Ll_transcript_415685

• Id Trinity: TRINITY_DN49654_c4_g1_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_415685
• Sequence: TTTTATCTTTAAATATGATTATTAATTTATTTTGAATGTATTTAGTTTAGTCTATTTAATTATTCATAAGAAAATATAAATAAGTTTCAGAAAAATAAAT TATATTATGTATCTGTATTTGTACCGAAAAGAAATGTATATCATATTACTATGTATGGATAGTATGGATAGATAGGTTTCTTTAATATGAATGTATTAAG CTGAGAGATTTTTTGATTCAATGAAATAGATGGCGTAGTGTACATGCTTCCACCTAGTGACCTATACGGAAAGTAGATGTACGTAGCCTTAGAAACAGTG AGACGGTTTCTACGATTTGAGCATGTAACCTTAGTTACTAAGGTAGCAACCTTTCCGTTGTATCGAGATTCTTAGATTTCTTGATTCGATATAGGAACAG ATTGAATAGCTAACTAGACTCATTGAAGGAATTGTCTGATGTTCAAATTGATAGACACAGGTCAGATAAATTGTTTGTCCAATTTGAATACATATTGTGG TTGTTCAGTTGAATGTGTTAGATCCCTTATGTTCTGAGATATATTTGAATATGTATTCATTTTCACTTTTTGTCTAATAATTGTGTAAACAATTTGGTAA CATTGTGAAAAGTGAACACTGTCTGCAATTTATGAAAACCTTGAGTTTGATGGTTATATGAAGGTGGCTTTTGATAGAAATGTTAGGACAGAATATAACA TAACATGTTGATTCTGTTATATTTTGGAATGTGTTATAAATAGAATGGAAGGAGGTACATGTCTGGTGGATTTATTTATATAAAGTATGGTATATTTAGT AGGATTAACGGGCTTGGCGCAACGAAAATGTTGTTTCTTTGTAATTATTAGGTAGGTAAGACTGCGTACATCTACCCTCAGATCCCACTAAGTAGAAGTC TCGTGCATTAAGTCACTCTTCTTCCGAGTATGATATAATTGTTACTATAATAGGGTAACTAAACAAATCATACCTTTTATGTCATATCAAATTGTATTAC TCTGCATCAAAATCTTGACATAGTAACTTGAGGTTTCACCCTTTCTATGCTATGGTTGTCAATGTCAATGTTAGAAGGATGAGCTTGGTATAACGGTAAG GTTGTTGCTTAATGATAATGAAATTATATTTATTGTCCCCCGATCCTACTAAGTAGGAGCCTCGTCCACTTGACGTGGAACTATTTTGATTAAATAATAC AAATTTAGTCTCTCTTTGATTCTTAGGATTGATGGATTTCATTTTATTCATTGGAATTTTGTGCAGGGCTCATACAATTATGAAAATTTGAAGGATTTAC TAGGTGATGGAATTTTCACAGTTGATGGTGAGAAATGGCGCCAACAAAGGAAGATATCAAGTCATGAGTTTTCTACTAAGATGTTAAGAGACTTTAGCAC TTCCATATTCAGAAAGAATGCAGCAAAAGTTGCAAACATTGTGTCTGAAGCTGCAACTTCTAATAAGAAATTGGAAATCCAAGTGGGTAATAAATATATT ATCTGAATTTTGAAAGATGCAATATGATATTGCTTTGTTTCATCTCTTTAGTTATTTGCAGTGTTTTAAATTGCGATTAGGGCCGCGGTTGTGGTCATTG TAGCCGTTGCGATGCGGATTGTGGTTGTTATAATGTGATTGTTTTGTGGCAGTCCGATGCGGTTATGTTGCGGTCTGATGGGGCCCGATGTGGTTGCGTT GTGGCTCGTAGCGGTTGCGTCATTGTGATCTGATGTCACATTGCAATTGCAGTATGATGCGATTACGACAGTCAACGCAACTGTAATATTGCAGTCCGCA ATTTGAAATGCTGTTTATTTGACTTGTTGAATGTTAACTTGATCCAATAATTCATATATAGGACCTCTTTATGAAATCAACTCTGGATTCAATATTCCAA GTTGCATTTGGAACTGAACTTGACAGCATGTGTGGATCAAATGAAGAAGGGAATAAATTTGCGGATGCTTTCGATACTTCAAGTGCGTTAACGCTTTATC GTTATGTCGATGTCTTCTGGAAGATAAAGAAGTTTCTGAATATTGGATCAGAGGCCATATTAAGAAAGAAAACTAAAATTTTGAATGAATTTGTCCTTAA GCTAATCAATACCAGAACTACTCAGCAAATGAAGATTTCAAAGGATGACTCTGTTAGAAAAGGAGGAGATATTCTCTCAAGGTTTCTACAAGTGAAGGAC TTTGATTCAACATATTTAAGAGATATAATTCTAAACTTTGTTATTGCTGGCAAAGACACAACAGCTGCAACACTTGCTTGGTTCATTTACATGCTATGCA AGTATCCTGCAGTACAAGAAAAAGCTGCTGAAGAAGTGAAACAAGCAACAAACACAACAACAGTTAGTAGCTGTGCTGAGTTTGTGTCGACGGTAACGGA GGAAGCTCTCGAAAAGATGAATTATCTCCATGCCGCGATTACTGAAACTCTCAGACTTTATCCTGCAGTTCCAGTGGATGCAAAGATTTGCTTTTGTGAT GATACATTACCAGATGGATACAGTGTAAATAAGGGTGATATGGTGTCTTACCAACCATATGCAATGGGTAGGATGAAATTCATATGGGGAGATGATGCTG AGGAATATAGACCAGAAAGATGGCTTGATGAGAATGGTATTTTTCAGCAACAGAGCCCTTTCAAGTTTACAGCTTTCCAGGCAGGTCCTAGATTGTGTCT AGGAAAGGAGTTTGCTTATAGACAGATGAAGATATTCTCAGCAGTTTTAATAGGTTGTTTCAGCTTCAAACTGAATGATGAGACAAAAAGTGTCAATTAC AAGACAATGATCAATCTTCACATTGATGGAGGTCTTGAAGTCAAAGCCTTCCACAGGGATTAGCAAGTGATTTATAGATATATCCCAAACCCTATAGAGA TAGCCTAAGTATTTAAATATAAAGAAATGAAAGTGTATTTTATGATTCCTATTTGTAAGATATCTCATTGTAATAATAAGAGTGAAGGTTGTATTAGGTA GTGAACCGCAATCGTAAAGCTTTGTTGAATCTTTATAATATGGATGAACAATGTGATAATGTAATGCTAAATTGTTACTAGAAGCAATATACGTTGTATC ACCTGGGTACAATGTTAAAAGAATAAGGTGACTGAAATGTCGTCTAGATGTAGTGAAAAAT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_171139;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_415685

FPKM

• PAB: 0.9
• PNAB: 0.3
• PS1: 0.1
• PS2: 0.1
• PS3: 0.3
• PW1: 0.4
• PW2: 0.4
• PW3: 0.7

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_415685

• Blastp: Cytochrome P450 704C1 from Pinus with 49.71% of identity
• Blastx: Cytochrome P450 704C1 from Pinus with 50.14% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019433532.1)
• Pfam: Cytochrome P450 (PF00067.21)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;