGTATTCTAGTTGACTGTATGTATTCATCTTTTAGGTGCAACTTTTGAGAACAATGCTTTCCTGGGAAGAAC AATTGCGATCTGAAGTAAGTATGAATGAAACAAAGCATGACGCAAAGCTTTATGATCTTCCGGGCTCTCCAAACCTTAGAGAAGTGGTAATTATATGTTG GCCTCATGGTGATATTATGAGGTTAAAAGCTGGTAGCACAGCTGCTGATGCTGCTCACAGATTTGGTTTCGAGGGAAAGCTGGTTTTGATCAACGGCCAG TTAGTACTGCCCCATACCAAGCTCAGAGATGGTGATGTTCTTGAAGTAAGGATCTAAATCATTCATTCGCAACATTACTGTTAAAAAAATTGTAAATATT TTTTACGGGTTCTTTGTAATTAAAGTTGGTGGGGGCAGAAATAGGCAGATTTTCTTGTATGTTGGGGGATTTGGTAAAGTAAAAAATGTTCTTTTAACCA AATTTCAAATTTGGTGGTTTTAAACTTAATTCCATGGATATGTTGGATAACCACATTTGCCATCATATAATTACCCTTCTATGTATTCTAGTTAACTAGC TTACTCACATATGTTCACTATTGTAGCTACTATCTAATTCCAATCCTATTTTACA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_171061; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_416577

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_416577

BlastpProbable GTP diphosphokinase RSH2, chloroplastic from Oryza sativa with 48.51% of identity
BlastxProbable GTP diphosphokinase RSH2, chloroplastic from Oryza sativa with 48.51% of identity
EggnogIn eubacteria ppGpp (guanosine 3'-diphosphate 5-' diphosphate) is a mediator of the stringent response that coordinates a variety of cellular activities in response to changes in nutritional abundance (By similarity)(COG0317)
KeggLink to kegg annotations (4345756)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019423473.1)
PfamRegion found in RelA / SpoT proteins (PF04607.16)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;