Id Trinity | TRINITY_DN49708_c1_g3_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_454454 |
Sequence | ATTGTGGTTAAATTGCAATGATTTTTGGCTTTAAAACTGGTTTTAAAGACTGCCTAATCACTTGGTCTTTTAGCTTCTGAAACTGCTTGAAAATGTTGAT ATTCTGGTTGTATTTTGTGTGATTGAAACTGTTGATTCTGATTGAAATATCTTGACAGTTTCAGATGGATGATGATATTGATGTGTAACTGATTCTGGTT ATGTTTGCTTGTAATGCCTACTAATCTCATTCTATGCATTATTAACCTGGATCAGTAGCTTGCTAATGCACAAAAAAGAAGTCAAGTGATAAGAGAAACT ACTATAATATGTTAAGTATCACAACCATGATTCTGTTTGTATTAAAACTTGCATCATTATTCCAACCATGCTTCTTTGAGTATGTTGCTTTTTAACTTTC TTCACACCATTTTCACTAGACCGAAGGTTTCCATGAACTTGCATATTTCAACAGGGCAATGAGATATTAACATGGGTTTTATCCAAAGAAATATTTAGCA TGTTGAAGTGAATTGTAATGTTGAATGTTGAATGTTTAAGAGTAATCTTTAATAATTTTCTAAGATATTCTGATTGGTTCACCTTGTTAGCTATTTTCCA TGCCTATAATTGTTGAATTTTTACCTTCTTAACTTGTGAGTTAATGAACCTTTTCTATGCAAATTATAAGTTAATATTTTCCTGACTGTTTTTGTTGACA TGGAAGAGTATGTATGACTTGATTTATGGGACTTCCCTTAAGCATGGGTTTTAGGATGAAGTTGTGCCTCACTTCATTTCACGCCATTTGTAGCAGAAAG CACATTTGAGGTTTTAGTTTGTTGCTGTTACATAGTACATTATTTAACTTTTCATACATCCATAGAAGTTTGATAAGATAACCCCTAATTCTTGTGATTC TGTATGCATCATATTTGTTAACCAGTGCTTCTCTTATTTTTTTCTAAAAGAATTGATGATGTTACTATTAAAATTAAGAATATTTGCCTTAGGGAAGTAT ATGAACACTTAAATCAATGTTTATTTTATTTCATTATGAGCTATGTCAAGGTCTGCGATTTGAAGTACATTACTGGAAGTAACTTTCATTGTGTTCTTAT TTCTCCTTGAGATCCTGTTAGTACTCCAATGTTTCTTTTTTTATCATTGATGCCTTAAAATTTTCAAGGAAGAAAGTTTGGTTACTAATGAAATTGTTGA CAATATCTATGGTATCTGCACCACTTGTGCTAAATAACTCTTGATCAGTCTCAAGCAAACCATTTTAAGATTGGAATAATATTTGTTATCAAATGTATCA AGAATTGTTAGGCCCAAATTTATGAGATTATTTCCAGGTCCATTATTAGGGTATAATGCTTGCAATGTTTGTAACAAGATTGTGTTCAATGTTTGATCAG GGTTTCCATTGCTGTTGAAAGTGTATAATCTACCAATGAATGAACTGCACTTAGCCCTTTCAATTGTATGAGCACCTGAAAGTGCAACTAGATCAGCAGT GTTGAGGCCTTGATTAGAAAAATGCAGATTTGAGTTGTTCACAGGTTAAGGTTGGAGTTGGAAGATTTTGATTTTCAAGGGTTTGGCTTGCTATTAAACT ACCTCTTCTTCCCAATGGAACTTCCCAAGACCATTAGACAAAACCGAAGATATTCCAGCTGCCAGAGCAAGAACCTCAGCACAAGACACCATGCCAGGAC AAGCATTTTCAAAAGTTGTCTTGATCTGGTTCACAACATCTAATCCTCTTATTTGAGTTGTTATTTGGAGCAACACCTTGTTCACTAACTATTGTAGCAG TGTCATTCAACAAAGTTGATGCATCACATCCTTGAACAAAACAATCATGAAAGTGGTGCCTAATGAGACTGCCAAGTACGCGAGGATCAGATGTTGATCA AGCCGTTAAAGATGCTATCACTTCTAATTTGGTGATTGAGCTGTTCATACTTTATAAAGATGAAATAGTTGCTATGTCGTTCTTGTGGTTCTAGGTACTT ATCCAGATATCTTTTAATTTTGGTACAACTCAATTAATGTGGTTCTGGACATGGTTTATGGCTTATGCTTTTGCTGTTACTTTGTTCCATCTCTATTGTT TAAGTGCTTCTTTAATCATTAAACATGCTTACCATGTATTGAATTTTTCGTTCGGCATAATAGGTTCACATTAAAAGGGTATTGTAAAATTGTAATGATA ATGTAAAAGTGATGAACCATGTACATGCACTGATATCACATTCATAGTAATTATGATGCAGAGTGCAGAATAATCATCACCCCCTTTGTTTAAATAAGAG AGTTGGATTAGATTCAGTGGAGTTACATCTTGCTGCATAGATCACTCCTTTGGCAATATTTTTATTTACAATTTGAACTTTAGTACACTTACAATACCAA CCAATTTATCTATAACTTGAGGACCATCCTATAATGGAATTCACTTGCATGGTTCTAAAAGTTTGTATTTTGAGCTCATAGTGTTATGAAAGTTTGCTTT TTTATTTGAAAATGACCTATACACAGGAATTTCAAACACTTAATTTACATGATACACCATTTTGGGAGTTACGCAAAGCTCGATTTTGTGGTAGTCATGG TATGAGTATCATACTATTATGCCTTAATATTGTTAGTTGTACTTTTGAACTGAAATTTGGGTAAGATATGGCATGGAAATGCAGTTCCCTCTCATATCAA GATGTGGAAAAATTGCTCGAGCACATGAGGAGTCTAAGAATACCAAACGGAAGACTCTGGCAATAGAACTGGAGGAATTTCCTGGTGGTCCTGATATTTT CTTAATTGTGGCCAAATTCTGTTACGGATTTCGTGTGGAACTGACAGCGAGAGACGTAGCTTTGGTCTATTGTGCTTCAGACCACCTTGAAATGACAGAT GAATTTGGAGAGGACAATTTGTTGCAAAAATCAGAGAGTTTTTTCCATAAGAGTGTACTGCATAACTGGAAAGAGTGTATTTTGGCTCTCCAAAGTTCCG AGCCTGTTCTACCAAGGGCTGAAAAGCTTCAACTAGTGAGTAAGTGTTTGAATGCTCTATCAATGATGGCTTGTACAGACCCAAGTTTGTTTGGATGGCC CATGAAGATGTATGGGAGTTTTCAGAGCCCTGGTGGAAGCATTCTATGGAACGGTATAAATACCGGTGCCAGAATTCGGAGCTCAGAATCTGATTGGTGG TTTGAAGACATCTCATATCTCAGTGTGAGTTTGTTTGAGAGGCTTATTAAGACAATGCAAAAAAGAGGTATAAGAACTGAAAACCTGGTAGGTGCTATAA TGTACTATTCTAGAAAGCACTTGCCAGGTTTGGGTCGATGGCGAGGTGAACAAGGTGGCAAAACCAGAACGGTTGCAAGTTTCGGCCTCAGTCCTGCTAC TGTAGATCAAAAGGTTCTGTTGGAAAGCATTGAGAAACTTCTTCCTGAAAAGAAGGGCGAATCATTTTGCCGTTTCCTACTGGGACTTCTTCGTGTGGCT TTGATATTGAATGTTAACCAAACTTGCAAGGATTCTCTAGAGAGGAGAATAGGGACACAATTGGATCTAGCAACTCTAGAGAGTCTTCTCATTCCTACTT ATTCAGATTCTGATACGTTATATAACACAGGCTGTATCGAACGGATTGTCCATCATTTTATAACCACGGAATCAAATTTAACTGCCTTTTCTCCTTCATC ACTTGAAATGCAAGCATCGCCATCATCCGAATCATTAAGAAAAGTTGCAAAGTTGATCGATAGCTATATTGCAGAAATTGCTTCTGATGCTAACTTAAAA CCAGGAACAATACGCGCTCTTGCAGAGGCCCTACCTAACTCATCAAGATCATTACATGACGGACTTTACAGGGCACTGGACATATATTTCCAGGCACATC CTTGTGTATCCGATAAAGAGAAGGAAGAACTATGCAACATCATTGACTACCAGAAACTCTCAATAGATGCTTGTGCTCATGCTTCCCAAAATAAAAGGTT ACCCCTTAGAGTTGTTCTTCAAGTGCTGTACTTTGAGCAGCTGCATTTGAGATCAGCATTAACGGGATGTCTCAACACGTTGGATGGTGAAATTGCGCCA ACAGCTGCTGGTGCTGCAACTTCCCTCGGAGACACAGCAGGCGAAATTGTAGAAAGGGGTGGATGGGTGAAATTTGTACGCGAAACTCGAGTTTTAAAGT TGGATATGAATAGGATGAGTTCTAGAGTTGGAGAACTTGAAGAAGAATTCAGTAAAATAAAACAAGAAATGAAAAGTGTGACCAAATCTCATAGTTCCTT TAGTTCTCCTCGATTAATTGCCAGGAAATTTGGGTGTAAGCTCGTTCCGCGACTATCCGATGCGCAACCAGAATCCCTGGACCGCTCTGGATCCGCACCA AGAGCATCAGTTGAACGGGCACGCCGATCCCTCAAGTCCAGGCACAGTCAAAGTTTTTCTTAGTGTCAAGAAAACATAGTTCCTCTTAATTTTATACATA CCGGTCTTGTGTGGTTTTAAATTTTTTGTACGAGGGAAAGGGAAGGAAAATGTTTCTCAAGTTTGCATGTCTAAACATTTTTCATTTCTTTCCATTGTGT AAAGTTGGTTGTACATTTACTTAGACAATTTCACATATTCTGTTGGTCCAGATTGTGAATAACTCCTTCATTCATCCATATTGTAATATTCCTCATTTTT AACATCTTGAAGAACCAATCATGTAAGTTAATCAGCTTAGAGATTTGAGCTCAGGAATTGTGATATATAGCATAGTTACTTGTATAGGTTACAATATTGT ATAGTTTCAACACCATTGTAATTTTGTTTATATATGTCAAGACAAAAATAGAGTATGCTTGTTGGTACCTATATAACTTATCAATTTTCAAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_171603; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_454454
Blastp | BTB/POZ domain-containing protein At3g44820 from Arabidopsis with 60.59% of identity |
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Blastx | BTB/POZ domain-containing protein At3g44820 from Arabidopsis with 60.59% of identity |
Eggnog | BTB POZ domain-containing protein(ENOG410Y9P3) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G44820) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019436302.1) |
Pfam | NPH3 family (PF03000.13) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |