| Id Trinity | TRINITY_DN49700_c2_g1_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_455178 |
| Sequence | CTGTATTCTTCTCAAAATATCGATTCTTTGAGTTTTTACTAATCTTAAACTGCATGAGACTATCATTCATCTTCATGCTTTTCTTTTTCTCTCTCTCTCA ACTTTCTGCTGAAGTGGAAGCTATCTGACATTTTCAAAGCATGGATTTCTCTGGTGGTCACAAAAATAGAGGGGAATTGAGAATTCATGAGAGTTTGGAT GAGCTAAGGACTGATTTGGCAGATCACATTGCTGAATTATCAGATGCATCTGTGAAGGAGCGCGGATATTTTTCCATTGTTTTATCTGGTGGTTCTCTCA TTGGCTTAATGGGGTATCTGTATCTTATCTTTTTACATATATAATTATTTTTTTGGTTTTTATGATTTGGTGTTGGTTTAAAACTTGTGGGTTGCAAACA GAAAACTCTTTGAAGCACCTTATATCAAGACAGTGGACTGGTCCAAGTGGTATATATTCTGGGCCGATGAGCGTGTTGTGGCGAAAAACCATGCTGATAG CAATTATAAGCTCGCCAAAGATGGCCTTCTGTCCAAGGTTGTACCCTCAAGTCAGCATGTTTCTTTAAAGAATGGTTGTTCTCGGAATATTTTGGAGGAT AATCAGATAATGATACAATCAAGTTTTGAGTATTTAACTGTTCTTTACTAATTTAACTTCTTTCCTGGTTGCTTCTTAAAAGGGAAAATCAAACAAAAAT GGAACTAGTATATCAAATTTTCAAAAGTTGATGGGCTTTGATTTCTTCTTTTATTGCTAAATGACTGAGAAAATTCAATTGCTGTTTTAATTTTGAGCAT CTTTAGATAACCTTCTTGAATTGCTTTGTTCACATGAAATATAAGATTTTTACTTCAAGGTAACTCTTTTTGAATGTCCATTTATTTATATATTCAATAT TGAGTACTTTTTGAATGTCCACTTATTTAGCTGTTTGGGTCTCATTTTAACTAGTTACCTTATTGAGATTTACATTTATTCTGATGTGGATGTTGAGCGT ACTGAGAGTTGATAATGATATTTTGTTTACCCTTTCTAGTTCATTGAATTTGGAGACATACATAATAGTTTAAGTTTTAGATATGTTAGAAGTAGAGTTC TAATCCTGATAAGGATTGACCTTGATAAAGAGTCTGTGCTGACAAGCATGAGATTACTACCTAACCTTACTGGGCTTGGGCCAAATAAACCAGTAGATTT GTACAGTGCACTTGCACCCCAACTCAGTATTCGACGAGTCTAGTTACAGGGCGAGTTGTACACTGGGATGTATGAACGAATCTCAATTATTTGGTTCCAA AAACTTCACTGTTGTGGTTGCGTAGCTGAAGATAGGAGAGCTACGGGATCGGGATAGAACATTTAGTTGGCTTCATGAGCTTTTGAAGGTTGACATCGAC CATATTGAGTTGGTTTGATGTGTTCATGGGAGATAAACCATGGTTGCATCGACAAGATGACTGGTGCATGGTACGGTGGACTTTCAGGATTGATATCAAC TGTTATCACATCAGCGAGATGCTGAGGGCACCAGCTTGGTGTGTTGGCTGTGGTGTAAGTGCACTGATTTTGATCGATAAGATTTGACGAGGATTAATGT ATCAGATTATATTATTAAATAGAAAATTAAGACTTGGTTAGATTATAGGATTGAGATTGAAAGAGTCTTGAGTTGCATGCCTGATTGTTTGTTGGCACCA GAGTGACCGGAACCTTGATGCTTTGGCAAGTTGGCGAGAGACACGGTCATGAGCATTGGTAATTCATGATGACAAGGAGGTAGATCAATTTCTGTGCCAA TCTTCATTGATCCTAAAAGCGTATATTTTATGTTTCATAAGATGGAATTTAACTAAAATAATGTTCATTTTTAACCCAATTCCATGTCTTATGGGTGAGG TCTCCAGTTTCAAATTCACTGGTATCGACCCAAGTTGTATTTAATTTTTTGGTATTCTTCTGAAAATCTTCCCAAGCAAGCATCTTTGTAAAGGAGATTT CCCCATATTCTAAGAAAATATAGATCTTGGGATATCATCTTGACGTCTGATTTGGGTATTACTTGTGATCCTCCTTTGTAATCCTTAGACATTATTGGAT AATCTTTATTTCAATATCGAATTATTATTTGTCACCCTGATGTGCAGTTCTAAAATTTCTGAACCACTTTGAATTTATGGAAAAAGATTGTTGGATATAA AACCATTCATGAGCCTTCACCTAACAGCTTAAGCTTTTAGTATAGTTGGTCCTTGACATGGTAATAGTGCATCTATGACCAAGTGGCCAAGAGTTTATTC TTGCCCTTCCACTCCAACAGTTTTTAATTGTATTGCTACACACAAAGGGAATATGTTTCCCGTCAGCAGCAAATGCCTTCAATTTTTCCAACTCCCTTCC ATTACAAGAAGTTCAGGTACTGATTTCAGAATAAAGGTCTCAGCAGTGCTGAGGACCCTTATAGTTGACAATTATGCTTGTAGGTTGTAGACTTGTGGCA TTCTTGACTGCGATAAGCCGATACTATGAGAACCCTCTGAAGCAAAGCAGATAATCTCGTTCATCTGGTTTCTTTAGATTTTGAGCAGATTCTGAGTTAA AGGATTGTGTGTCAGTGTCAATTAACTATGCAGACCATGTTTATTCTAGGAAAAGGCATCTCAATCAAACATTCCAGTCCATCCTCAAGATCACAGCTTT AAGACCTTCTGTAATGCTCTGCATCAGTGCATCCAATTAGATGCATCTTTTCAACATATAGGTTATGATACCAACCATAATAAAGCACATAAAATTTACT ATATGCTTTCCCTGTAAGATATAGTTGTGCAGATGCAATTACAAGAAGCATTTTTTCTGTTATTCAGCTTTGGCATGTTATGAAGAGTGAGAATTTCTGA AAGAAAGAGAAACTATCTTGGAGCCTCATTTATCACCAAGTTTTAGAAATGATTTCTTAATGACAGTTTTATCAGTGCCCACCAAATTAGTTTTAGAGTA ACCGTATTATAGTTGGTTGAACCTGAAAAAATTCCTGAGAGTATCGTGCACAATGAAAACCCATACAGTGCAATATGCAGTACTATAAGGTTGCCATGCC AAGTCGATCTAGACCTGTATGTCTATAACCCGTTATCCATGAGTATTTTCTTAAAATGTATATAGGTATTAAAGAATACGAGGAATGGCTGCTGGAAGAC ATTTCAAGTAGTCTTGAAATGAGTGGGTGAAGATAATATGCCTCCAATGCTTGGTTATCTAATTTGGTTTCATTTTGTTTATCTTGTCTTTGGTCATATA TCATGTGAACTAATATTCCATGATTTCTTGGTTCATAGTTAATAGAATATCCCCTCGTTTTGTGTTCAATTATTATTAAGCACGGTATCTAAATATCTAG TAAGACTAAATTCCACCCATCTCTAAATATCTAGTGAGATTACAGCTTGGTTGGTTGTTTTTATCTCTAAATATCTAGCTGTTTACCTTTTGTGTTAGTC CTACTATTGTCAAGTTTATGTTTGCTGCATCTTCTAAATTAGCTGAAATTTATTTTTTGTCCTAATTTGTTCTTTTTTCCATCTTGCAGTGTCCTATAAA TTGAAATGTATGTTATCTTCTTGAAATCATAGGCCACACTGAATTAAACTTTCTAGCTATAAGTGTGATTATAACGAAACAGATGACAGCCCTTGATGGT CATAATGTACTGAGGAATAGTGGTGGGAAGAGGGAGTTCTTAGAATCTTGCATGTTTGGCCCTTGAGCAGATTATGTGTTTGCTATGTAAAAATTCCTTC TAGCAATTCAAGAAAATTGTTTTTTTATCACAGGTTAAGTAGCAATATAAGATGCACGATAATATTCCACCGGTGCACAACTTACTCTTGATGTATATCT GGATTTGTAACAGCTATTAATCAGGCCTTGGGTTTATGCACGATAATATTCCAC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_171537; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_455178
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Probable 6-phosphogluconolactonase 1 from Arabidopsis with 67.74% of identity |
| Eggnog | Catalyzes the reversible isomerization-deamination of glucosamine 6-phosphate (GlcN6P) to form fructose 6-phosphate (Fru6P) and ammonium ion (By similarity)(COG0363) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT1G13700) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_020211238.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |