| Id Trinity | TRINITY_DN49733_c1_g1_i5 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_455592 |
| Sequence | AGCTAATTGAAGCTCATAATTGAAGTATGGATTCAATTTGGAGTAACGATGACAAACCAGACGCTTGGCATTACTCTCTGGCGATCTATTTTGCTTTTGC ATGTTTCTTTCTTAGATTCATACTTGACAGATTCGTCTTTCGTGTAAGATTTTTTGTTTTCATAACAATTTGCTTCTTTAACATTCCATTGGATTCTTTT AAATAGCAGCATGTAAAAAAGTCATTTTATTAGTTCAAGGATCTTTAAGTTTCTGTGATTATGGTCTAAGTTTACATATGCTTTCAAATAAGAATGTGCA TTATTATAACCACATGTTATTAATTGTATTAATTTTGGTGATGCCTCAACTAATTTAATTTGATTCATTTAGGAAAATAGTGTAATTCAATAATGCTCTT AATCCCAAGTTGATTATGAGTTGTGTCTTTTGCTCATTATACATGTATCATTTGTTAATTCTTCTTGGGAATGATTAATGACTAATTTGTTCTATTGTTT CATCTTCTGTTAGCTTTAGCAGCAACCTTGCAATTTTGTGTTTTTGTAGACCTTAGTTTCTAATATTACCAATGGAACAAGGGGAAGCAAAACCAAGTCA TAATTATTTGTTGAGGATTTTAGAAGAACAGTATATCCCTATTCGCTAAAGTGTAAATCCTACATTGGTTTGAGTATATGAGGTTTGGACGATGAAGGGA AAAGTACTTTAGATCTTAATGTTCTGCTATGGTTGGAAGAGGTATTGTAACAAATATGAAGGGAGCTGTTTGCTGAAATTGATTGGAATGAAATGCTGGA GTCTTGTTTGGTGTCTTTCATGAATAGTGGGTTAGCCCCATGGACTTACAAAAAGTTCCTGGGTATCAACTATCAATTACAGGGGATTTGACTCTAGCAA AGATGCTAAGAAGCTTTGGCATTGTGCTCACTCTGTGGTTCGTTGGTGCATTTGGTCTGAAATGAAATCTAGAACATTTCTAGGTCACTGGGTCTCTCTC ATGGGCTAAGTGAATCAGTTTAGGGTGCAACTGTGGACAGATAACCTTATCAAAATATGGTTGGGAAGTTAATCCATTTTTCTCATACCAGGCTATACAT AGCTTTATGTGGTAGGGTGGTAAGTCAGTTCATGCATTATCCTAAAGAAACTCACCATTTAGCTTTTCACAATTCTCAGCATTCTGTACTACTTGAAAGG AACTCCTAGGAAAGTAATTCTATTTACAAGAGGGAACGGGGTGACTTTTGGAGGCCATATAAAACGCCGACTAGGCTGGATTAGTAGACGAGAGAAGATC CACCTCCAGACACTGCATGTTTCTGGAAACTTGGTAACTTGGAGGAGCGGAAAACAAAATGTTGTTGCAAGGTCAGCAGAATTACAAGCTATGGCCTTAA GGATCTCTGAACTTCTAGGGCTGAAAATAGTTCTAGAAGACCTTTGGAACTGTGCTGTGATAGTCAGCACTCAGCAATAAACATTGCACATAATCAGGTG CAACACAATAGGGCCAAACACGTTGAAGTAGGAAGATACTTCAAAAAGGATGAGTTGGATAATGGGACAGTTCGAACTCCAACTTGAGGTGGAGTGTCAG AATCCCTCTATAAAGAATCTTTCTTTGTATAGGAGAGGACTGCGGGAACAATTTTGAGTAGCAGTTTAGGAGTTCCCTAGTTTAGATTGTCTGGTATTCT ATTTAAGAGCACGCTCTTCCTAACGAAATTAACAGAAAAATATTTTCTGGCAATTATATTATTGACTTCATTTAATTAGAATATTAATGCCATTTCTCTA GCAGATTCCGAATCATTAAATATTTTTTGTGGCTTACAGAGGTTGGCCATCAGAATGTTGATAAAGGGTAAGACTGCGCCAAGGATTACTAAGGAAATGC AAGTAAAGATTGGAAAATGCTCAGAGTCAATGTGGAAGCTAACATATTATGCTACAGTTGAATTATTCATTCTTAAAATCATCTACCCTGAACCATGGTT CAGTAATACGAAATTATACTTCGAAGACTGGCCAAATCATGAGTTGAAGAGTCCCTTAAAGATTTACTACATGTGCGAATGTGGGTTCTACATCTATAGC ATTGCTGCTATTCTCACATGGGAGACTCGAAGGAAAGATTTCGGAGTGATGTTTTCTCACCATGTAATTACAGTTTTCCTGATTGGGATCTCATATCTAA CTAGGTATTCTCTTAGCCCTATTTTTAATTGATAAATATATCATGCCAGAAACCTAAATTTGAAACTTAATTACTTATTGCTTTACATGAGCATGAAAAT CTCATGTGCTGGCTCATATTCGATGCTCATTACTGATAACACAATTGAAATCAGTTTAGAATGTTTTTAACTTTTTATATCTGTTATAAAATTTAGGACA GGAATAATATTGTCTCCTAAGTAATATGCATAATGGTAATCATTGTGCTTGAAACCAATAAATTGTAGGTCTGAGTTTGGAAATGTTTTGTGTCCTTTAG TTCCTTAAATTGAGGGGAGCCTTGGTGCAACGGTAAGGTTGCTTGCTTTGTGACCTGGAGCTCATGGGCTCAAACCCTGGAAAAACTTTTTCGCTGGTGA GGTTAAGGGTCCATACACGGTATATCTACCCTTCCCAGACCTTATTAGATAGGAGTCTCATTCATTGGGCCTCACCTTTCTTTGATTTATTGAAATTAAC TGGATGGAGATCTGTTTAATCATGTCTTTCTATAGTGAGCTATGTGAATCAAATGACGAAAATCTTGCCTTTAGAAAAGCCATTTAAATCTAAGTCCTTT TAAACAGTTTCACATACAGTCTTTCTTGGTTTCCCACTATCTCTAACTATTGGGATATTAAATATATTACATAGCCTTCTTATACTTGTGTTGTGCCACA GGATAAAGCTTCCATTGTTGTAAAATACATTATGCAGCATGTTATTTCTTGTAACTTCTAGACGCCCTTTATTATGGTAGAAACATCAATGCAAGTTCTC CTAATTTTGCATATTTTTTATGCCAGTGGTATGTACTACATTTGTAACCTTTGTAATGTTAGGGTGCAATTTTTTATTGATGCAATAAAACATTCCATTC TCAAAAAGCAATTGCTATTATGTCTTGAATTTTAGTCTCTGTAAACAGCTCTGACACTGTACATACCTCATAAATGTTTAGTCATCTACCGTTTCTGCAA GTGTTCCTGACTTCCTTCTTTCAGCTCTCTTTTCCCTTCAAATTTTCCATGTTTTGCTATATCACCTGGAGTGATTTAGATAATCAAAATTTGAAAAATC AAGGCAGGGACTCCGCGAGTATGGAGAGATAACTTACAAATGCTGCATTCACAGTTTTTTCAGGATTGGCTCCATAATTCTCGCCCTTCATGATGCAAGT GATGTATTCATGGAAGCTGCCAAGGTTTTCAAATATTCTGGAAGAGAGTTTGGTGCAAGTGTGTGTTTTGGATTCTTTGCAGTTTCATGGCTCGTACTGC GGCTAATTTTCTTCCCTTTTTGGGTTATTAGAGCAACAAGCATTGATCTTCAGAAGTGTTTAAACCTAGCTGAGACTTTTCCTATGTTCCTTTACTATAC CTTTAATACATTGCTCATAATGCTGCTGATCTTCCACATATACTGGTGGATGCTCATATGTGCCATGATCAATAGACAGCTGAAAAATAGGGGAAAAGTT GGTGAAGATATTAGATCAGGTAAGTAAATTTCACTAATATACTTTTATTCTGGAACCAGTCCATTGTCAGGATATTTTCCGCTAATGTATGCAATGAAAT CATAAATGAATAGTTTATGAAAAAATCTAAAATATTGCCTGAAGCACACGGTCAAAGAAGAGTTGCTTTTGTGTACAATGTTCAGAATTCCTGAATCTCG AGGGAGGTTAATAGTAGCCTCTTTACTCAAAATTAAATTGGTCAGACCTTAGAATCCAGGGCAATTGTTTTATTGTAGATATATACTATTTGTCTATTTG ATCAAGGAACAGGTTTAGGAAACCTAATGTACTATTTGTCTATTTGATCAAGGAGCAGGTTTAGGAAACCTAATGTAAGCCATGCTTATGATTATTCTAC TCTGAATCAATATGCATTGGTTTAATTAAATCATGATACTTAATCTCTTGCTGCTACTTTTTAGTAGCATGATTCCTATCACAACTGTATCTAGTTTGTG CACCACATAGTTTCCAGCATCTACATATCTTTACTTTTATTATTGCCTTGGGTAAATATGTGCTTTATTTACTGTGAAAGGTCTCTCTTTGCAGATTCAG ATGATGATTGAACAGGTGAAGGATTTTGTTGTGTTTTCTTTGTTGTGGGTGGTTAGTGGTAGCACTGCAGATACTGCAGATTTCTAGGTGTTCAATTTGG TTAATACACCAAATTGAGGGAGGATGAATTTCGCTAGTTTCAAAATTTTCATTCATTACCTAGTAGAAAGGAAGGTGTATTTTTGCTGTATAAATGTTAG GCATACTTGTATAATTGTATTTTTTGCAAATTCTGAGAAAATAATTTCTACACAGTGATTCCAGTTCTTAGGTGGCGCTAATGGGCAAATATAAGCTGTA CTGTAAGCAGTGCAATTCTCCAA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_171782; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_455592
| Blastp | LAG1 longevity assurance homolog 2 from Arabidopsis with 69.52% of identity |
|---|---|
| Blastx | LAG1 longevity assurance homolog 2 from Arabidopsis with 73.39% of identity |
| Eggnog | ceramide synthase(COG5058) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT3G19260) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019421413.1) |
| Pfam | TLC domain (PF03798.15) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |