Ll_transcript_453558

• Id Trinity: TRINITY_DN49720_c0_g1_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_453558
• Sequence: CCAGGTTCAGTTTCTTTTGAGGTCATAGCTTGGTTATATTTACCTTGAAGTATTCTTCTTTTGTAATATAATAGGCTGATTGCAAGTGGGCTGTCATGGT TTTGTGGTCAGCATTTATCAACCTAAAGTTCAGTAGGCTTAAGTGCCATACCATACATGTTTTCTTTAAATATGAAGTGAAATCATGGAATATAGGTCAT GCATAATATGTTTATGTTCATAGAGATGAACTTAAGTTATCTTATTTTGGGTCACATGTTTCTTAAATCATAGTTGTGAAGGAACTTTATGAGGCTAGCC TCTCTGTTGTTATTATTATATGGTGGTCCTTGTTAGAGGAAATACGCACCCTTATGTAAATGCTTGAAAACTTAAAAGATATGGGCTTATTTTGATGCAT TATGTCTGTGTTGCCACATTCACAACTTGCTTTTGCTAACATGTCACACGTGTCTTGATGTTTTTACATAACAAATTTTCTAGCTTGTTGCTGATGCTTC AGTCTGACTCCATTCTTGTTATGACTCAATATTATGCGTTCGTTATTTTTTATTGCAGATTATGCTTACAAGGCAATTGATGCATTGCCTGTATCTGCTC ATGCAATGACTCAGTTCACTACAGGTGTCATGGCCCTTCAGGTTTGTAACATTCTTTCTTCAATTTTCATTTTTTTTTATTTTTTTCCTTTTGTTTCTTA ATTAATTTTCTTCTTTAACTAAACTGCTTAGACTGCCTTATTCACTCTTTGACATTTGAATTTGTGATAAAACCTCCTTTTTATTTAGAAAAATGGCCTT TGGTGGTTAGTGTTTTGTTCTGTAGACTTATTTTCCGATATATTGATAATTTTAGCAACGAAGGTTTATAAAGTAAAATACCAGAGGGTGATGATGATTA AATTTTAGCTCAGAAAAGAATAAGTTGGGAGGATTAAACTGACAACAAGCCATATTCGACTGAGAAAACTCCTCAATAAACACACTTAATGTGCCTTTCT CTGGTTCAATCTCAACATACACCTGCACTGTCATAATTTTGCCTGAACATTTTGGTTTGTATTGCAAAATACTGCTTTTCCTATTATGAGTGTTTTATAG ATTTATGAAATGCCTGATTTCAAGAATATAAAATTGATTATAGCTTACAATTACATTTAATTTGTGAATCATCAACATTACTTGATATTCTTCTAGAAAT GCAGTATTTTTGTGAGCTAGGTCAGTGAAGCATCTATGAAAATTGATTCAGGTGTCACTATGTATTCTGACTAGCAGTTGCTTGTTGGCCTTCTTTATGC CAACTCTTCATATGTTGAATCAGTACTTACACTTGGAGGAGATTTGGACTACTTGCTTCATCTCTTTTACCATACTCATCTGAGATAAATATGGTCTAGA GGATTTCTGGTGCAAGATGATGTTGCCATTGATAAAGTTTAATTAATTAAAGGATAATATAAAATATTGGATTGTGGTGTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTT CTCTTAGATTACTATAACTTTTTTGGCTGATCTCATGGGTCTAGCTGCCTAATGTCAGCATTCTGTAGTTATGTTTGTGTATATTATTTATGAAAGGGTG AGGTGACATCTCCTACTTATCTCAAACTCAGATTATTAAACTCAGTCAATAAAGAAAGAGACATAACTGTATTGCAGATGCAGTAGAAGTAAACTCAGAT CATGTTCTTCTAATTACATGACAAGTTTCTCATTTTAACGATGGCTTTTCTTCTCTCCGGTTTTTTCCTTTTTCTATTGTTCCTTTCTGCTCCCCATATC CATCTAAATTTAGATTATTCTTTTCATGAAAAAGAAAAGGGGAGTAGACACATTTATCTAGAGTATCTTGATGCTAAGGATCATAGTAAACTAAATTCCC TTTCTAATATTTACAGTTTTAATATTCTTGTAATAACTAGGAATGATTCACAATCAATCTATTTCATTTTCAGGTTCAGAGTGAGTTTCAGAAAGCATAT GAGGGTGGGATAGCTAAAGCAAGGTATTGGGAGCCAACTTATGAGGA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_171680;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_453558

FPKM

• PAB: 0.8
• PNAB: 0.4
• PS1: 0
• PS2: 0
• PS3: 0
• PW1: 0.2
• PW2: 0.2
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_453558

• Blastp: -
• Blastx: Citrate synthase, mitochondrial from Citrus with 70.27% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019443636.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;