Id Trinity | TRINITY_DN49731_c1_g1_i3 |
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Name Transcript | Ll_transcript_453637 |
Sequence | AATAAATGGTAGAAAATGAGATTATAAGAAAAACAAATAAAGAAAGGGAAGAAAAAGTAGCGTAAAAATGAGTCCATTATAGCGTGCAAAAAAGAATAAC TCCCATTCTCTTTCTTCCTTTTCATTTCTCTCTCTATTTCATCGCCTCCAATTTCGATCTCTGTTAGAATCTCTCTTTCTTTCAATTTTCCTTCAAATTC TTTTCCTTTTCTTCCATTTTCATCTTTTTTCAATTTCTTCGTAGCTTCTGGTACGACCATTTTCTTCTCTTTTTCTATTTTCCATTTCATTTTTCCGATT TGCATGTGTAACAGTTTTAAACTTTGCTATTCGTTTTTTTGAACTATTAATTTCGGAAACAGATACCCATTTCGCTTTAATTTGTTGCTTGAAGTTAAAT TTTCAACCTTTCTCAAATTTTTCTTAGTTTTCTCGGTTTCCAAAGACATGGGGAATTTTGTTTTGTCCACACTATTTTTCTGGATAATTATTTGTTTTGA TTTATTTTAATTTCAAAGATCTATAATTTTATTATCATTGTGTATGATTGGATCTAAGGTAGATAGATAAAATTTACTACCATGTGCTTTTCTTTTTAGT TCCATGTTCTGCTTAATAAAATATTAACCTTTTTTATATTAAAATTTAAATTAATCTTACTTTGTTGGTTGTCTTTGCTTGCTATTGTTGTTTTTGCATC TTACCATGTTGTTTCCTTTTGGTTGTTTTAATAATATATCAATCTCTTACTTTGTTTTGTTTCTCTTTATTGCAGTGTAACTTATTTATTATTGCCTGAT TCACTTTGGTCTCTCAAGTTAACTTGTTGGATTCATTATACAAATTGAAAACTTGGTGAGTTTTTCCTTCTTATCATTATAGCTTGATGATGCATAGAGT GCTTTGAATTCAGAACTTTATAATGCTATAATGGAAATTTCTTTGTTGAAAGAATGAGGCTGGTATTTCCAGGAATTGTTTTTCTTTTTTATGTCTGTTA TTGTTAGCAATTTGCACTGATGTGACCAATTTTATTCTTGATTTTTCTGTTAACTAAGTAAGCATGTATTTGTTTTTGTATTCAGCTTGCTTTACACAAA TAAATTAGTGCCATTGTTTAACCACGCTTAGAATATAAATGTTATAATTTTTTATATAGTTTACCTCATTATTATGTTGGTCTAATTCTCAAATTGTTCT CTCATTTAGAATTTGTATTGTTCCCTTTGATGAGCTTATTAGATCTAGATCAGAACTTATTTTGTTCTAAGAAGTTTTCCGTGGATGAGTTATGTAATAT CTGCATGTTTCTTTAGAGCCTATTCGATAACATGTTAATGTGATAGTGGCAGAAGCCATGTTTTGGTATATGCTCTTATTTTGGTTAATATCATGGTTGT CATAAACTGTGATAGCATGCAGACATGTGTTGCACAAATGAGCTTCTCTGAGCTGTTATAAATGTTTAGAGAGGGCTTGAGTTGGGTTTAACTTTTCATA TGTGAATGTCGAATAGTGGCGTTTATAAGCATACCCTTTGGCAGTTGCAATTGCTGTGTCCTTTATGTGTGTTTATTATCAGGACCTTCATAAAGCTTAT CATTAATGATGGATGGATTTTATTGTACAAGGAGATTGAGGGGCATGCACATACTTGTATTGGAATTTAATATTTCCATTGTTTCTGATCACACTTAGTT ATTGTAGAAATTTTGAATATGCACTCAGCATTTATGAATGTTACTTTCTTTCACAATTCATATTAAAATTACGTAAGAGTATTTACTACGTAGTGTGAGA ACCTAATCTTTAGATCCCCCTTTTAATATTATGCAGTTCACAATTCTGCTCGAACTGAAATGGCAAAAGGAAGCAGGGGACGATACAGAATTGCTTCTCG TCAGTATAGACTAGCTCCATACCCGTTGGCATCTTGTAAAAAGGATATCTGCGAGGATATGTGCCAAAAGAGATGCTCTAAAGCCTTTGACAAGAAAGAG TGGGAAAATGTAACCTGTTCTGTGTGCATGGAATATCCACACAATGCTGTTCTTCTCCTTTGTTCTTCTCATGACAAGGGTTGTCGTCCCTATATGTGTG GAACTAGCTTTCGTCACTCCAACTGCCTTGATCAGTACAAGAAAGCTTGCACTAAGGTTATGGAAGACTCTATCGGCAATCCAAGCTCGCTACTGGATAC AAACTCAGCCCTTGAGAAGAGTGAAGTCACAGAACTTGCTTGTCCCCTATGTCGGGGTCAGGTGAAAGGTTGGACTGTTGTGGAGCCTGTTCGGGATTAT CTGAATGCAAAGACAAGAAACTGCATGCAGGATAACTGCTCTTTTGTTGGCAACTATAAGGAGTTACGGAAGCATGTGAAGGCAGAGCATCCATTAGCGC GTCCACGCGATGTAGATCCTGATCATGAGCGGAAATGGAGATCGCTCGAGTGGGAGCGTGAACGGGAAGACGTCATCAGCACAGTAACATCAACCATTCC CGGGGCAATGGTTTTCGGAGATTATGTTATAGAACGACACCATAATGACTTTGATTCAGATGCAGATGAGGATGGTACAGATAGTACAGAAAGAAGTGGA AGATTTCAGATGGGTATGGAGGCAATGAATTTCTTCCTCCTGATGCATGCAGTTCGGCAAGGGAATGACCTTAACAACCTTAGTAGACAACTGATGCCTG ATATGATTCCCACAGGTCAGAATGGGGCTGGTGAGCTGGATTTCTCTGGCGAAGACAATGATAATGATGGTGCCGAAATTCTATTCGGCCGTTCGAGTAG GAGGCGTAGACGACGAGAAGCACCGACAAGGATCGGGGGCAATTGAACATCATGCTGTAAACAGGAGGGATGGTTTCTTAGGCATATATTAGCAGATAAT TTAGCACCACCATCAAGTGGTGAGTTAATAACATTTGAAGGGTTTCTTTCCCAGAAACATGAAAATCAGAAAATGGGCATTTTTATTTAATTATTTGTTG TAATTTATTTTACATGTACATTCTTACCTTCCTCCTGTTACCTTGGCACATTCCATTGTGAAATTCACTCATGTAAATATTTGTTTTTATGAAATCTTTG ACATTGCCATGTAGAAGATTGAATAGTTGCTAACAGGCCTGTTTCAACTAGTGTTTGGTCAATGAAACTTCAACTTTTGTTTTAAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_171774; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_453637
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019464549.1) |
Pfam | Protein of unknown function (DUF1644) (PF07800.11) |
Rfam | - |
GO | - |