Ll_transcript_455393

• Id Trinity: TRINITY_DN49749_c1_g1_i12
• Name Transcript: Ll_transcript_455393
• Sequence: TTTTGTTGGCAATGTATGAATCATTCTATTTTTGTCATGTTATATGTTTGTGTGATTTTTTACGTCCTTATATTTTTTACTTTCATTTAGAGTTTTTGTA TAAAGAGGGAGAGCTTCGGCGCAACGGTAAGGTGACTTACCTTGTGACTTGGAGGTCATTGGTTCAAATCCTTGAAACAACCTCTTTACCTATGAGGGTA AAGTTGCTTACATATATCCTCTCCAGACCCCACTAGTGGGAGCCTCTTGCATGGGGCTGTCATTTTTAGAGTATGTGTATACTGTTGAGACTCGAGAGTC CTCTGTACAGATTTTCTTATCTTTGTGTTTGCTTATTCTATGTTGGAAGTTAGAAGAGATATTTTAAAATTTTGGGATATCTTTGTCCTTTCCATGTACT CTTCTCTGACTGTCTCACTGCCTCTCCGCTTGCTGGGTCAAGGCCATGTACCTAGATCCCACCTGGTAGAAGCCTCATGCATCGGACCACCCCTTTTTTG TGGCACTGCCCTTTATTTCACTTTTGGTAATTATGAAAATTGAAACTTCTTGCAGTTGTTTTTCACCATGGACAAAGTTGTTCTCAGTAAGGCCATCTGT TCATTGGCTATATTCATCGTCTATGGATTTGGCCTAGTCTTGAAGCATGCAATAATTCTATTAATTGGTTTCAATGAACTTTGGTTGAGTGGATTGAGCT TAATTATATAAGTTCATTTTTGTATTGGACCCCCTTATTATAATATATTTGAAACTGTATGCGTTCTGGAGTGAATACTGCTATTCTTCGGAGACAGGCT TTGACGACATGTCTCACTATGATCACAGGGTTATTCTTATTTCCCAGATTGCATATTAACACTGGGATGCTTTACATTGTATTTTGTCAGTGGGCCAATG TAACTGGCATTTTTTAGCTTGTACTAGAGGGGGAAGAGAACATTTGTTGTTGTGCTTTTGAATTATAACATGATATAAAAAAATAGTGTCAAAAGACTGA GGAGAAAAAGTATGAAGGTCTCTGAAAAGAAAAAGAAACGAGAAAACATTTTACAAAAGAAAAAATAGAATGAAGTTGAAAAAGAAAAAAGAAAGAGAGA AAAGTGACAAAAGAAAAAGGAAAAATAGAGTATGTTGAGGAAACTGTGAAAGGCATCCTTTGGCGATGGTTGAATCTGGTACAGCTGAAGGTGGAATGTG TTAAAGATGCTTCAACTTCACTACTGGAGGTGACAGCTTGTGGTTTCTTTTGGAAGAACATTCTGTAAGTGTGGGGAACACAATCTTAGTGATAGATCCC TTTTGTTGATTGCAATGAGGTCTGTGGTGTCTCCGTTTTCATTTAGCTGTTCCATGTCTTTCTTATTAATTAAACATTGCTTTGATTAATGTCTCAAACA ACATAGGTATTGTGTGGCCTTGCTCCTTGGGGTAATTTGTAGACTATAAAAGGTTGTTGCTGTTTTAAATTGGCACAAGGAGGAAACTAAAGTAGAATGC ACAAGAAGGTTTCTTTAGGGTTTGAGGAGCCTGTAAAATGACACTAAATGTTACGACTGTTATAAGCAAACTTTTTTTGATGTGCTGGATTCTTTAGGTT TGTTATGTATTTGGGATTTGGGATCAGAGCTGGTTGTTTACGTAGTTAAAAAAAGTGTTGGGTTTCTTCTGATGTTTGAGGAGTTGGAAACTACAAATTT ATGTTGATTAGGAAAAAAGAAAAGTCATTCTCTAATTTTTGAGTTCTAAAAGTATTGGTGTGCATTGGTATCTTAAGAATAGAATAAAAATTAGAGTCTG TTTGATTTATTGGGTAGAATGGTTATGTCGTGTTATGTTCAGATTTCTGAGGTCTTCCCCTTTTAGAGACAAAAAGCAGTATGTATTATATTGAAGGAAA AGAGAACTTGTGCTCTGGAATTTTGTAAAAAATACCCTGAGCGATCTATAAGATTCCCCATCTAATGCTTTTACGTTAAGTCGTTAATAAGCTTTTACAA TTTTTTATTTTTTCGAATGGTTGTTTCTGAAGATATTTGGTTAATATGATAAAATAATATTTACCAGAACAAGAGTCTTGAATATGTATGTGATATAAAG TGATGTAGTTCTATAGTCTAGTTTGTTTGTATATGTAATAACCAAATCTTATCTGAGCACCTTCTGGATTATCATGATTGTTGCTTATCATCGGCATCAA GATCCGTTCAATTGATTTGTTGTACAGGTTGATTATGCATGCACACCAGAAGAAGTGCAGCAACACTTTCAATCTTGTGGTACAGTGAACAGAGTCACCA TCCTGACTGACAATTTTGGCCAGCCTAAAGGTTTTGCTTATGTGGAATTTGTTGAAGTTGAAGCTGTTCAAGAGGCTCTTCTCTTGAATGAATCTGAATT ACATGGCCGTCAATTGAAGGTTTTACCCAAGAGAACTAATGTTCCAGGAATGAAACAATATCGTCCTAGGCGCTACAATCCTTACATGGCATATGGCTTC AGGAGACCATATCCTCATCCTCACTTTTACTCCCCTTATGGATATGGGAAGGCTCCTAGGTTTACTAGGGCAACTCGGTACATGCCCTATTACTAAAAGT TTGCATGGAAGGGTGTTGAAGATATGATGGTGGGTGCATCATGCAGCAATATTGACAATATTTTCTGTTTATTCCTCAGTTCTTGGAAGATGGTTTACAA TTGCCGTTGAATACTATGTTAGTGACTATAATTTGTACTTGTGCTTATTATGCTTACACATTAAATTAGTGGATAAAATCAGAGTTATAATCCTGCAAGG TGAGTCATTATAGTTTAATGTTTATACTTGACCAAAGATGTATGCTGCAGAGAGCAGTGAACTAATCTGTCCTCTTTTCCTAGACAGTGCAATGAAAGAT GTTAGTTTTGAT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_171890;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_455393

FPKM

• PAB: 0.9
• PNAB: 0.8
• PS1: 0.8
• PS2: 0.2
• PS3: 0.5
• PW1: 1.2
• PW2: 1.6
• PW3: 1.7

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_455393

• Blastp: -
• Blastx: Polyadenylate-binding protein 2 from Arabidopsis with 83.2% of identity
• Eggnog: Polyadenylate-binding protein(ENOG4111PFV)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G65260)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_020233274.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;