| Id Trinity | TRINITY_DN49749_c1_g1_i14 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_455395 |
| Sequence | AAGAGATTGGCTCTGTTCAAGGTTCAATTTCTGTTTATTCTTTTATTAATAATCCAAGCCTGATTAATTAACCTTTAATTTTCTAACCATAGTTTAGAAT TCTTATTACGTTATTGACCTAATTTTGTTGTTGTTTTGGATTGTGAAATTATGCTGTGGTGATAAGGTGAAGCTGTTTATCTAGAACTTTATACCCTGCA TAGAATTGGAACTTTCAAGATCCTATCGTATAATTCTTGATTGCACCAATGTAGTTAATCTGAACTAAATTCTTCTCTAGAGTTTTCTACATTACCTCTC TAGGTATCTAATCCTTGATTGCTTATTCAAATGTTTTGGAAGAGTAACATTCTAAGTTAGCTATCATTCATCCGTAACTGGCATATCCACATTCCATGGG GCTAATAAATCACTAGAATAATATATTGCAATGTTGTGAAATTTCATGAATTTGGATTCTGACCATCTAGAATCATCCCTGATAATCAAAGCCCAACCTA ACAAGCAACCGTAAGTGATTTTTTTTTTCAAAATAAAGAAGTACTTTTTCAAAGGGAAAAATCAAACAAAAGGTCCATTACTATGATTTATATCCTCTCC AGTAGTGGTTGCATGTTTTTGACAAAACAAGATATTGAATGTATCATGTTGAAATATGTTATTATCTGTACTGTTTATTTACCAAATCACCTTACTACTA TTTAATAAGAAAACTGGTTTTACATTGTTATCATTACCTTTTAAACTTCCTTATTGAACCTCTTTTGTAGATCCTGCTGCTGCTGCTTCTCTGGCAAACA AGGAGGAGGCAGATACTCGATCTGTTTTTGTTGGCAATGTATGAATTACCCTATCCCATGTCATTTTGTTGTATGACTCGTTTGATTTTTTATGTCCTTA TGTTTTACTTTGATTAAAAGTGTTTGTATACAATTGAGAGCCCTAAGTATATATTTTCTTATCTCTGTTTTGCCTATGCTATGTTGGAAGTCAGAAGGAA ATATTTGAAGTTTTGGGGGATGTCTTATAAAACTCTTGGCAAACCTCCCTTTGTATCCTTCAATGTCTGCCTCTCTGCTTGGGTGGTTAAGCACATATAT AAACCCTTCCTAGACCCCATGTGGTAGAAGCTTTTGTGCATTGGCTTGGGTCACCCCTTTTTGTCACACTACTCTTTATTTGACATTTGATAATTGAGTA ATTCAGAAATTTGAAACTTCTTGAACTTGTTTATGACCTAGGGCAGACTTGTTCTCAATAAGGCTATCTGTTCATTTGCTATCTCCATTGTCTATTGATT TGGCCTGATTTTGAAGCATGTGATAATTTTATTCATTGGTTTCAATAAACTTCATGTTTGTATTGCATCCTCTTATTATAAAATATTTGAAGCTGTACAT GTTCTATTCTGGAGTGAATACTGCTAGTCTTCGGAGATAGGGTTTGACTTTATGTCTCACTATGATCGCAGGGTTACTCTTATTACCCAGGTTGCATAAT TAGCGCTGGGATGCTTTCATTGAATTTTGTGGGTGGGCCAATGTAATTGGTGTTTTTTAATTCTACTAGAGGGGAAGGAGAACATGTATTGTTGTGCTTT TGAATTTTATTATGATATAAAAAAATTAGAATGTCAAAAGATTGAGGAGAAAAAACATGGAAGTCTCCAAAAAGAAAAAAAGAAAAACAAATGAGAAAAT ATTTTACAAAAGGAAAAACAGAATGAAGTTGAAAAAGAAAAGAAAAAAAGAGAGAAAGAAATGACAAAAGAAAAAGGAAAATATAGAATATGTTGAGGAA ACTGTGAAAGTCGTCTCTTGGGGATGGTTGAAACTGGTACAGCTGGTGGTAGAGTGTGTTAAAGATGCTTCAACTTCACTACTGCAAGAAACAGCATGTG GGTTCTTTTGGAAGAACATTCTGTAAGTGTTGGGAACACAATCTTAGTGACCCATTTTGTTGATTGCAATGAGGTCTATGGTGCCTCCGTTGTGTGTCAT TTAGCTTTTCTAAGTCTTTTTTTATCAATTGAACATTGTTTTAATTAATGGCCGACAAATTAGGTGCTACAGTTTTGCTCCTTTGGGGTAACTTGTAGAC TATAAGCCTAATTAGAATGCATGAGAAAGTTTCTTTGTAGTTTGAGGAGCTGGTAAAATGGCAATAAATGTTAAGACTGTTAAAAGCAAACTTTTTTTGA TGGGGTGGATTGATTGGTTTAGTTATGCGTTTGGGATCTGGGATATCATATGTTTTGATCAGAGTTGGTGGTTTTTGTAGTAATAAAAATGTTGGTTTCA