Id Trinity | TRINITY_DN49758_c4_g2_i4 |
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Name Transcript | Ll_transcript_453544 |
Sequence | CTTCTTTTTCCCTTCAAAATGCAAAATACTTTCTTATCATAGAAACCAGATTCGCTGGTTTAGTTGGAGAACTGTGTATCAGTTTGCCAGTACCGATTCA CGGTACTTTTGCGACCCAATACGCCTTGGTTCTCGTATTGGTACTTAGATTCAAGTGAACCACCATTAAAGATGTCATTTTCTTCATCCATGAACTTCAA ACCGTCCCATGTCTAATGATACAAAATCACCAACTGAATACCAAGGGAATACCAACGAGAATAACGCCAATAGAGAAAAAAAAAACAGAGAAAGAGAAGA GAAAAGATGAGCAGTAACCATGGAGAAGAATATGATAGGGGGAGGATAAAGATTAGGGTTTGAATGAAGTTGAGTTTTGATACTATCATACTACTGGGTA TTAGAGTATTGGGCCCAAAATACTCATTACTTCTCAATTTTAATAAAATTATTTCTTTAAAAAAATCTTTGAATAATTTGTTTTACAAAATGTAATTTAA CTCATTTATTTAGTTTTCATTAATCAAAATACACTTAAGTAAAAATAACCCAAATATTAAATCATATTACATCATAAATTATCCAAATTAAATAAAAAAT TTGAAGATATATTATTAATGAATAGTCAACCATAATATAAGTATGAAAATATCGAACATATTAACTAAATATACCTATAACGTAATGATACTTTGATAGG GTAACATATCGCGTATTACGTACCTGTACCCGTACCGAAAAGAACTGTGTATTATGTGACTATGTTTCTTATTTCTTTGATATTTGATTTGATTGGAATT TCTTTTATTTGTCACTATTCCTTTAATTGAAAATACTTAAAAGGAAGAATGAAATATGTGAATTGCTTGAGTGATTTGCATGCGCTCAATCGATTCTATT 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Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_171969; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_453544
Blastp | Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 from Nicotiana with 36.71% of identity |
---|---|
Blastx | Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 from Nicotiana with 32.76% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_020218720.1) |
Pfam | Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) (PF07727.13) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |