Ll_transcript_414215

Id TrinityTRINITY_DN49664_c0_g1_i6
Name TranscriptLl_transcript_414215
SequenceATTGAATGTAGTTGAGGAGTTGAACTACCCAACAGGACCATTTATCATTTTAATTCAGCTAACAACCAAACCAGTCACACACATCAATAATAATAAAAGA CACATTTTTTATTACTATTTAACAATTCATCTTCAAATCTCATGTTTTTCATTCTTCTCTTTCACTAACAGATCTCAAATCAAATGGCTGCTTTCTCATC CCTTCTCAGGCGCCTCTACCTCACCGCTTACAATTGGATTGTTTTCGTTGGATGGGTTCAGGTTCTGTATCATGTTTTGAACACTTTGAAGGAATCGGGT CATGAAAATGTTTACAATGCAGCCCAAAAGCCATTGCTTTTTGCTCAAACCGCTGCTGTGTTAGAGATTCTTCATGGTTTGGTGGGATTGGTGAGGTCTC CTGTATCAGCAACCTTGCCACAGATAGGTTCAAGGTTGTACCTGACTTGGGGCATTCTATGGAGTTTCCCTGAGACTCAGTCTCATGTGCTCGTTAGCTC CCTATTAATCAGTTGGTCTATCACTGAGATAATTCGCTATTCTTTCTTTGGATTTAAAGAGGCTTTTGGATTTGCCCCTTCGTGGCTCTTGTGGCTCAGA TATAGCACTTTCTTATTGCTTTATCCAACAGGCATTAGCAGTGAAGTTGGTCTAATATACATCGCCTTGCCATTCATCAAGGTAAAGAATCAGATCTGGA AATGTGTACAATGCTTTTAGAAGCTTGTAGGAGAATTTAGGCCCCTGGTTGTTTTTTGTTTTGCTTGTCACAAATATATATCATGTCCTTTTACCCTTAT ATTACTAATACTGAGGGCAAGTCCTGTAAGAGGGCTTCCTCGAAACAGGAAGGTGCTTACAAACTTTGATCTAGTCAAGAGAGAAAGAGTTATCTTCTCC CTGAAATTTTGCATTATGCATTGTCTTGGCTCAATGGTAAGGTTGTTTGCCTTCTGACCCGAAGGTCATGAGTTCAAATCTGGAAACAGCTTTTCTACTC GCTCGCAGGGGTAAGGTTGCACACATCAGTCCTTCCCTGACTCCACTAGGTGGGAGTCCCATGCATCGGGCCCCATTTATCTTTTAAAACCTTGACCACC TGTGTTGTCTTAGGACTCCTAAAGTGACAAGAGAAATATGAGAGCGTTGATAGTTTGTCACTCATGATTGATTCTGAACTATTTGATATGGTGTTTTTTC ATGATTCAAGTTAATGCCATGATAATTTTCAGGCGTCTGAGAATTATTGCGTGCGGATGCCCAACACATGGAACTTCTCATTCGATTACTTCTATGCCGC TATTGTTGTATTGGGAATCTACGTTCCAGGTAGCCCTCACATGTATCGGTACATGCTTGCACAGAGAAAGAAAGCTCTCTCGAAATCAAAGAGAGAGTAG AGTAGTCTGTACTTTTTGCTTTCAGTTGTTCTTTTGGCCAAACATAGGATATATACGCATGTAATGGTTTGGATTCACTTATGTGTAGTAGAAATTCTTA ATTGCTAATGTATCCTTAGAAGAAAAATGCTGGAGAAAGAAAAAAAGAAATTAACTCCCAGTTTTTGTTCTTTGGTGGTTTTGTGCCCATTCCTCTAACT GAGGCTGTTGTTTTTGGACCAGGATCACCTGTCCCAACACCCTGTCCCAAACCCTATCTCTGCCCAATGAAATAATATAAAAATATTACTTTGTATTTTT ATAATTATTTTGTTTAATAAAATACCATTTTTGATTTGTTTGGGACACCAATGAGTAAAAAGAATCTTCATCCAAATTTTACTCCTTTTTATTTTTTTTC ACAACTATTTAATCCACTTTGGATTAAAAAAACTTAATTAAATGCTTTTAATAAGCTATTTTAAAGTACTAGATGAATTCATATTATCATTTTTTTTACA AACTGTTCTTACATGTATTATATCTAAATAAACTCTTCAATTTAAGTATGAATTAATAAATCTCATGTTTTTTATTTTAATTTAATGTTGTGGATTTATT TATAGCAGGCAGTGCAGTTGATCAAGGAATTGCTTACTTTCTTATGCTGGTGGCACTTGCAATCACCTACATGTTCCATTGATTTTTTTGTTATTGTTAC ATTTAGGAAATTATTTTTTTAACATTTTTTATTCTACATGTACTATGATAATAACAAGAGGGGTGTTGGCTAAGTATTATCACGGCCTTCAAAAATTGAG ATTATTTATCTTATGTGAGGAAATTCCAGATTTTGTTTGTTTTGTAATTATTATATAAATGTATTTAGTATATCCCTTCTTCTATATTCCCTCCTCCAAC TACCATTCTTTTCGTTTGCATATTATGTCTCAGAAATTGAGATTATTTGTCCCACTTTTTATGTCTCAATCTAATTAAAAAATTATTTACTTAAAAAATT TATAAAAAATATAACCTTTATATTATTTGGTTGGATATGATTGATTTGGTAAAATGAGACTTTTGTAAGAGTGGACTATTATTTCTATTTTTATTTTTGT TTAGGAGGCAGTGTTATCAACTTGTAACAAATAAAATACAAATTAGTCAACAGGTCAAGCCACCAAATTTGAATGTAATGAATATTCTAGAAATATTTAC ATGATGTATTTTGGAGAGAAAAAATAGTGCAAATTTTTAATATTCTACTAAACTAGTAGTCCATATATCAAACATCTTACCAAGTAAAACAAGCAACGAC TTATCTGCAG BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_171195; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_414215

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_414215

BlastpVery-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase PASTICCINO 2A from Oryza sativa with 78.82% of identity
BlastxVery-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase PASTICCINO 2A from Oryza sativa with 78.82% of identity
EggnogProtein tyrosine phosphatase-like(COG5198)
KeggLink to kegg annotations (4335343)
CantataDBLink to cantataDB annotations (CNT0002686)
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019445392.1)
PfamProtein tyrosine phosphatase-like protein, PTPLA (PF04387.13)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;