Id Trinity | TRINITY_DN49708_c1_g3_i2 |
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Name Transcript | Ll_transcript_454457 |
Sequence | ATTGTGGTTAAATTGCAATGATTTTTGGCTTTAAAACTGGTTTTAAAGACTGCCTAATCACTTGGTCTTTTAGCTTCTGAAACTGCTTGAAAATGTTGAT ATTCTGGTTGTATTTTGTGTGATTGAAACTGTTGATTCTGATTGAAATATCTTGACAGTTTCAGATGGATGATGATATTGATGTGTAACTGATTCTGGTT ATGTTTGCTTGTAATGCCTACTAATCTCATTCTATGCATTATTAACCTGGATCAGTAGCTTGCTAATGCACAAAAAAGAAGTCAAGTGATAAGAGAAACT ACTATAATATGTTAAGTATCACAACCATGATTCTGTTTGTATTAAAACTTGCATCATTATTCCAACCATGCTTCTTTGAGTATGTTGCTTTTTAACTTTC TTCACACCATTTTCACTAGACCGAAGGTTTCCATGAACTTGCATATTTCAACAGGGCAATGAGATATTAACATGGGTTTTATCCAAAGAAATATTTAGCA TGTTGAAGTGAATTGTAATGTTGAATGTTGAATGTTTAAGAGTAATCTTTAATAATTTTCTAAGATATTCTGATTGGTTCACCTTGTTAGCTATTTTCCA TGCCTATAATTGTTGAATTTTTACCTTCTTAACTTGTGAGTTAATGAACCTTTTCTATGCAAATTATAAGTTAATATTTTCCTGACTGTTTTTGTTGACA TGGAAGAGTATGTATGACTTGATTTATGGGACTTCCCTTAAGCATGGGTTTTAGGATGAAGTTGTGCCTCACTTCATTTCACGCCATTTGTAGCAGAAAG CACATTTGAGGTTTTAGTTTGTTGCTGTTACATAGTACATTATTTAACTTTTCATACATCCATAGAAGTTTGATAAGATAACCCCTAATTCTTGTGATTC 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Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_171603; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_454457
Blastp | BTB/POZ domain-containing protein At3g44820 from Arabidopsis with 61.81% of identity |
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Blastx | BTB/POZ domain-containing protein At3g44820 from Arabidopsis with 61.81% of identity |
Eggnog | BTB POZ domain-containing protein(ENOG410Y9P3) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G44820) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019436302.1) |
Pfam | NPH3 family (PF03000.13) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |