Ll_transcript_455155

Id TrinityTRINITY_DN49725_c0_g1_i8
Name TranscriptLl_transcript_455155
SequenceGTGTACAGTTTTTTTTTATTTTATAATTTATAGTGGCGATTATAGAAAATAAGAATCACTATTTAGTCATGAAGTTCCAAGTAGGAAATTTGATATTAAT GCCTCTGCTTCATTTTTGTTGTGTATTTTTTTTTTTGTTTTCTCTAAGGAGAAGGTTAATTCTCCTTTTTTTTTTGTACTGTTTCCTTCTTTCCAATGAA TTTCTTCTTTTGCCCTAATTCCAAAAAGAAAAGGGTAGAAGTTATTAAAAATAAAAACCTGATATTCCTTCTTACTATACATTTCATATATGCCTGAGCT GATTTACAGGAGTTAGATCAAGTGAATAGCATATCTCTAGCTGACACAGCATCAGTTCCCCCGTCTAGAAATGATCTGATCAGTACTTCAGAGCAAGTTT TGGTCTCAGATACTCCATTACATTCATCTCCAGCACAGTTACAGTCCCTTAGGTCTTTCGATTGGATAATTTCTGAGGTGCAATTTTCTTTTCAATACCT TACGAAAAGGAGAGATAAGAGGCTTTCTTCATTGCCATCTAGTAAGCATAGATGTGGAAAAGCTGATGTCAAAAGCTGCTATACAGCTGCAACTCTGAAG CTTTCACAACTGGAAACTGAAGAACAGAAAGAAAAGGCTTTAGCTTTAGCAACTACTGAACTGGAAAAACTTTTCAAGAAGGAATACTTCAGAAGCATGA AGGTGATTGGGCAATTCAATCTTGGATTTATCATTGGTAAATTGGATCAAGACTTATTCATCGTAGATCAGCATGCTGCTGATGAGAAGTACAATTTTGA ACGTCTATCACAATCAACCATCTTAAACCAACAGCCTTTGTTTAGGTGAGGAGATTATATTCATTGTTCTTTTATAATCATTATATTATGGGCATTATTT TGGCACCCATTGTTTTTTCTTGGGTATGGGACCCATCAAGTATTTCATTTGCTTAGACTGTCAACAACATGGTAGAAGGATATTGCTGATTCTGATGCAA ACTTACGGTAAAGGTAAACAAACTTGTTGAGTTCAGAGTCGGAGTGCTTAGAGTAGAAGCTTTGTTTTTTTCAAGCACTATTATCGTAAATGGACGATAT ATTTTCCACACTGCTTAGACAGGACATGTAGAGTAGTTTCCCTCTTCTCTTTATTTGTTCATGATCTAAACTCTACAAAGGTCTGAACCGTTGTCCCAAA TTACATATGCAGGCCACTAAGAATGGAGCTATCCCTTGAAGAAGAAATAGTTGCTTCAATGCACATGGATATAATCAGGTAAAATAGAGCCGTCTTGATT TTACTTAGCTAAGGTTGTTTCCTAAACTAGATTTATTTGCCAGGATCTCAATATCCACCCTGCATCAATTAGACTGCTTATGTTTACTGTTTACTATTGC CAGTACACAAATGTTGCTGAAGCTTTGTCTTTTACTTCTTCATTTAATTAACTGGGTTGTCAGAATGAACTGCCAGATGCTTGTCTTCTGCTTATTGGTA CACCAATATTGCTTGATCTGGTCCCTCTTGCATTGCCGGTTGCTTTTGTCTATGGAAATTTCATTGAAATTGAATATATTGTTTTAGTTATGAAATTTAA TTAATTTTTCGTCCCATCCCTGTGTCTTTAAGGTTTTAGTGACATGCATTTCCATTGTATCAATTTTTTCAGGAAGAATGGATTTACTTTGGAAGAGGAT CCAAATGCACCGCCTGGATGCCGTTATAAGTTAACATCTGTCCCCTTCAGTAAAAACATAATGTTTGGAGTTGAAGATGTTAAGGAGCTGATCTCTACCC TGTCTGATGAGCATGGGGAATGTTCCATTATTGGTAGTTATAAATTGGATACCTCAGGCTCTATTTGCCCTTCGAGAGTTCGTGCAATGTTGGCTTCCCG TGCATGTCAATCATCAACTATGGTTGGTGATCCACTTGATAGAAATGAAATGCAGAAGATAGTGGAGCATTTGGCTGAACTAAAATCACCATGGAATTGT CCCCATGGCAGGCCAACCATGCGCCATCTAATTGACTTGACTACAATTCATAAGAGCTCAGAACTAACAATGTAGAGATGTAGATTCGTTATGAACTTTT GATCTAATTGCCATTGGAACAGTAAGTAACTCTGTAACTTATTTTGTACAATTACTGTGTCCGAAGTGTTGGTCTTGAAAGAGTATGCTTGGTGCAATAG TGCTGAGCTTCTTATTGGGCAGTCTTACCTCTTGACATTGTGTTCATTTGCTAATGGTGTCTTTTTAAATGCTTTACCATTTGAGTCAACATATCATTTG TACTAAAATAATTTGAAGTATAATAAAAGGGGAGAAACATATGAATCTATATATGATAATTAATTGAGTATAATGATCTTAACTATTCAACATCTTCAAT GATTTAGATTGATGTTCATTATGCAAAAATGAGGAACTCAACCCAGTAAAAATTTAAAACATTCAGTTTCAAAAAAGTACCAACATTAATTCTCAAATTT TAGTGAGCCAGCTATAAGTACTCTAAAATTGCTGATAGATTCACAACAACAGGAAAGTTTTTTTCTATTAATTACAAAGGCAGTCGAATTCTCAAAAAAT CTAATGTCTAAGTGACCCAGGGGATATCCAACAATTGTACTACTGGAAAACAAATAAGCTTTTTAAAAATTGAATTAAATGAATATCTACTCTGAAATAT TCAGCAATATTTTTAAATAAGATTTTGTAAATTAATTATGACATTTTTTAATCATGTTAAAAAATGTAAAAAAGAAAATGCAGGTCGAGGAGGCTTCATA GCGCCTTAGTAGTAATGATATATAAAAAAATAAAAAATGAGAAGAGAAAGTGACTCCACACTTCACAACTTAGTTGAGTGAGTTTCCAATAGCACTTCAT AGATTGTTCGAAAGCATTGAAAATTATTAGGTTAGGTTTGAATCATTGTATTTAAATTATAGAAGAAAAGAACGAGAACAACACAATAGCGATCAACCTC TCTCTCTTCACAATAAAACGATTTACGTAATCACACAGCATTTCCACTTCAACCTTCGATTTACAACATGTTGCCCCTTTCTCTTCTCAAAACTGCCCAA GGGCATCCAATGTTGGTGGAACTGAAAAATGGTGAGACTTATAATGGGCATTTGGTTAATTGTGATACATGGATGAACATCCATCTCAGAGAAGTTATAT GCACCTCTAAAGATGGAGATAGATTTTGGCGTATGCCTGAATGCTACATTCGTGGCAACACGATTAAGTACCTTCGAGTTCCTGATGAGGTTATTGACAA AGTTCAGGAGGAATCCAAGAGCCGCACCGATCGCAAACCTCCTGGTGTGGGACGTGGAAGGGGAAGAGGAGGTAGCCAGGATGGTCCTGGTGGACGTCCA GCAAAAGGAATTGGGCGTGGTGTTGACGAAGGCGGGGCTAGAGGGCAAGGAGGAAGCCGAGGAGGAAGGGGTGGCATAGGTGGAAAGCCTGGTGGAAACA GAGGTAAATCACCCCCTTCATTATTCCAAAATTCGTTCACTGCATGCATGTATACCAACTGTTAGTTTTTCGGCTTATAACAATCGATATGAATATTTTG GCTTCCATCTCTCAAATTTCTTATGAAGGAGTTCAAAGTAGTCCATGCTATTTTCATTTATTTTGCCTGGATGAGCTCCTGATGAATTCATCAATGTAAA AAGTAAATTATTACTAAAGGAACTCAATGTCTTATGTTCCCTTGTTTTGATGTTTAAGGGGAAAACGGGTATGGGAGTTTGAGTTATAGTAGAGAGAAGG TATATGTTAGTAAGTTAAATCCCAATGTAGTTCAACTTTGTGTTGGAATCCTATATCACTTACCTGAGGGTATTATACGCGATCCAATGAATAGCTAATA TAAAATAAATCATGTCCCCATTCTTCCATCCCTTCCAACATGTTACGTAGCATACATCGTGTGAATGAATCTCGTTCAATATTTTTGCTTATTCTGATAG CTGCAGGGCGAGGCAGGGGTTGATTTGAGTAAGTGATGTTGGAACTACTGCAGTTTGATGAGTTGCTACTTTTAGAGCCATTGGTGCTCGTTCATCAAAT TTGGCCGATTCTGTTTCCTGTGCATACTTGGATTTTATTTTTTCGATGTTTTTCTTGCGCTCGTGGTCTCGAAAATGGCGATATTATAGAATTTACAAAA GCTTCTATTCAGACAATATTTTATAATGCCTTCTCTATGGTAAACTTGCTTTTGTGTGTTAGTTATTGAATAGCTCCAAACTTGCTATGGTTGGAAATGC TCCTTCCCAAAATTGAATTCATGTTCCAGTAATTTTGAAGGCATAGAATATGATATTATTCATTTTGTCATGTTCTATCTTTATTCTTGCCACTGCTGAA GCCTGAACTAATAGAAAAAATAATTTGCTTAGCATGCCTTAAATTTAGGCTATTTGTACTCGATTTTGTGTATTGGCGCTCTCTTACTTACTGCAAACTT TGATTTGCTGAAGTGCGCTTTATTGATTGATATTTTTAATAACATAAATTTCTTTTTTATTGTTTGTAGTGACCTATTTACTCAGTTTTATTATATCTAA CAATTTTACAAAAGGAATTG BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_171738; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_455155

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_455155
BlastpProbable U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4 from Nicotiana with 89.26% of identity
BlastxProbable U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4 from Nicotiana with 89.26% of identity
Eggnog-
Kegg-
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019441764.1)
PfamLSM domain (PF01423.21)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;