TATGATGTTCGAGGAGTTGGGAAACCACAAATTTCTGTTCATTTATTGGGTGGAATGGTTATGTTCAGAATTCTGAGGTGTCTAATTCCCTGTATTGGAT GGGGTCCGTTTTAGAGACTGAAGTATTAATTTAATATATAGTTGAAGGAAAAGAGAAATTGTGCTCTGGAATTTTGTAAAAATTGTCCGAAATGATTATG CAATTCCCCATTTAATACGTCATGAGCATGTGGTGCACTTTAAGTTAATAAGCTTTTACATTTTAATTTTTTGATTGTTTATATCTGATGATATTGGGTT AATATTATAAAATGATATTTACCAGTGCAAGAGTCTTGTATATGCATGATGTGATCTATACTGTTGTAGTTCTGGAGTCTAGTTTGTCTTTATAAAATAA TAACTAAATCATATCTGAGCACCTGCTGGATTAAACATGATATGTTGATCATCATTGGCATCAAAATCCCTTTCATTGGTTCGTTGTACAGGTTGATTAT GCATGTACACCAGAAGAAGTGCAGCAACACTTTCAATCTTGTGGTACAGTGAACAGAGTCACCATTCTGACAGACAAGTTTGGCCAGCCTAAAGGTTTTG CTTATGTGGAGTTTGTTGAAGTTGAAGCTGTTCAAGAGGCTCTCCTCTTGAATGAAACTGAATTGCATGGCCGTCAATTGAAGGTTTTACCCAAGAGAAC TAATGTGCCTGGAATGAAACAATATCGTCCTGGCCGCTACAATCCATACATGGCTTATGGCTTCAGGAGGCCACATCCTCCTCCATACTTTTACCCCTCT TATGGATATGGGAAGGCTCCTAGGTTTACTAGGGCAACTCGGTACATGCCCTATTACTAGAAGTTTGCATGGAATGGTGTTGAAGATATGATGGTCGGTG CATCCTGGACCTGGAGCAATGATTTTTTTGATCTGGGAGCATTGGGTGACATCTACATTGCATACCTTTGATTATTGCCCATGTATCTTCGGCTATAATA GGTGTTGTATGTTTATTTCTTAGTTCTTGAAAGATGATTTACAATTGCCATTGGATATCATGTTAGTGACTGCAATCTGTACTGCGGCTACTATGGTTTA CACATTTAAATTAGTGAATTAAGTCAGAGTTATAATACTGCAAGATGAGTCTTTATAGTTTATACTTGACCTCAGATGTATGTTGTAGACTGCTGTAAAC TCATCTGTCCTCTGTCCCTCTTCTGACATGAAAACATATTCATATCTATGTTTTTTGAAATTAATATGCCTGAATCTGATCTGAGTTTAAATGGAGTTTT GGTTTTGTGGGCTTTGATGTATGACATGTTAGTCTTTTGATAGTTTCTATCCTCATTCCTCATCTGTAATCCCTTTTCTGTTATAAGTTTTTATCCTCAT TCCCCATCTTTTAGCCCTTGATTGGAGCAAGGAAGTATATGATTACTTGTTGGAGCTGGCCTTGGATTAAAAAAAAGGGGCATAATGTCCTTTTTTGAAG AATCACTATGTCATTTCTATTGTGGCTTTCTTGGTCATTCCATTTCCTTTCTGGAATCTCTGTACCCCATTGTCTGTCTTTTGAATAATAGATGCCAGTT ATTCTCCTATTGTTTTGAACACAACGTGGCACTGGCCCTGGCACATGCGTCCTCTGCTTTCCCACTTCAGTTATGATTAAATTTGATGGTATCTTGGCTA CCCACATGTGCATCGCTGGCAGTACCAAAGTGGATGAAATGTTGACAACAATTTGAGATCGGGGGTCTATGACCTGACATTTGATCATGGTGTCACCAAT CCTAGCTTGTGCCATAAATGTCTTGGGGGCATAAAGAAAGGTGTGTATTTGTGGAACAAATCATAATTTGTGCCAACATGGCATTAGTTTGTCTATTTGG CCATTAGTTGACTCCTGGTTTTCCTTTGACCAGTAGCTTTTGACAATAATTGTGACACTTTTTAATGGTATGTAAAAAATAATACAAGTTACCTCTAATG TCCCC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_171890; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_455395
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Polyadenylate-binding protein 2 from Arabidopsis with 81.6% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019463812.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |