Id Trinity | TRINITY_DN49733_c1_g1_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_455588 |
Sequence | AGCTAATTGAAGCTCATAATTGAAGTATGGATTCAATTTGGAGTAACGATGACAAACCAGACGCTTGGCATTACTCTCTGGCGATCTATTTTGCTTTTGC ATGTTTCTTTCTTAGATTCATACTTGACAGATTCGTCTTTCGTGTAAGATTTTTTGTTTTCATAACAATTTGCTTCTTTAACATTCCATTGGATTCTTTT AAATAGCAGCATGTAAAAAAGTCATTTTATTAGTTCAAGGATCTTTAAGTTTCTGTGATTATGGTCTAAGTTTACATATGCTTTCAAATAAGAATGTGCA TTATTATAACCACATGTTATTAATTGTATTAATTTTGGTGATGCCTCAACTAATTTAATTTGATTCATTTAGGAAAATAGTGTAATTCAATAATGCTCTT AATCCCAAGTTGATTATGAGTTGTGTCTTTTGCTCATTATACATGTATCATTTGTTAATTCTTCTTGGGAATGATTAATGACTAATTTGTTCTATTGTTT CATCTTCTGTTAGCTTTAGCAGCAACCTTGCAATTTTGTGTTTTTGTAGACCTTAGTTTCTAATATTACCAATGGAACAAGGGGAAGCAAAACCAAGTCA TAATTATTTGTTGAGGATTTTAGAAGAACAGTATATCCCTATTCGCTAAAGTGTAAATCCTACATTGGTTTGAGTATATGAGGTTTGGACGATGAAGGGA AAAGTACTTTAGATCTTAATGTTCTGCTATGGTTGGAAGAGGTATTGTAACAAATATGAAGGGAGCTGTTTGCTGAAATTGATTGGAATGAAATGCTGGA GTCTTGTTTGGTGTCTTTCATGAATAGTGGGTTAGCCCCATGGACTTACAAAAAGTTCCTGGGTATCAACTATCAATTACAGGGGATTTGACTCTAGCAA AGATGCTAAGAAGCTTTGGCATTGTGCTCACTCTGTGGTTCGTTGGTGCATTTGGTCTGAAATGAAATCTAGAACATTTCTAGGTCACTGGGTCTCTCTC ATGGGCTAAGTGAATCAGTTTAGGGTGCAACTGTGGACAGATAACCTTATCAAAATATGGTTGGGAAGTTAATCCATTTTTCTCATACCAGGCTATACAT AGCTTTATGTGGTAGGGTGGTAAGTCAGTTCATGCATTATCCTAAAGAAACTCACCATTTAGCTTTTCACAATTCTCAGCATTCTGTACTACTTGAAAGG AACTCCTAGGAAAGTAATTCTATTTACAAGAGGGAACGGGGTGACTTTTGGAGGCCATATAAAACGCCGACTAGGCTGGATTAGTAGACGAGAGAAGATC CACCTCCAGACACTGCATGTTTCTGGAAACTTGGTAACTTGGAGGAGCGGAAAACAAAATGTTGTTGCAAGGTCAGCAGAATTACAAGCTATGGCCTTAA GGATCTCTGAACTTCTAGGGCTGAAAATAGTTCTAGAAGACCTTTGGAACTGTGCTGTGATAGTCAGCACTCAGCAATAAACATTGCACATAATCAGGTG CAACACAATAGGGCCAAACACGTTGAAGTAGGAAGATACTTCAAAAAGGATGAGTTGGATAATGGGACAGTTCGAACTCCAACTTGAGGTGGAGTGTCAG AATCCCTCTATAAAGAATCTTTCTTTGTATAGGAGAGGACTGCGGGAACAATTTTGAGTAGCAGTTTAGGAGTTCCCTAGTTTAGATTGTCTGGTATTCT ATTTAAGAGCACGCTCTTCCTAACGAAATTAACAGAAAAATATTTTCTGGCAATTATATTATTGACTTCATTTAATTAGAATATTAATGCCATTTCTCTA GCAGATTCCGAATCATTAAATATTTTTTGTGGCTTACAGAGGTTGGCCATCAGAATGTTGATAAAGGGTAAGACTGCGCCAAGGATTACTAAGGAAATGC AAGTAAAGATTGGAAAATGCTCAGAGTCAATGTGGAAGCTAACATATTATGCTACAGTTGAATTATTCATTCTTAAAATCATCTACCCTGAACCATGGTT CAGTAATACGAAATTATACTTCGAAGACTGGCCAAATCATGAGTTGAAGAGTCCCTTAAAGATTTACTACATGTGCGAATGTGGGTTCTACATCTATAGC ATTGCTGCTATTCTCACATGGGAGACTCGAAGGAAAGATTTCGGAGTGATGTTTTCTCACCATGTAATTACAGTTTTCCTGATTGGGATCTCATATCTAA CTAGGTATTCTCTTAGCCCTATTTTTAATTGATAAATATATCATGCCAGAAACCTAAATTTGAAACTTAATTACTTATTGCTTTACATGAGCATGAAAAT CTCATGTGCTGGCTCATATTCGATGCTCATTACTGATAACACAATTGAAATCAGTTTAGAATGTTTTTAACTTTTTATATCTGTTATAAAATTTAGGACA GGAATAATATTGTCTCCTAAGTAATATGCATAATGGTAATCATTGTGCTTGAAACCAATAAATTGTAGGTCTGAGTTTGGAAATGTTTTGTGTCCTTTAG TTCCTTAAATTGAGGGGAGCCTTGGTGCAACGGTAAGGTTGCTTGCTTTGTGACCTGGAGCTCATGGGCTCAAACCCTGGAAAAACTTTTTCGCTGGTGA GGTTAAGGGTCCATACACGGTATATCTACCCTTCCCAGACCTTATTAGATAGGAGTCTCATTCATTGGGCCTCACCTTTCTTTGATTTATTGAAATTAAC TGGATGGAGATCTGTTTAATCATGTCTTTCTATAGTGAGCTATGTGAATCAAATGACGAAAATCTTGCCTTTAGAAAAGCCATTTAAATCTAAGTCCTTT TAAACAGTTTCACATACAGTCTTTCTTGGTTTCCCACTATCTCTAACTATTGGGATATTAAATATATTACATAGCCTTCTTATACTTGTGTTGTGCCACA GGATAAAGCTTCCATTGTTGTAAAATACATTATGCAGCATGTTATTTCTTGTAACTTCTAGACGCCCTTTATTATGGTAGAAACATCAATGCAAGTTCTC CTAATTTTGCATATTTTTTATGCCAGTGGTATGTACTACATTTGTAACCTTTGTAATGTTAGGGTGCAATTTTTTATTGATGCAATAAAACATTCCATTC TCAAAAAGCAATTGCTATTATGTCTTGAATTTTAGTCTCTGTAAACAGCTCTGACACTGTACATACCTCATAAATGTTTAGTCATCTACCGTTTCTGCAA GTGTTCCTGACTTCCTTCTTTCAGCTCTCTTTTCCCTTCAAATTTTCCATGTTTTGCTATATCACCTGGAGTGATTTAGATAATCAAAATTTGAAAAATC AAGGCAGGGACTCCGCGAGTATGGAGAGATAACTTACAAATGCTGCATTCACAGTTTTTTCAGGATTGGCTCCATAATTCTCGCCCTTCATGATGCAAGT GATGTATTCATGGAAGCTGCCAAGGTTTTCAAATATTCTGGAAGAGAGTTTGGTGCAAGCTTGTGTTTTGGATTCTTTGCAGTTTCATGGCTCCTACTGC GGCTAATTTTCTTTCCTTTTTGGGTTATTAGAGCAACAAGCACTGATCTTCTGAAGTGTTTAAACCTATCAGAGACTTTTCCTATGTTCCTTTACTATAC CTTTAATACATTGCTCATAATGCTGCTGATCTTCCACATATACTGGTGGATGCTCATATGTGCCATGATCAATAGACAGCTGAAAAATAGGGGAAAAGTT GGTGAAGATATTAGATCAGATTCAGATGATGATTGAACAGGTGAAGGATTTTGTTGTGTTTTCTTTGTTGTGGGTGGTTAGTGGTAGCACTGCAGATACT GCAGATTTCTAGGTGTTCAATTTGGTTAATACACCAAATTGAGGGAGGATGAATTTCGCTAGTTTCAAAATTTTCATTCATTACCTAGTAGAAAGGAAGG TGTATTTTTGCTGTATAAATGTTAGGCATACTTGTATAATTGTATTT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_171782; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_455588
Blastp | LAG1 longevity assurance homolog 2 from Arabidopsis with 71.3% of identity |
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Blastx | LAG1 longevity assurance homolog 2 from Arabidopsis with 74.8% of identity |
Eggnog | ceramide synthase(COG5058) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G19260) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019445784.1) |
Pfam | TLC domain (PF03798.15) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |