Id Trinity | TRINITY_DN49713_c0_g1_i4 |
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Name Transcript | Ll_transcript_455613 |
Sequence | GGAGGATGGAACGCCGGAACAGGGAAATGCATGGGCGGCGATGCTGCCGGAGATTCTCGGGGAGATTATACGGCGAGTGGAGGCTGATGAGAAACAGTGG CCGCAGCGTCAAAGCGTCGTCGCTTGCGCATGCGTGTGTAAGAGGTGGAGAGATGTCACACGTGACGTCATTAGGGCAATTCCTCAAACTGGGAAAATCA CTTTCCCTTCTTGCATCAAACAGGTTCTGCTTCAAAAAAATTCAATTTTTATCTTTTCTTTTTATGCTCATGTTTTAGTTGTTTCGATTTAGCTTTTTGA TCGATGCGTTGGACTTGAACTCGTACTATTAAATAGGATAGTTCGAGGGTTTTTCTAAAAATTCGATTTTTTTGATTGGTTTTTTACTCATTTGGATTAT TATTCAATTCTAAATTTAAATTGGCTTTTTTATATTATTTGGATTTTTTCTCTCCATATGATTTGGGAAGTTAGGTTTAGTGGTGAATTACATTTTATAT TTGCATATTTAGTTGTACCTTGTATTCAGATTGGGTTATCTTTCTACTTGGGAAGCTGCAGTAGTTTAAAGTTTAATGCAGAAGTATATTGAAGTGTAAA TTTGGAGATTGAGGTTTGTGGGTATTATCACAGTAACCTGGTTCTCTCATTAACCAGGATACCGTGTTTCGTAAACCGGATTCGCCTTAAAGAAACTCAT GTACTGATGATGGAAACATGGCAAACCATATCACAAAACCTGTAACTATGAATTTGCAATATCATTATCTATTTAGCAGAAAAAGATGGAAGAATTGGAA ATGATATTTTTGGTGGGTTTCTGTGAGGGGTTTTGTCTATTTGTAAATGGTCATGTTTAGTTGTTTGCGCACGGTGAATTGGGTTTCATTTCATTCTTAT CAGATAGAGCTCACTTATTTGCATTATATATATGTGTTTTAATTTGATTTAATACCATTGCCCAAGTCTTGCTAAAGTATGTGATATGTCTATGCAGTTG GTACTGATGCATTATTCAGTAAGGGTCTAAGTGATGGTAATTTATTGTGATAAATGTTCTCTTTTCTTTTAATGATATTGTATTTCATCTTCATTTTATG AGCATTTTGTTCTATGATGATGCATATTATTTGTTTCTCTGGTATTGAAATAAGATATTGCATATTAGGAGGTTTGGAGTTGGCAATAATCTTATGTTTT TGTGACTTGCAGCCAGGACCAAGCAACCTTCCGCAGCAATGTATTATAAAGCGTAACAAGAAGACCTCAACATTTTACCTATATCTTGCCCTTACACCAT GTAAGTAATTGTTGGTAAAAAAACTTTTTTGCCTAATCTAGAGATGGATAAAAATAACGTTTAGCTGAACTTGAACTTTTTCCCTTGATCTTCCTTTCTA GGGTAGTAGTGTACGGTCTATGTCTCTTCTGATGTATGTGTAAAAACTTGAACTGGGCTGCGCTTTGTTTGTGAAGTCTAGACCCAAAGGACTTCCTATA TTGAATTGATGCACTTTCCCTTTTGTGCATTTGAAACCCAAAAATTTGAAGGGTATTCATTATACTTGACAAACAGGGATATTGACTTTTATTTATATGC GCATATAGATGTAAGGAATTTGAATCTACCTACTTGGTTGACCAGACCTAGCCCATGTTGGCCTGCTTTTGTTAACATAGAAGCACCTGTGTTGAATTTA ATCTTCACTACTCTGATTTCATATAATAAGACAAACCAAAAGGAGTTCGAACGGTCGGATAGTAAGTTCAGTAAGTTCTGTTTTTAAACAACAACAGTAG CTATGTTTTCACAGATAGAAGTGGAAGGACATATAACTTGTAGTGTGCTTGTGGCCTGTGAGTGTAAAATGTGGGAACTGTGCATTTATTTATATCCTTG TAAGGAATCAATAGAAGAAATTTTATCAGCATAGAAGACCAGCCCTTGTTGAATTTTCATTTTAAGGACCGGTAGTATCAGAAAATTAGAACTTGTTCAA AGAATATACAGATTGTTACAGTACAATGAGTACATGTTGTGACTCAGGATTTAGATTATGGCATTAAATGCTGGTTTCATTAATTGCTTAATTCTTAAAC CCTTGGTCTCACAGCATCTTGAATCTTCAATTTCTTAGATGTTGTGTGGTGTTTGTTGGTTTCGGTGCTGATAAAGAACTTAAATGGTTCTCATTACGCA TAATCTGGTAAATATCTCAATCTGTAGTAATTTCAATGTCTTGAAATTAATTGCCTGTTTGACTTGTGAGTGACATTTCTCAAGTAGATCAATCGAGTCA ACTGAGTATCTCTAGGATATGCTTGATACTTGATAGTGGTACAGGTTAGCAATTGGTTAGCTTTCTGTTGTGCATTTGGCCTTTCACTTCCTTGTAGTGT AATAATAGATCTCCCTTATAACAGTAGATTGCAATGTTATAACTCTTAAACTATTATTGGCTGCAAAATTATTTATTGTAGAAATTTTGTGGGGAGATGA AGTTTTGAATATTCAGTCAGTTGATATAGATCGATGAACTGTTGAAAAGTGTAATGTTTTTAGAACATTAGTGATATCAGAGTATAATAACACATGGTTA ATCATATCTATAAATAAGTTTAGGTTAGTGATTAATTTTTTTAATGATGATCTACCTAGGCTTATTTGCCTTTAATCTCTGTAGTCCCTGAAATTTTACT TCATGCTAGTGTTCACTTTTTGTGATTGCAGTTTTGCATTTTCTTTGATGTGCTGGGAATTTATGCCTCACATTTTTTTCCTCCCCCTGTTTCCAGCATT CACAGACAAAGGGAAGTTTCTCTTAGCAGCTAGAAGATTTAGGCATGGTGTCCATACGGAGTATATAATATCACTCGATGCAGATGACTTGTCCCAAGGA AGCAATGCTTATGTTGGAAAGTTAAGCTCAGATTTTCTTGGCACCAACTTCACAGTATATGACAGCCAGCCACCTCATAGCAGTGCAAAACCATCGAACA GCAGGGCCCGACGTCGTTTTGCCAGCAAGCAGATAAGCCCTCAAGTTCCTGCAGGCAACTTTGAGGTTGGGCAGGTGTCCTACAAGTTCAACCTTTTGAA ATCAAGAGGGCCAAGGAGGATGGTTTGCTCGCTAACTTGTCCCGTCTCATCATCAGAAGACAGTTCAGATAGCAAGAATCCGGAGATGAACCGTAAGGAT CATTTTGCTCCTGGCTCCTTAATCTTGAAGAACAAAGCTCCAAGGTGGCACGAGCATTTGCAGTGCTGGTGTTTGAATTTCCATGGACGTGTAACTGTAG CGTCAGTGAAGAACTTTCAGCTGGTTGCTACTGTAGACCGGAGTAAACCAGACGGGAAAGGCGATGAGGAAACAGTGCTCCTTCAGTTTGGGAAGGTAGG GGATGATACCTTTACCATGGATTATAGGCAGCCCTTATCTGCTTTCCAGGCATTTGCGATTTGCTTGACTAGCTTTGGCACAAAGCTGGCATGTGAGTAA TGTAATTTTGGTATCATCATGCTTATTTATTTTATGGACTTTAAATGAATAGTTATTTTTGTTAATCCTATCACTCAGTTGAGTCAACAATTTGATTGCT GGAAAGCTTCTTGTAAATGTGAATGTATTGTTACTAGGACACTGCATGTTCCATAATCAAATATACATTGGTCCCGGCTTAAATATGTTTTTAATCTCTA ATGGAATTTGATGATTTTGATATTCCTCATCATATGAAAACCATGATTTCATATTCCCTAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_171644; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_455613
Blastp | Tubby-like F-box protein 7 from Arabidopsis with 79.6% of identity |
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Blastx | Tubby-like F-box protein 7 from Arabidopsis with 78.8% of identity |
Eggnog | tubby like protein(ENOG410XQFT) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G53320) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019453558.1) |
Pfam | Tub family (PF01167.17) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |