Ll_transcript_455385

• Id Trinity: TRINITY_DN49749_c1_g1_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_455385
• Sequence: AAAAAAAAAAATTATTTGTTTTTAAAATTGATAAAATTGTTATTTTTTGTGTGCGTTTCGTTTTTTTTTTTTTTAGGGTGGTTACACACAAATAATTTAT ATATTAAACCATACCAAATAGGAGAAATTTCTTTAAAATAATAAAAATAAAAATCATTGGACATAAATACCCTACGTCCCGCATGTCGGAACCTTCTTGA AGGAAGCTTTGTTGTTGGTTGAGTTGAAGAGAAGAGAATATGGATGACGAAGAACACGAAGTGTACGGAGGAGAGATCCCTGACGTTGAAGGAGATCATG ACAACCCTGACGTTGACATGTCCGCCGCCGATGATGACGCCGCCGCCGTGAAGGAGCTTGACGAGATGAAGCGCCGGTTGAAGGAGATGGAGGAGGAAGC CGCCGCTCTCCGCGAGATGCAAGCTAAGGTCGAGAAAGGAATTGGCTCTGTTCAAGATCCTGCTGCTGCTGCTTCTTCTCAGGCAAACAAGGAGGAGTCA GATACTCGATCTGTTTTTGTTGGCAATTTGTTTTTCACCATGGACAAAGTTGTTCTCAGTAAGGCCATCTGTTCATTGGCTATATTCATCGTCTATGGAT TTGGCCTAGTCTTGAAGCATGCAATAATTCTATTAATTGGTTTCAATGAACTTTGGTTGAGTGGATTGAGCTTAATTATATAAGTTCATTTTTGTATTGG ACCCCCTTATTATAATATATTTGAAACTGTATGCGTTCTGGAGTGAATACTGCTATTCTTCGGAGACAGGCTTTGACGACATGTCTCACTATGATCACAG GGTTATTCTTATTTCCCAGATTGCATATTAACACTGGGATGCTTTACATTGTATTTTGTCAGTGGGCCAATGTAACTGGCATTTTTTAGCTTGTACTAGA GGGGGAAGAGAACATTTGTTGTTGTGCTTTTGAATTATAACATGATATAAAAAAATAGTGTCAAAAGACTGAGGAGAAAAAGTATGAAGGTCTCTGAAAA GAAAAAGAAACGAGAAAACATTTTACAAAAGAAAAAATAGAATGAAGTTGAAAAAGAAAAAAGAAAGAGAGAAAAGTGACAAAAGAAAAAGGAAAAATAG AGTATGTTGAGGAAACTGTGAAAGGCATCCTTTGGCGATGGTTGAATCTGGTACAGCTGAAGGTGGAATGTGTTAAAGATGCTTCAACTTCACTACTGGA GGTGACAGCTTGTGGTTTCTTTTGGAAGAACATTCTGTAAGTGTGGGGAACACAATCTTAGTGATAGATCCCTTTTGTTGATTGCAATGAGGTCTGTGGT GTCTCCGTTTTCATTTAGCTGTTCCATGTCTTTCTTATTAATTAAACATTGCTTTGATTAATGTCTCAAACAACATAGGTATTGTGTGGCCTTGCTCCTT GGGGTAATTTGTAGACTATAAAAGGTTGTTGCTGTTTTAAATTGGCACAAGGAGGAAACTAAAGTAGAATGCACAAGAAGGTTTCTTTAGGGTTTGAGGA GCCTGTAAAATGACACTAAATGTTACGACTGTTATAAGCAAACTTTTTTTGATGTGCTGGATTCTTTAGGTTTGTTATGTATTTGGGATTTGGGATCAGA GCTGGTTGTTTACGTAGTTAAAAAAAGTGTTGGGTTTCTTCTGATGTTTGAGGAGTTGGAAACTACAAATTTATGTTGATTAGGAAAAAAGAAAAGTCAT TCTCTAATTTTTGAGTTCTAAAAGTATTGGTGTGCATTGGTATCTTAAGAATAGAATAAAAATTAGAGTCTGTTTGATTTATTGGGTAGAATGGTTATGT CGTGTTATGTTCAGATTTCTGAGGTCTTCCCCTTTTAGAGACAAAAAGCAGTATGTATTATATTGAAGGAAAAGAGAACTTGTGCTCTGGAATTTTGTAA AAAATACCCTGAGCGATCTATAAGATTCCCCATCTAATGCTTTTACGTTAAGTCGTTAATAAGCTTTTACAATTTTTTATTTTTTCGAATGGTTGTTTCT GAAGATATTTGGTTAATATGATAAAATAATATTTACCAGAACAAGAGTCTTGAATATGTATGTGATATAAAGTGATGTAGTTCTATAGTCTAGTTTGTTT GTATATGTAATAACCAAATCTTATCTGAGCACCTTCTGGATTATCATGATTGTTGCTTATCATCGGCATCAAGATCCGTTCAATTGATTTGTTGTACAGG TTGATTATGCATGCACACCAGAAGAAGTGCAGCAACACTTTCAATCTTGTGGTACAGTGAACAGAGTCACCATCCTGACTGACAATTTTGGCCAGCCTAA AGGTTTTGCTTATGTGGAATTTGTTGAAGTTGAAGCTGTTCAAGAGGCTCTTCTCTTGAATGAATCTGAATTACATGGCCGTCAATTGAAGGTTTTACCC AAGAGAACTAATGTTCCAGGAATGAAACAATATCGTCCTAGGCGCTACAATCCTTACATGGCATATGGCTTCAGGAGACCATATCCTCATCCTCACTTTT ACTCCCCTTATGGATATGGGAAGGCTCCTAGGTTTACTAGGGCAACTCGGTACATGCCCTATTACTAAAAGTTTGCATGGAAGGGTGTTGAAGATATGAT GGTGGGTGCATCATGCAGCAATATTGACAATATTTTCTGTTTATTCCTCAGTTCTTGGAAGATGGTTTACAATTGCCGTTGAATACTATGTTAGTGACTA TAATTTGTACTTGTGCTTATTATGCTTACACATTAAATTAGTGGATAAAATCAGAGTTATAATCCTGCAAGGTGAGTCATTATAGTTTAATGTTTATACT TGACCAAAGATGTATGCTGCAGAGAGCAGTGAACTAATCTGTCCTCTTTTCCTAGACAGTGCAATGAAAGATGTTAGTTTTGAT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_171890;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_455385

FPKM

• PAB: 2.4
• PNAB: 2.7
• PS1: 3.8
• PS2: 1.6
• PS3: 2.2
• PW1: 3.1
• PW2: 2.3
• PW3: 0.8

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_455385

• Blastp: Polyadenylate-binding protein 3 from Arabidopsis with 65.22% of identity
• Blastx: Polyadenylate-binding protein 2 from Arabidopsis with 83.2% of identity
• Eggnog: Polyadenylate-binding protein(ENOG4111PFV)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G10350)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_020233274.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;